More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_37730 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  100 
 
 
371 aa  735    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  67.3 
 
 
371 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  68.3 
 
 
384 aa  454  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  65.27 
 
 
359 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  66.18 
 
 
372 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  60.97 
 
 
360 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  58.21 
 
 
368 aa  421  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  61.8 
 
 
378 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  61.85 
 
 
359 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  58.65 
 
 
368 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  62.8 
 
 
362 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  49.36 
 
 
432 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  38.87 
 
 
481 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  39.2 
 
 
466 aa  170  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  39.2 
 
 
473 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  38.87 
 
 
473 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  38.87 
 
 
473 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  37.42 
 
 
383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  41.28 
 
 
453 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  38.54 
 
 
467 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  35.98 
 
 
468 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  38.21 
 
 
467 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  35.79 
 
 
456 aa  159  6e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  37.2 
 
 
459 aa  159  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2128  beta-lactamase  36.04 
 
 
443 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  30.69 
 
 
449 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  36.11 
 
 
472 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  32.66 
 
 
491 aa  151  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  38.13 
 
 
475 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1007  hypothetical protein  34.84 
 
 
440 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1041  hypothetical protein  34.49 
 
 
440 aa  147  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  32.43 
 
 
455 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  33.33 
 
 
378 aa  143  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  32.32 
 
 
374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.03 
 
 
468 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  30.95 
 
 
524 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  31.14 
 
 
397 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  34.11 
 
 
366 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2249  beta-lactamase  32.91 
 
 
468 aa  118  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  31.71 
 
 
459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  29.35 
 
 
522 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.97 
 
 
425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  29.73 
 
 
380 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  29.73 
 
 
380 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  33.45 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  25.5 
 
 
395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  29.39 
 
 
416 aa  109  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  29.83 
 
 
405 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  33.55 
 
 
374 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  30.04 
 
 
640 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1749  Beta-lactamase  33.45 
 
 
496 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  36.73 
 
 
483 aa  105  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  31.14 
 
 
410 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.1 
 
 
449 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.14 
 
 
405 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3570  beta-lactamase  33.33 
 
 
479 aa  103  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230187  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.59 
 
 
415 aa  103  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  29.67 
 
 
399 aa  102  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  27.22 
 
 
598 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  24.83 
 
 
305 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2093  beta-lactamase  32.99 
 
 
497 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  28.42 
 
 
363 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1816  beta-lactamase  27.81 
 
 
494 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.403938 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  25.76 
 
 
305 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  29.94 
 
 
414 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  23.89 
 
 
309 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  23.89 
 
 
309 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  29.32 
 
 
503 aa  99.8  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.75 
 
 
419 aa  99.4  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  31.14 
 
 
389 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.55 
 
 
305 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  32.87 
 
 
396 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  28.62 
 
 
401 aa  99  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  30.45 
 
 
414 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  26.67 
 
 
396 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  25.69 
 
 
505 aa  97.4  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  28.38 
 
 
389 aa  97.1  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  23.21 
 
 
305 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  22.87 
 
 
305 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  25.41 
 
 
387 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  26.39 
 
 
400 aa  93.6  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  30.59 
 
 
327 aa  93.6  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  31.72 
 
 
323 aa  92.8  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.21 
 
 
305 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  26.96 
 
 
530 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.32 
 
 
443 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  28.82 
 
 
412 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  22.37 
 
 
305 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  26.71 
 
 
390 aa  90.1  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  27.46 
 
 
383 aa  89  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  26.28 
 
 
530 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  30.2 
 
 
486 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  29.17 
 
 
505 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  23.36 
 
 
387 aa  87.8  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  22.45 
 
 
305 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  28.07 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3245  beta-lactamase  28.34 
 
 
342 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.622434 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.66 
 
 
419 aa  86.3  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  27.18 
 
 
405 aa  86.3  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.66 
 
 
419 aa  86.3  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>