More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4710 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  100 
 
 
396 aa  785    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  35.19 
 
 
395 aa  241  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.89 
 
 
449 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  35.07 
 
 
416 aa  203  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.94 
 
 
405 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  41.59 
 
 
419 aa  190  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  36.09 
 
 
405 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.65 
 
 
415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.74 
 
 
425 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  34.71 
 
 
413 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  33.71 
 
 
401 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  35.09 
 
 
390 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  33.45 
 
 
380 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  34.75 
 
 
412 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  30.79 
 
 
389 aa  159  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  35.2 
 
 
405 aa  156  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  34.23 
 
 
410 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  30.96 
 
 
382 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  33.65 
 
 
414 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  31.08 
 
 
384 aa  147  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  31.76 
 
 
414 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  32.39 
 
 
505 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.44 
 
 
467 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.78 
 
 
467 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  34.41 
 
 
447 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.04 
 
 
444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  30.71 
 
 
383 aa  138  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  33.76 
 
 
447 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  33.76 
 
 
447 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  33.33 
 
 
397 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.75 
 
 
452 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  30.14 
 
 
404 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  33.89 
 
 
417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.42 
 
 
449 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.9 
 
 
443 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.26 
 
 
448 aa  124  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.39 
 
 
397 aa  122  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.17 
 
 
395 aa  121  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.48 
 
 
419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0338  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.07 
 
 
446 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.691557  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0984  beta-lactamase  26.45 
 
 
450 aa  117  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.23 
 
 
442 aa  116  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.76 
 
 
420 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.97 
 
 
439 aa  116  8.999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  35.12 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.6 
 
 
442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28 
 
 
419 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.81 
 
 
419 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1945  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.68 
 
 
430 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0642639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.27 
 
 
419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.27 
 
 
419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.27 
 
 
419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  34.34 
 
 
384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  32.26 
 
 
380 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  32.26 
 
 
380 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.82 
 
 
419 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  33.22 
 
 
371 aa  112  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  29.38 
 
 
397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.81 
 
 
419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.15 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  30.77 
 
 
400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  28.87 
 
 
399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.94 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  28.24 
 
 
505 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  31.31 
 
 
374 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  29.58 
 
 
389 aa  109  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1793  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.16 
 
 
408 aa  109  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.29 
 
 
445 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11737  hydrolase  31.34 
 
 
415 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.19965e-18  normal  0.71078 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  34.19 
 
 
432 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  32.99 
 
 
372 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  28.42 
 
 
449 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  32.31 
 
 
359 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.49 
 
 
410 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  32.41 
 
 
378 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  28.95 
 
 
363 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  28.34 
 
 
530 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  31.12 
 
 
466 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  30.03 
 
 
368 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  29.86 
 
 
396 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  25.65 
 
 
598 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  30.45 
 
 
486 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  29.1 
 
 
640 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  31.03 
 
 
389 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  29.36 
 
 
456 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  30.68 
 
 
504 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  25.09 
 
 
305 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  32.02 
 
 
483 aa  103  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  30.23 
 
 
368 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  29.03 
 
 
359 aa  102  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  32.37 
 
 
378 aa  103  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  30.42 
 
 
467 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2020  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.91 
 
 
385 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  31.63 
 
 
362 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1974  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.91 
 
 
385 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624159  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  32.03 
 
 
503 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  30.07 
 
 
467 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  29.27 
 
 
481 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  30.74 
 
 
383 aa  99  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  29.79 
 
 
473 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>