246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2416 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2416  beta-lactamase  100 
 
 		 376 aa  751    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1161  beta-lactamase  47.41 
 
 		 356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.580362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6382  beta-lactamase  43.22 
 
 		 472 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1815  beta-lactamase  41.21 
 
 		 408 aa  263  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270787 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0407  beta-lactamase  40.46 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  28.3 
 
 		 340 aa  99.8  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  28.28 
 
 		 315 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  28.49 
 
 		 380 aa  92.8  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  28.49 
 
 		 380 aa  92.8  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  26.21 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  26.47 
 
 		 305 aa  90.9  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  26.9 
 
 		 315 aa  91.3  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  26.9 
 
 		 315 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  26.9 
 
 		 315 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  27.94 
 
 		 475 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3104  putative Beta-lactamase  30.77 
 
 		 463 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  26.9 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  26.22 
 
 		 315 aa  86.7  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  26.37 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  26.37 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  29.69 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.84 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  26.2 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  25.28 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  25.28 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  25.28 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  30.17 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  25.52 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  31.27 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  25.75 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  29.06 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  25.56 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  25.38 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.33 
 
 		 305 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  27.56 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3093  beta-lactamase  26.21 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  29.32 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  22.82 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  25.83 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  28.94 
 
 		 640 aa  76.3  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  24.24 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  27.31 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2236  amide hydrolase  28.11 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.53 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  24.44 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  24.63 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  26.62 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  27.69 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  27.27 
 
 		 524 aa  73.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  26.64 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  24.64 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  29.09 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  23.75 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  27.55 
 
 		 504 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  28.41 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  27.02 
 
 		 449 aa  69.7  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  27.9 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  28.1 
 
 		 503 aa  69.3  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  26.74 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  26.96 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  28.57 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  28.76 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.1 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4003  hypothetical protein  26.4 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  27.86 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  28.85 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.91 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.42 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  27.62 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2343  beta-lactamase  26.36 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  26.82 
 
 		 389 aa  67  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  28.57 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  29 
 
 		 456 aa  66.2  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  26.21 
 
 		 462 aa  66.2  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  27.24 
 
 		 368 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  27.27 
 
 		 368 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  24.82 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  27.5 
 
 		 505 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  26.49 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  27.48 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.62 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  29.92 
 
 		 486 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  28.96 
 
 		 591 aa  63.2  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  23.86 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  28.34 
 
 		 483 aa  62.8  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  27.22 
 
 		 481 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  22.11 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  27.87 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.09 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  27.52 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.99 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  28.01 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  26.3 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1124  beta-lactamase  25 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.42 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  25.77 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  26.55 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  27.19 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  27.59 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  26.79 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>