197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2128 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2128  beta-lactamase  100 
 
 
443 aa  899    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165199  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1041  hypothetical protein  68.81 
 
 
440 aa  610  1e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1007  hypothetical protein  68.81 
 
 
440 aa  610  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  56.32 
 
 
453 aa  518  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  50.68 
 
 
475 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  50.66 
 
 
472 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  50.8 
 
 
459 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  46.96 
 
 
468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  39.03 
 
 
466 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  38.73 
 
 
473 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  38.51 
 
 
473 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  38.51 
 
 
473 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  37.42 
 
 
467 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  37.69 
 
 
467 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  37.61 
 
 
456 aa  258  2e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  43.77 
 
 
481 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  33.81 
 
 
449 aa  239  9e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  33.7 
 
 
491 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3570  beta-lactamase  34.52 
 
 
479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230187  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  33.63 
 
 
455 aa  212  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.41 
 
 
468 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  40.28 
 
 
374 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2249  beta-lactamase  32.11 
 
 
468 aa  184  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  39.1 
 
 
383 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  35.97 
 
 
378 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1816  beta-lactamase  32.71 
 
 
494 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.403938 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  34.06 
 
 
359 aa  163  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  36.88 
 
 
371 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  35.71 
 
 
384 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  35.24 
 
 
368 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  30 
 
 
522 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  36.04 
 
 
371 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  36.91 
 
 
432 aa  154  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1749  Beta-lactamase  31.89 
 
 
496 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2093  beta-lactamase  32.27 
 
 
497 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  33.94 
 
 
360 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  33.68 
 
 
368 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  32.97 
 
 
362 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  33.69 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  29.69 
 
 
459 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  33.69 
 
 
359 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  35.46 
 
 
372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  29.93 
 
 
399 aa  100  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  27.76 
 
 
413 aa  100  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  27.44 
 
 
384 aa  99.4  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  26.95 
 
 
382 aa  96.7  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  27.67 
 
 
396 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  27.65 
 
 
366 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  28.76 
 
 
412 aa  92.8  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  28.23 
 
 
404 aa  90.5  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  29.6 
 
 
397 aa  89.7  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  28.22 
 
 
380 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  28.22 
 
 
380 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.54 
 
 
415 aa  87.4  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  30.41 
 
 
414 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  27.18 
 
 
328 aa  87.4  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  26.12 
 
 
416 aa  87.4  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.53 
 
 
395 aa  85.9  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  24.83 
 
 
389 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  26.92 
 
 
389 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.4 
 
 
425 aa  86.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  23.83 
 
 
383 aa  85.5  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  27.21 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  29.39 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  26.1 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  25.17 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  25.74 
 
 
363 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  24.09 
 
 
405 aa  81.3  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  27.46 
 
 
483 aa  80.9  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26 
 
 
467 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.77 
 
 
467 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  23.76 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  25.8 
 
 
475 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  27.59 
 
 
524 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  25.63 
 
 
530 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  27.27 
 
 
417 aa  77.4  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  23.36 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.84 
 
 
443 aa  77  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  23.76 
 
 
305 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  25.52 
 
 
640 aa  76.6  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  26.33 
 
 
390 aa  76.3  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3388  beta-lactamase  27.99 
 
 
342 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  29.44 
 
 
410 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.19 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  26.37 
 
 
530 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  23.49 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  22.81 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  24.47 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  27.65 
 
 
374 aa  73.2  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  23.05 
 
 
305 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1974  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.64 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624159  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2020  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.64 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3687  beta-lactamase  27.99 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.057596  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.64 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  25.6 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  22.78 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  24.57 
 
 
476 aa  71.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  27.66 
 
 
400 aa  70.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  28.8 
 
 
447 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  28.8 
 
 
447 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>