More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1765 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  100 
 
 		 397 aa  803    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  84.89 
 
 		 467 aa  707    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  83.88 
 
 		 467 aa  704    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  76.26 
 
 		 452 aa  625  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  67.18 
 
 		 443 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  65.16 
 
 		 444 aa  523  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  55.56 
 
 		 445 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  48.25 
 
 		 442 aa  413  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  52 
 
 		 449 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  50.64 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  44.72 
 
 		 439 aa  372  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1945  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  48.77 
 
 		 430 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0642639  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3290  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  46.65 
 
 		 446 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1793  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  47.36 
 
 		 408 aa  358  9.999999999999999e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  43.81 
 
 		 448 aa  351  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  39.3 
 
 		 410 aa  285  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  42.18 
 
 		 395 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0338  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.34 
 
 		 446 aa  249  6e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.691557  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  39.33 
 
 		 397 aa  246  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.26 
 
 		 419 aa  239  8e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.98 
 
 		 419 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.98 
 
 		 419 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.7 
 
 		 419 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4421  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  40 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.43 
 
 		 419 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.15 
 
 		 419 aa  230  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.21 
 
 		 419 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.15 
 
 		 419 aa  226  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5283  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  38.48 
 
 		 450 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.15 
 
 		 419 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.25 
 
 		 420 aa  223  6e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3144  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  39.11 
 
 		 439 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.75 
 
 		 419 aa  220  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2020  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  38.35 
 
 		 385 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1974  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  38.35 
 
 		 385 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624159  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11737  hydrolase  35.88 
 
 		 415 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.19965e-18  normal  0.71078 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.5 
 
 		 385 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  32.62 
 
 		 389 aa  203  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.06 
 
 		 391 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5936  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.73 
 
 		 430 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3884  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.07 
 
 		 444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.383079 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2479  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.93 
 
 		 449 aa  182  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2715  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.44 
 
 		 387 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  27.63 
 
 		 395 aa  165  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0984  beta-lactamase  28.01 
 
 		 450 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  31.36 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  33.76 
 
 		 505 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1376  hypothetical protein  30.03 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.23 
 
 		 415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.73 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  31.96 
 
 		 389 aa  143  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  30.17 
 
 		 426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.69 
 
 		 419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  31.55 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.4 
 
 		 449 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  29.06 
 
 		 416 aa  137  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  30.34 
 
 		 414 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  30.75 
 
 		 390 aa  136  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1841  hypothetical protein  31.34 
 
 		 446 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  29.19 
 
 		 413 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  29.49 
 
 		 414 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2086  putative beta-lactamase  25.35 
 
 		 421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114725  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30 
 
 		 425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  33.33 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  29.37 
 
 		 412 aa  119  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  29.89 
 
 		 405 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  28.5 
 
 		 404 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  30.45 
 
 		 410 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  28.31 
 
 		 447 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  27.94 
 
 		 447 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  27.94 
 
 		 447 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  25.09 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  26.86 
 
 		 417 aa  93.6  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1842  hypothetical protein  22.77 
 
 		 457 aa  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  27.09 
 
 		 368 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  26.41 
 
 		 323 aa  87.8  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  26.43 
 
 		 383 aa  87  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  27.78 
 
 		 399 aa  86.7  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  29.52 
 
 		 366 aa  86.3  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  27.05 
 
 		 640 aa  84  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  26.69 
 
 		 505 aa  83.6  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  27.27 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  24 
 
 		 440 aa  82  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  23.31 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  24.58 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  26.12 
 
 		 524 aa  80.1  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  23.51 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  26.14 
 
 		 456 aa  79  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  25.41 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  24.68 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  25.97 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  25.68 
 
 		 475 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  22.95 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  28.39 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  26.42 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  26.46 
 
 		 503 aa  75.5  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  24.75 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  26.25 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  24.12 
 
 		 530 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  23.61 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>