113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3144 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3144  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  100 
 
 		 439 aa  892    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5283  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  56.93 
 
 		 450 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4421  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  61.23 
 
 		 452 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3884  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  52.38 
 
 		 444 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.383079 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2479  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  51.98 
 
 		 449 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5936  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  54.93 
 
 		 430 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  39.21 
 
 		 442 aa  245  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.08 
 
 		 443 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.73 
 
 		 467 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.27 
 
 		 467 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.69 
 
 		 444 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.14 
 
 		 452 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  39.11 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.18 
 
 		 445 aa  216  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.83 
 
 		 410 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.07 
 
 		 419 aa  206  9e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.88 
 
 		 419 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.51 
 
 		 420 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.43 
 
 		 419 aa  202  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.43 
 
 		 419 aa  202  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.59 
 
 		 419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.43 
 
 		 419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.49 
 
 		 442 aa  199  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.88 
 
 		 419 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.82 
 
 		 449 aa  197  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.61 
 
 		 419 aa  196  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.88 
 
 		 419 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.24 
 
 		 419 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.3 
 
 		 448 aa  187  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1793  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.82 
 
 		 408 aa  187  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.07 
 
 		 439 aa  177  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3290  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.07 
 
 		 446 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.45 
 
 		 395 aa  172  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1945  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.26 
 
 		 430 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0642639  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0338  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.63 
 
 		 446 aa  153  5e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.691557  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.78 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1974  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.19 
 
 		 385 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624159  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2020  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.19 
 
 		 385 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.47 
 
 		 385 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.94 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  28.96 
 
 		 389 aa  131  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11737  hydrolase  28.01 
 
 		 415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.19965e-18  normal  0.71078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2715  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.15 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  28.08 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0984  beta-lactamase  24.94 
 
 		 450 aa  113  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.03 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2086  putative beta-lactamase  26.27 
 
 		 421 aa  103  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.55 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  26.28 
 
 		 505 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  25.96 
 
 		 413 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.95 
 
 		 449 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.08 
 
 		 419 aa  94.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  27.4 
 
 		 414 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  26.5 
 
 		 426 aa  92.4  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1376  hypothetical protein  25.29 
 
 		 431 aa  89.7  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  22.35 
 
 		 395 aa  87.8  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  29 
 
 		 396 aa  87.8  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  29.81 
 
 		 410 aa  87  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1841  hypothetical protein  25 
 
 		 446 aa  86.7  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  27.48 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  25.82 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  26.77 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  24.25 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  24.24 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.79 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  24.73 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  22.79 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  26.45 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  25 
 
 		 530 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  24.61 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  22.37 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  24.04 
 
 		 359 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  25.25 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  23.94 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0190  beta-lactamase  25.19 
 
 		 476 aa  57  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  22.46 
 
 		 475 aa  56.6  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  24.92 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  22.18 
 
 		 503 aa  56.2  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  23.33 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  23.33 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  21.75 
 
 		 598 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  22.7 
 
 		 371 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2115  Beta-lactamase  25.6 
 
 		 420 aa  53.1  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269149  normal  0.194976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  24.76 
 
 		 360 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  23.89 
 
 		 340 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  24.92 
 
 		 456 aa  53.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  25.38 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  24.06 
 
 		 472 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  21.81 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  25 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  24.22 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  20.93 
 
 		 530 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  22.95 
 
 		 362 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  23.78 
 
 		 323 aa  51.2  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  22.83 
 
 		 368 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  23.91 
 
 		 473 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  23.91 
 
 		 473 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  23.36 
 
 		 481 aa  50.1  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  23.13 
 
 		 368 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  22.79 
 
 		 459 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>