More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1130 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1130  beta-lactamase  100 
 
 		 355 aa  710    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  30.95 
 
 		 793 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  32.04 
 
 		 966 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  33.13 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  35.92 
 
 		 369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  34.67 
 
 		 354 aa  146  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  33.99 
 
 		 784 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  34.41 
 
 		 361 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  35.4 
 
 		 792 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  32.08 
 
 		 574 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  34.64 
 
 		 790 aa  139  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  34.76 
 
 		 785 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4212  beta-lactamase  33.24 
 
 		 343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  30.34 
 
 		 531 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  30.51 
 
 		 471 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  30.35 
 
 		 483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0220  putative secreted esterase  35.15 
 
 		 339 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146113  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  29.72 
 
 		 391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  32.47 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  30 
 
 		 379 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  29.89 
 
 		 381 aa  126  5e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  29.2 
 
 		 528 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  29.2 
 
 		 528 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  32.95 
 
 		 796 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  32.95 
 
 		 796 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  27.92 
 
 		 395 aa  123  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  31.84 
 
 		 566 aa  123  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  32.38 
 
 		 357 aa  123  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  29.75 
 
 		 381 aa  122  7e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  30.95 
 
 		 416 aa  122  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  31.21 
 
 		 430 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  29.65 
 
 		 459 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  33.44 
 
 		 582 aa  119  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  32.5 
 
 		 717 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  31.04 
 
 		 452 aa  119  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  30.99 
 
 		 385 aa  119  9e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  31.04 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0444  beta-lactamase  27.07 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  27.18 
 
 		 496 aa  112  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  28.01 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  30.42 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1850  Beta-lactamase class C or other penicillin binding protein  27.87 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000532294  hitchhiker  0.000116253 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  28.81 
 
 		 408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0471  beta-lactamase  25.35 
 
 		 336 aa  110  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  29.86 
 
 		 360 aa  109  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2194  beta-lactamase  31.32 
 
 		 334 aa  109  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.724545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  31.5 
 
 		 379 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0383  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  27.79 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  27.97 
 
 		 381 aa  106  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  28.31 
 
 		 1012 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.25 
 
 		 1018 aa  105  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  30.57 
 
 		 591 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  26.76 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  28.33 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1629  hypothetical protein  26.52 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000178179  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  27.6 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2334  hypothetical protein  26.86 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000883594  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.26 
 
 		 953 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  34.11 
 
 		 348 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0439  beta-lactamase  30.36 
 
 		 397 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0784108 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  23.1 
 
 		 1007 aa  97.1  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2506  beta-lactamase  32.46 
 
 		 344 aa  97.1  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  30.06 
 
 		 351 aa  97.4  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  33.55 
 
 		 415 aa  96.3  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1251  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  25.83 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000135632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1729  hypothetical protein  26.27 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00956707  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0547  beta-lactamase  26.5 
 
 		 375 aa  94  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.727644  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4807  beta-lactamase  23.68 
 
 		 434 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  26.48 
 
 		 597 aa  90.9  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20140  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  30.67 
 
 		 371 aa  91.3  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.44906  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  26.03 
 
 		 603 aa  90.5  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  23.66 
 
 		 971 aa  89.4  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3659  beta-lactamase  27.67 
 
 		 374 aa  89.4  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2585  hypothetical protein  26.46 
 
 		 433 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2716  hypothetical protein  26.18 
 
 		 434 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1543  beta-lactamase  25.79 
 
 		 651 aa  86.3  7e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2566  hypothetical protein  26.18 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1249  hypothetical protein  26.18 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.303061 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4038  beta-lactamase  33.33 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  24.01 
 
 		 990 aa  85.5  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1231  beta-lactamase  27.04 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3660  hypothetical protein  25.91 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  32.32 
 
 		 377 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2590  beta-lactamase  27.76 
 
 		 333 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1201  beta-lactamase  24.17 
 
 		 665 aa  82  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4160  hypothetical protein  30.08 
 
 		 818 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000766166  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3130  beta-lactamase  29.78 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  28.67 
 
 		 424 aa  80.1  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  21.79 
 
 		 997 aa  80.1  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3512  beta-lactamase  36.26 
 
 		 547 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265184  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  27.15 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25 
 
 		 1002 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3459  beta-lactamase  28.53 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213623 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  26.7 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  26.7 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  26.7 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  26.85 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  26.24 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  25 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2711  hypothetical protein  24.18 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27035  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>