192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1198 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1198  beta-lactamase  100 
 
 		 333 aa  649    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.98564  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2259  beta-lactamase  65.88 
 
 		 337 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.777809  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0910  beta-lactamase  68.67 
 
 		 353 aa  384  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2235  hypothetical protein  68.67 
 
 		 346 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1083  beta-lactamase  58.56 
 
 		 328 aa  345  4e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1128  beta-lactamase  50 
 
 		 337 aa  281  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170129  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1250  Beta-lactamase  44.95 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  48.9 
 
 		 389 aa  250  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1811  beta-lactamase  43.62 
 
 		 356 aa  249  4e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3687  beta-lactamase  46.78 
 
 		 342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.057596  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3388  beta-lactamase  46.44 
 
 		 342 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4964  beta-lactamase  45.02 
 
 		 335 aa  239  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663595  normal  0.0104106 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  40.13 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  31.63 
 
 		 305 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  30.82 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  29.45 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  28.77 
 
 		 305 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  28.42 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  28.77 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  28.77 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  31.32 
 
 		 363 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.08 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.08 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  30.58 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  27.74 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  29.72 
 
 		 328 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  27.36 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  25.16 
 
 		 387 aa  116  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  31.37 
 
 		 524 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  26.97 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  25.53 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  29.31 
 
 		 374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  25.31 
 
 		 315 aa  109  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  25.39 
 
 		 315 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  25.23 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  25.79 
 
 		 598 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  29.61 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  25.71 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  25.62 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  24.27 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  25.15 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  25.15 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  27.6 
 
 		 530 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  27.51 
 
 		 530 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  31.29 
 
 		 486 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  31.73 
 
 		 475 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  30.59 
 
 		 380 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  30.59 
 
 		 380 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  28.9 
 
 		 503 aa  97.1  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  28.01 
 
 		 505 aa  96.3  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  23.87 
 
 		 387 aa  90.1  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  25.82 
 
 		 640 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2343  beta-lactamase  23.81 
 
 		 309 aa  87  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  28.67 
 
 		 389 aa  86.3  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  28.95 
 
 		 366 aa  86.3  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.91 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  27.11 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  24.63 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2236  amide hydrolase  28 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  26.42 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  25.81 
 
 		 475 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4003  hypothetical protein  28.63 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  27 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1227  beta-lactamase  28.91 
 
 		 487 aa  78.2  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  31.64 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  27.67 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  28.06 
 
 		 504 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  27.27 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  29.04 
 
 		 483 aa  77  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.8 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  28.28 
 
 		 405 aa  76.3  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02500  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.39 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  24.38 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  27.6 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  27.08 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  28.17 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  27.76 
 
 		 456 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  26.1 
 
 		 505 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0190  beta-lactamase  23.05 
 
 		 476 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  29.71 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.68 
 
 		 419 aa  72.4  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  28.22 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  23.81 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  23.02 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  26.79 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  27.93 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  26.8 
 
 		 413 aa  69.3  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  27.76 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  29.28 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  26.12 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3093  beta-lactamase  23.89 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  24.36 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  26.56 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  22.71 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3104  putative Beta-lactamase  28.47 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.69 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  25.97 
 
 		 462 aa  62.8  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1124  beta-lactamase  26.98 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3265  beta-lactamase  31.46 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000437182  hitchhiker  0.000159955 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  25.81 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>