246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4954 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  100 
 
 		 395 aa  795    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  52.43 
 
 		 397 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1974  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  49.47 
 
 		 385 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624159  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2020  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  49.47 
 
 		 385 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  49.47 
 
 		 385 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11737  hydrolase  47.4 
 
 		 415 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.19965e-18  normal  0.71078 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  43.04 
 
 		 444 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  41.67 
 
 		 443 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  40.11 
 
 		 452 aa  262  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  42.18 
 
 		 397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.27 
 
 		 442 aa  251  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  38.17 
 
 		 445 aa  243  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  39.14 
 
 		 467 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  40.21 
 
 		 442 aa  243  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  38.87 
 
 		 467 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.87 
 
 		 448 aa  223  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  36.24 
 
 		 389 aa  220  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0338  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.25 
 
 		 446 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.691557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.79 
 
 		 449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1945  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.98 
 
 		 430 aa  210  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0642639  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1793  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.51 
 
 		 408 aa  207  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.69 
 
 		 439 aa  207  2e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.64 
 
 		 410 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3290  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.58 
 
 		 446 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.05 
 
 		 391 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.23 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.68 
 
 		 419 aa  192  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.51 
 
 		 419 aa  192  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.4 
 
 		 419 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.4 
 
 		 419 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.85 
 
 		 419 aa  188  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.13 
 
 		 419 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.13 
 
 		 419 aa  187  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.4 
 
 		 419 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.85 
 
 		 419 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  35.26 
 
 		 405 aa  179  9e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2715  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.89 
 
 		 387 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.05 
 
 		 420 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3144  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.45 
 
 		 439 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.59 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5283  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.69 
 
 		 450 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4421  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.64 
 
 		 452 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  33.33 
 
 		 414 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.71 
 
 		 415 aa  164  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.94 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.7 
 
 		 449 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  32.52 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  34.53 
 
 		 426 aa  155  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1376  hypothetical protein  30.49 
 
 		 431 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  28.25 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  30.11 
 
 		 412 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  31.59 
 
 		 389 aa  144  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  31.38 
 
 		 390 aa  143  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.39 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3884  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.85 
 
 		 444 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.383079 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5936  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.29 
 
 		 430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  31.29 
 
 		 505 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1841  hypothetical protein  31.4 
 
 		 446 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0984  beta-lactamase  33.57 
 
 		 450 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2479  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  28.07 
 
 		 404 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  26.93 
 
 		 416 aa  127  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  29.26 
 
 		 405 aa  123  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2086  putative beta-lactamase  29.5 
 
 		 421 aa  122  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114725  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  28.45 
 
 		 413 aa  122  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  32.55 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  29.76 
 
 		 410 aa  113  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  30.51 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  30.09 
 
 		 447 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  30.4 
 
 		 447 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  30.4 
 
 		 447 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  27.78 
 
 		 396 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  27.18 
 
 		 524 aa  93.2  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  31.29 
 
 		 473 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  25.42 
 
 		 380 aa  90.5  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  26.77 
 
 		 598 aa  90.1  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  25.17 
 
 		 449 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  29.86 
 
 		 417 aa  89  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  26.9 
 
 		 384 aa  86.7  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  30.27 
 
 		 466 aa  86.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  30.61 
 
 		 473 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  30.61 
 
 		 473 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2128  beta-lactamase  26.53 
 
 		 443 aa  85.9  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165199  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  26.59 
 
 		 505 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.68 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2115  Beta-lactamase  24.8 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269149  normal  0.194976 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  29.05 
 
 		 481 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  26.26 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  25.35 
 
 		 530 aa  81.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  30.61 
 
 		 467 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  30.61 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1842  hypothetical protein  23.53 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  26.33 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  22.82 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  28.69 
 
 		 472 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  25.32 
 
 		 313 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  23.68 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  27.92 
 
 		 475 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  23.05 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  24.63 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>