More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1124 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1124  beta-lactamase  100 
 
 		 346 aa  692    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3245  beta-lactamase  45.98 
 
 		 342 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.622434 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2508  beta-lactamase  47.28 
 
 		 336 aa  262  6e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.650655 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0777  beta-lactamase  39.29 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0135628  normal  0.105331 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  26.71 
 
 		 384 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  29.29 
 
 		 323 aa  87.8  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  29.37 
 
 		 397 aa  86.7  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  30.6 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  28.67 
 
 		 456 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  26.42 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  27.99 
 
 		 491 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  29.5 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  29.44 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  25.25 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4979  beta-lactamase  25.18 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  28.09 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  28.1 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  26.13 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0219  beta-lactamase  30.15 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.856689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  31.16 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  28.43 
 
 		 473 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.57 
 
 		 467 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  28.94 
 
 		 466 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  29.34 
 
 		 481 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  28.12 
 
 		 473 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  28.12 
 
 		 473 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  28.29 
 
 		 467 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.47 
 
 		 467 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.2 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  27.09 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  27.36 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13543  putative hydrolase transmembrane protein  24.67 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  21.97 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  25.82 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  27.82 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3770  beta-lactamase  28.38 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000344014  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  27.27 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  27.06 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  25.4 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  25.4 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  24.18 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  28.28 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2236  amide hydrolase  26.33 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31 
 
 		 476 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  25.33 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  27.52 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  28.9 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2259  beta-lactamase  27.44 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.777809  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.45 
 
 		 442 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  25.11 
 
 		 413 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  26.69 
 
 		 504 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  25.15 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  21.36 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  23.96 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  26.24 
 
 		 486 aa  70.5  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2235  hypothetical protein  28.3 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  24.62 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.68 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  27.49 
 
 		 505 aa  70.1  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  26.67 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  25.33 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.51 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  26.71 
 
 		 455 aa  69.7  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  24.06 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  22.18 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  25.88 
 
 		 475 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.05 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  26.32 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  28.37 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0910  beta-lactamase  27.92 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  26.77 
 
 		 503 aa  67.4  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.56 
 
 		 452 aa  67  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2249  beta-lactamase  27.51 
 
 		 468 aa  67  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  26.42 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  25 
 
 		 640 aa  66.2  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  27.62 
 
 		 530 aa  65.9  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  27.18 
 
 		 453 aa  65.9  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  20.95 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4003  hypothetical protein  27.12 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1749  Beta-lactamase  25.52 
 
 		 496 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  27.02 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2128  beta-lactamase  26.32 
 
 		 443 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165199  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  27.43 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  25.37 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.23 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  23.65 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  33.1 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.23 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.79 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  25.32 
 
 		 522 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.91 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  24.83 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  22.03 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.23 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  27.87 
 
 		 459 aa  63.2  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  24 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2343  beta-lactamase  22.49 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.38 
 
 		 419 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  23.67 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>