263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2913 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  100 
 
 
459 aa  923    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  55.46 
 
 
472 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  55.19 
 
 
475 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  53.48 
 
 
453 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  51.7 
 
 
468 aa  466  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2128  beta-lactamase  50.11 
 
 
443 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165199  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1041  hypothetical protein  49.56 
 
 
440 aa  431  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1007  hypothetical protein  49.56 
 
 
440 aa  431  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  42.07 
 
 
466 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  39.29 
 
 
467 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  41.25 
 
 
473 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  39.92 
 
 
467 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  41.04 
 
 
473 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  41.04 
 
 
473 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  46.33 
 
 
481 aa  250  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  36.5 
 
 
456 aa  228  2e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  32.15 
 
 
491 aa  224  3e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  35.24 
 
 
455 aa  206  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  31.29 
 
 
449 aa  205  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.12 
 
 
468 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3570  beta-lactamase  32.3 
 
 
479 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230187  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  39.53 
 
 
383 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  38.64 
 
 
374 aa  178  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2249  beta-lactamase  31.22 
 
 
468 aa  176  8e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1816  beta-lactamase  32.04 
 
 
494 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.403938 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  37.2 
 
 
371 aa  158  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  29.56 
 
 
522 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  35.62 
 
 
432 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  34.23 
 
 
359 aa  153  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  33.88 
 
 
378 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1749  Beta-lactamase  33.17 
 
 
496 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  34.3 
 
 
362 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  35.71 
 
 
384 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  34.52 
 
 
368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  34.62 
 
 
371 aa  136  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2093  beta-lactamase  32.46 
 
 
497 aa  136  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  34.09 
 
 
360 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  33.44 
 
 
368 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  36.18 
 
 
378 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  36.13 
 
 
359 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  35.56 
 
 
372 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  28.99 
 
 
459 aa  120  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  30.77 
 
 
397 aa  104  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  28.97 
 
 
416 aa  100  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  30.45 
 
 
399 aa  99.4  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  25.62 
 
 
384 aa  99  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  27.27 
 
 
524 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  29.53 
 
 
400 aa  98.6  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  28.87 
 
 
401 aa  97.8  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  28.99 
 
 
412 aa  97.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  29.41 
 
 
380 aa  97.8  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  29.41 
 
 
380 aa  97.8  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  29.08 
 
 
396 aa  96.7  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  29.59 
 
 
327 aa  94.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  29.08 
 
 
413 aa  93.6  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  31.27 
 
 
414 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  30.9 
 
 
414 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.03 
 
 
415 aa  89.4  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  23.53 
 
 
640 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.55 
 
 
425 aa  89  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  25.64 
 
 
382 aa  89  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  28.83 
 
 
363 aa  88.2  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  25.59 
 
 
505 aa  87.4  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  27.31 
 
 
530 aa  87  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  24.27 
 
 
305 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.99 
 
 
405 aa  86.3  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  23.1 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  26.42 
 
 
328 aa  85.9  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  27.03 
 
 
462 aa  84.7  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  27.55 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  24.26 
 
 
530 aa  83.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  27.21 
 
 
405 aa  83.6  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  23.89 
 
 
395 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  26.67 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  26.28 
 
 
404 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  24.24 
 
 
305 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  25.49 
 
 
389 aa  81.3  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  26.23 
 
 
505 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  25.08 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  22.51 
 
 
383 aa  79.7  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  24.75 
 
 
309 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  24.75 
 
 
309 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  28.57 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  24.41 
 
 
305 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.41 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  29.11 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  27.53 
 
 
483 aa  77.8  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  24.04 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.62 
 
 
449 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  24.83 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.41 
 
 
305 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  26.6 
 
 
389 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1227  beta-lactamase  29.25 
 
 
487 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  31.25 
 
 
503 aa  72.8  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  23.79 
 
 
315 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  24.83 
 
 
315 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  24.74 
 
 
598 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  23.71 
 
 
305 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  22.3 
 
 
305 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.9 
 
 
395 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>