More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2861 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  100 
 
 		 530 aa  1096    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  62.64 
 
 		 530 aa  706    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  48.26 
 
 		 505 aa  445  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  44.56 
 
 		 486 aa  430  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  51.1 
 
 		 640 aa  379  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  50.29 
 
 		 462 aa  348  1e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1227  beta-lactamase  47.06 
 
 		 487 aa  325  8.000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  41.52 
 
 		 483 aa  325  1e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  45.64 
 
 		 504 aa  299  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  48.55 
 
 		 503 aa  297  3e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  36.48 
 
 		 476 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  39.22 
 
 		 475 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0190  beta-lactamase  30.56 
 
 		 476 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  29.37 
 
 		 524 aa  183  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02500  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  32.59 
 
 		 308 aa  147  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  31.77 
 
 		 305 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  30.77 
 
 		 305 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  32.01 
 
 		 313 aa  144  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  32.46 
 
 		 315 aa  144  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  31.25 
 
 		 315 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  29.01 
 
 		 315 aa  141  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  30.36 
 
 		 305 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  28.65 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  33.69 
 
 		 363 aa  140  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  30.54 
 
 		 305 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  29.63 
 
 		 315 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  30.54 
 
 		 309 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  30.54 
 
 		 309 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  32.46 
 
 		 315 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  29.1 
 
 		 598 aa  138  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  32.66 
 
 		 314 aa  137  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.54 
 
 		 305 aa  137  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  29.14 
 
 		 315 aa  137  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  28.3 
 
 		 340 aa  136  9e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  27.47 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.54 
 
 		 305 aa  134  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  27.91 
 
 		 315 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  27.91 
 
 		 315 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  29.75 
 
 		 380 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  29.75 
 
 		 380 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  29.55 
 
 		 305 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1128  beta-lactamase  29.24 
 
 		 337 aa  129  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170129  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  28 
 
 		 305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  30.51 
 
 		 323 aa  129  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  29.01 
 
 		 305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3265  beta-lactamase  27.12 
 
 		 304 aa  124  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000437182  hitchhiker  0.000159955 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  28.27 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  27.49 
 
 		 400 aa  121  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  30.11 
 
 		 378 aa  120  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  29.21 
 
 		 328 aa  120  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  29.41 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  29.47 
 
 		 414 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  28.09 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  29.35 
 
 		 389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4964  beta-lactamase  28.31 
 
 		 335 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663595  normal  0.0104106 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1250  Beta-lactamase  28.76 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3770  beta-lactamase  28.08 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000344014  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  27.9 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  28.47 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.79 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3388  beta-lactamase  28.9 
 
 		 342 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3687  beta-lactamase  28.9 
 
 		 342 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.057596  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1811  beta-lactamase  30.24 
 
 		 356 aa  110  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  28.66 
 
 		 416 aa  110  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  28.47 
 
 		 505 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  27.49 
 
 		 374 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1083  beta-lactamase  27.84 
 
 		 328 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  28.88 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3093  beta-lactamase  27.27 
 
 		 333 aa  104  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  27.92 
 
 		 383 aa  103  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  26.62 
 
 		 366 aa  103  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  27.18 
 
 		 384 aa  103  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  25.49 
 
 		 374 aa  103  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  25.75 
 
 		 384 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2235  hypothetical protein  27.36 
 
 		 346 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2236  amide hydrolase  27.27 
 
 		 340 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1198  beta-lactamase  27.51 
 
 		 333 aa  102  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.98564  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  29.14 
 
 		 475 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.12 
 
 		 405 aa  101  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.08 
 
 		 419 aa  101  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.03 
 
 		 468 aa  100  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  28.62 
 
 		 412 aa  100  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0910  beta-lactamase  27.04 
 
 		 353 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  27.75 
 
 		 360 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  28.14 
 
 		 405 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  26.28 
 
 		 413 aa  99.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3104  putative Beta-lactamase  23.99 
 
 		 463 aa  98.2  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2259  beta-lactamase  24.82 
 
 		 337 aa  97.8  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.777809  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  24.92 
 
 		 327 aa  97.8  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  28.25 
 
 		 456 aa  97.4  6e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  28.13 
 
 		 405 aa  96.7  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  26.02 
 
 		 359 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  23.81 
 
 		 371 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  27.46 
 
 		 426 aa  94.4  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  28.16 
 
 		 382 aa  94.4  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.71 
 
 		 420 aa  94.4  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.18 
 
 		 448 aa  94.4  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.08 
 
 		 419 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  26.74 
 
 		 613 aa  93.6  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  28.35 
 
 		 467 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>