More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1544 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  100 
 
 		 389 aa  798    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  65.48 
 
 		 401 aa  480  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  49.2 
 
 		 405 aa  273  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  41.18 
 
 		 414 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  37.44 
 
 		 413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  42.61 
 
 		 414 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  44.51 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  38.63 
 
 		 505 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  35.56 
 
 		 447 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  35.47 
 
 		 447 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  35.47 
 
 		 447 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.47 
 
 		 419 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  32.24 
 
 		 395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  36.36 
 
 		 412 aa  196  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  35.06 
 
 		 416 aa  189  5.999999999999999e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.86 
 
 		 415 aa  176  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  33.79 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.82 
 
 		 405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.71 
 
 		 442 aa  169  7e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.24 
 
 		 449 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.71 
 
 		 443 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.33 
 
 		 467 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  31.95 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.96 
 
 		 442 aa  159  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.65 
 
 		 467 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  31.85 
 
 		 404 aa  156  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.85 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.83 
 
 		 445 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1793  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.87 
 
 		 408 aa  150  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.79 
 
 		 425 aa  149  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.27 
 
 		 452 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.76 
 
 		 444 aa  146  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  35.29 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  31.75 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  31.42 
 
 		 396 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.59 
 
 		 395 aa  144  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  31.96 
 
 		 397 aa  143  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.82 
 
 		 448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  29.33 
 
 		 382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  32.43 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.01 
 
 		 439 aa  138  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  33.7 
 
 		 410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.82 
 
 		 449 aa  136  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3290  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.27 
 
 		 446 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  27.38 
 
 		 387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  27.33 
 
 		 389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.39 
 
 		 419 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.39 
 
 		 419 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.57 
 
 		 419 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.21 
 
 		 391 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.29 
 
 		 419 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.57 
 
 		 419 aa  123  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.64 
 
 		 419 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  32.57 
 
 		 396 aa  123  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.32 
 
 		 419 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.12 
 
 		 420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.21 
 
 		 419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.27 
 
 		 419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  29.32 
 
 		 363 aa  119  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  29.35 
 
 		 530 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1945  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.93 
 
 		 430 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0642639  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11737  hydrolase  30.97 
 
 		 415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.19965e-18  normal  0.71078 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.96 
 
 		 419 aa  116  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  29.18 
 
 		 503 aa  116  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  30.19 
 
 		 466 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  28.62 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  26.6 
 
 		 598 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  28.28 
 
 		 315 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  27.07 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  28.8 
 
 		 473 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  27.59 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  28.28 
 
 		 313 aa  113  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  28.66 
 
 		 473 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  28.66 
 
 		 473 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  27.89 
 
 		 384 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  27.24 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.04 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  27.24 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  30.26 
 
 		 491 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  28.66 
 
 		 481 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0338  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.3 
 
 		 446 aa  111  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.691557  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  27.9 
 
 		 530 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  28.29 
 
 		 505 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  25.26 
 
 		 380 aa  109  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  29.73 
 
 		 467 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2020  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.87 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.87 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  28.23 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1974  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.87 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624159  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  28.8 
 
 		 640 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  26.75 
 
 		 374 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  26.55 
 
 		 315 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  27.34 
 
 		 340 aa  107  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  26.55 
 
 		 315 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  29.43 
 
 		 467 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1376  hypothetical protein  27.6 
 
 		 431 aa  106  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1227  beta-lactamase  30.43 
 
 		 487 aa  106  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  28.53 
 
 		 378 aa  106  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  27.18 
 
 		 314 aa  105  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  28.84 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>