131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1161 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1161  beta-lactamase  100 
 
 		 356 aa  723    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.580362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2416  beta-lactamase  47.41 
 
 		 376 aa  298  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0407  beta-lactamase  39.74 
 
 		 364 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1815  beta-lactamase  34.96 
 
 		 408 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6382  beta-lactamase  33.24 
 
 		 472 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  27.08 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  25.55 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  23.11 
 
 		 412 aa  75.9  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  25.28 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  25.94 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  26.51 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  26.51 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  25.19 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  25.94 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3093  beta-lactamase  26.09 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  25.91 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  25.55 
 
 		 314 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  25 
 
 		 475 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  27.86 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  23.75 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  24.45 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3104  putative Beta-lactamase  26.04 
 
 		 463 aa  70.1  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  25.28 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  25.28 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  23.37 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  23.37 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.31 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  23.37 
 
 		 305 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  22.99 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  24.71 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  21.8 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2236  amide hydrolase  24.74 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  22.05 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  24.64 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  25.64 
 
 		 417 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  23.31 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  23.95 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.61 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  21.46 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  21.84 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  25.97 
 
 		 400 aa  59.3  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  25.19 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  23.51 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  31.97 
 
 		 464 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  25.44 
 
 		 366 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1128  beta-lactamase  26.67 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170129  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  28.16 
 
 		 455 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  30.9 
 
 		 407 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  26.63 
 
 		 454 aa  53.9  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  30.23 
 
 		 790 aa  53.5  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  21.71 
 
 		 416 aa  53.1  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  24.29 
 
 		 598 aa  53.1  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2249  beta-lactamase  24.92 
 
 		 468 aa  52.8  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  21.36 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  27.05 
 
 		 505 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  25.64 
 
 		 456 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  27.32 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  27.73 
 
 		 460 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  23.81 
 
 		 519 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  20.15 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5769  beta-lactamase  25.32 
 
 		 670 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02500  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  23.99 
 
 		 308 aa  51.2  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  23.76 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  27.37 
 
 		 483 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  21.09 
 
 		 380 aa  50.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  26.56 
 
 		 384 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  29.67 
 
 		 427 aa  50.4  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.82 
 
 		 468 aa  50.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  29.15 
 
 		 539 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  25.45 
 
 		 383 aa  49.7  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  21.89 
 
 		 363 aa  49.3  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  29.67 
 
 		 408 aa  49.7  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  33.06 
 
 		 423 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2343  beta-lactamase  23.74 
 
 		 309 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.42 
 
 		 419 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  24.07 
 
 		 401 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  24.22 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  26.97 
 
 		 459 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  23.06 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  23.59 
 
 		 681 aa  47.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  23.05 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4003  hypothetical protein  22.22 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  22.89 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  22.71 
 
 		 404 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  26.88 
 
 		 399 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  31.3 
 
 		 399 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0219  beta-lactamase  26.7 
 
 		 367 aa  47  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.856689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  22.91 
 
 		 382 aa  46.6  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  25.69 
 
 		 410 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  26.42 
 
 		 359 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  25.98 
 
 		 362 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  29.71 
 
 		 401 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  25.24 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  22.63 
 
 		 419 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1083  beta-lactamase  25.52 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  28.57 
 
 		 497 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  28.37 
 
 		 562 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  23.85 
 
 		 389 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  26.1 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  23.42 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>