More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2487 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  100 
 
 		 408 aa  820    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  59.1 
 
 		 395 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  54.96 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  54.67 
 
 		 391 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  52.74 
 
 		 483 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  52.2 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  54.2 
 
 		 381 aa  354  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  56.27 
 
 		 381 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  56.25 
 
 		 416 aa  344  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  40.92 
 
 		 793 aa  263  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  41.76 
 
 		 428 aa  243  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  42.03 
 
 		 452 aa  243  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  38.87 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  38.95 
 
 		 966 aa  209  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  37.69 
 
 		 395 aa  210  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  38.89 
 
 		 784 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  37.78 
 
 		 790 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  36.16 
 
 		 379 aa  200  5e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  36.6 
 
 		 381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  39.24 
 
 		 796 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  39.24 
 
 		 796 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  35.89 
 
 		 381 aa  193  5e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  34.44 
 
 		 430 aa  193  5e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  40.45 
 
 		 792 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  40.76 
 
 		 785 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  35.54 
 
 		 385 aa  189  8e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  36.47 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  39.17 
 
 		 354 aa  187  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  36.43 
 
 		 574 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  36.62 
 
 		 379 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  33.17 
 
 		 471 aa  176  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  30.93 
 
 		 528 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  30.93 
 
 		 528 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  34.9 
 
 		 360 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  30.47 
 
 		 496 aa  169  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  30.59 
 
 		 531 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.92 
 
 		 953 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  31.82 
 
 		 603 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  36.87 
 
 		 582 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  27.87 
 
 		 1012 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  30.29 
 
 		 597 aa  162  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  36.22 
 
 		 717 aa  160  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.35 
 
 		 1018 aa  159  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  34.78 
 
 		 361 aa  159  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  34.26 
 
 		 351 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  36.53 
 
 		 566 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  33.83 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1007 aa  150  3e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.98 
 
 		 1002 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  33.05 
 
 		 361 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1850  Beta-lactamase class C or other penicillin binding protein  30.63 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000532294  hitchhiker  0.000116253 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  33.73 
 
 		 366 aa  145  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0383  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  32.48 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4160  hypothetical protein  33.6 
 
 		 818 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000766166  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2622  hypothetical protein  29.17 
 
 		 432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2737  hypothetical protein  29.43 
 
 		 432 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1543  beta-lactamase  28.07 
 
 		 651 aa  140  6e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2711  hypothetical protein  29.43 
 
 		 432 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  34.75 
 
 		 369 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  25.84 
 
 		 971 aa  138  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2844  hypothetical protein  29.17 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2671  hypothetical protein  29.17 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  34.85 
 
 		 591 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2716  hypothetical protein  30.23 
 
 		 434 aa  137  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2585  hypothetical protein  29.97 
 
 		 433 aa  137  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  28.5 
 
 		 992 aa  136  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  27.46 
 
 		 990 aa  136  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1231  beta-lactamase  29.72 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1249  hypothetical protein  29.97 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.303061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  35.33 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2566  hypothetical protein  29.97 
 
 		 434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3660  hypothetical protein  29.97 
 
 		 434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0444  beta-lactamase  29.65 
 
 		 339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2194  beta-lactamase  32.12 
 
 		 334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.724545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0547  beta-lactamase  31.08 
 
 		 375 aa  130  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.727644  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  25.66 
 
 		 997 aa  129  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4212  beta-lactamase  32.86 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0471  beta-lactamase  30.46 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  30.35 
 
 		 347 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  29.11 
 
 		 414 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2095  hypothetical protein  25.79 
 
 		 484 aa  124  4e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.187143  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1729  hypothetical protein  27.25 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00956707  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  32.63 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2590  beta-lactamase  36.04 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4807  beta-lactamase  24.41 
 
 		 434 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1201  beta-lactamase  28.79 
 
 		 665 aa  121  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  30.21 
 
 		 406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1251  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  29.1 
 
 		 377 aa  116  6e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000135632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1130  beta-lactamase  29.14 
 
 		 355 aa  116  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  27.12 
 
 		 415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  27.27 
 
 		 421 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  27.27 
 
 		 421 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  27.27 
 
 		 412 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1629  hypothetical protein  28.62 
 
 		 318 aa  113  6e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000178179  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  29.77 
 
 		 438 aa  113  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  27.27 
 
 		 412 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  27.27 
 
 		 416 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  30.41 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  31.22 
 
 		 613 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0220  putative secreted esterase  31.36 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>