179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2508 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2508  beta-lactamase  100 
 
 		 336 aa  665    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.650655 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1124  beta-lactamase  45.77 
 
 		 346 aa  265  8e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3245  beta-lactamase  35.63 
 
 		 342 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.622434 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0777  beta-lactamase  41.04 
 
 		 333 aa  187  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0135628  normal  0.105331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0219  beta-lactamase  30.19 
 
 		 367 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.856689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  29.32 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  29.01 
 
 		 481 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  28.62 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  27.72 
 
 		 467 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  28.57 
 
 		 473 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  27.24 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  27.84 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  28.2 
 
 		 473 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  28.2 
 
 		 473 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13543  putative hydrolase transmembrane protein  27.54 
 
 		 369 aa  79.3  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  26.88 
 
 		 504 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  29.53 
 
 		 383 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.35 
 
 		 468 aa  74.3  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  27.57 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  28.1 
 
 		 456 aa  73.2  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  26.94 
 
 		 486 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  28.96 
 
 		 475 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4979  beta-lactamase  22.97 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  20.21 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  21.23 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  20.55 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  26.98 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  21.23 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  21.58 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  20.21 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  20.21 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  22.52 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  26.3 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  20.21 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  23.1 
 
 		 387 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  24.35 
 
 		 380 aa  67  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  21.58 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  24.35 
 
 		 380 aa  67  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  29.25 
 
 		 400 aa  67  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  25.84 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  20.65 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  28.11 
 
 		 503 aa  64.7  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2249  beta-lactamase  27.74 
 
 		 468 aa  64.3  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  27.65 
 
 		 468 aa  63.9  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  25.5 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2259  beta-lactamase  25.68 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.777809  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  28.57 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  26.32 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  24.92 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  25.17 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  26 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  27.02 
 
 		 530 aa  60.1  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2128  beta-lactamase  24.17 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165199  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  25.59 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  23.81 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1816  beta-lactamase  24.27 
 
 		 494 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.403938 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  23.68 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1198  beta-lactamase  25.68 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.98564  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  26.5 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  22.37 
 
 		 598 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  23.26 
 
 		 640 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.13 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  29.61 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  24.47 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  25.34 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  25.31 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  26.32 
 
 		 530 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  24.83 
 
 		 384 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  23.48 
 
 		 390 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1227  beta-lactamase  27.57 
 
 		 487 aa  57  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2343  beta-lactamase  23.33 
 
 		 309 aa  57  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2093  beta-lactamase  27.48 
 
 		 497 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4964  beta-lactamase  26.9 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663595  normal  0.0104106 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.83 
 
 		 449 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.71 
 
 		 442 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1749  Beta-lactamase  28.24 
 
 		 496 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  27.46 
 
 		 414 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  24.89 
 
 		 327 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2416  beta-lactamase  23.31 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  32.37 
 
 		 525 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  25.27 
 
 		 524 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  28.83 
 
 		 462 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2235  hypothetical protein  26.5 
 
 		 346 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3687  beta-lactamase  26.32 
 
 		 342 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.057596  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1007  hypothetical protein  22.46 
 
 		 440 aa  53.9  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.39 
 
 		 425 aa  53.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.79 
 
 		 391 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  23.25 
 
 		 522 aa  53.1  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0910  beta-lactamase  26.5 
 
 		 353 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_004310  BR1041  hypothetical protein  22.11 
 
 		 440 aa  52.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  22.11 
 
 		 368 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  25.93 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3265  beta-lactamase  31.82 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000437182  hitchhiker  0.000159955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  27.27 
 
 		 528 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  26.4 
 
 		 507 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  27.27 
 
 		 528 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  33.81 
 
 		 496 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  23.93 
 
 		 374 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  26.58 
 
 		 505 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  25.79 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>