More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2711 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1231  beta-lactamase  72.69 
 
 		 434 aa  676    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2844  hypothetical protein  99.54 
 
 		 432 aa  886    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2622  hypothetical protein  98.84 
 
 		 432 aa  879    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2711  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  889    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3660  hypothetical protein  72.92 
 
 		 434 aa  676    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1249  hypothetical protein  72.22 
 
 		 434 aa  671    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.303061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2671  hypothetical protein  99.54 
 
 		 432 aa  886    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2585  hypothetical protein  72.92 
 
 		 433 aa  677    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2737  hypothetical protein  99.07 
 
 		 432 aa  882    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2716  hypothetical protein  72.92 
 
 		 434 aa  677    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2566  hypothetical protein  72.45 
 
 		 434 aa  673    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1543  beta-lactamase  47.07 
 
 		 651 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1201  beta-lactamase  47.69 
 
 		 665 aa  384  1e-105  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4160  hypothetical protein  42.37 
 
 		 818 aa  311  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000766166  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2095  hypothetical protein  43.18 
 
 		 484 aa  309  5e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.187143  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  33.42 
 
 		 574 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  34.24 
 
 		 452 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  35.11 
 
 		 428 aa  188  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  35.21 
 
 		 1012 aa  187  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  32.55 
 
 		 966 aa  186  7e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  30.93 
 
 		 717 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  31.47 
 
 		 597 aa  180  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  34.38 
 
 		 603 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  34.16 
 
 		 591 aa  176  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  31.92 
 
 		 566 aa  173  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  32.24 
 
 		 582 aa  173  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.51 
 
 		 1018 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  30 
 
 		 953 aa  159  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.75 
 
 		 1002 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  29.83 
 
 		 361 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  31.52 
 
 		 395 aa  149  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  29.53 
 
 		 379 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  28.61 
 
 		 1007 aa  147  5e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  32.16 
 
 		 360 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  30.43 
 
 		 796 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  32.35 
 
 		 381 aa  145  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  30.43 
 
 		 796 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  32.8 
 
 		 792 aa  143  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  29.7 
 
 		 391 aa  143  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  30.65 
 
 		 793 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  30.32 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  29.1 
 
 		 385 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  29.71 
 
 		 990 aa  139  7.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  29.75 
 
 		 379 aa  138  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  32.48 
 
 		 785 aa  137  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  32.49 
 
 		 354 aa  137  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  30.81 
 
 		 361 aa  136  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  28.65 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  28.9 
 
 		 447 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  30.16 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  30.79 
 
 		 784 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  31.61 
 
 		 790 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  29.13 
 
 		 992 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  31.02 
 
 		 392 aa  132  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  29.43 
 
 		 381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  28.05 
 
 		 971 aa  130  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  31.92 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  30.06 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  27.14 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  29.5 
 
 		 381 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  30.89 
 
 		 459 aa  127  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0383  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  31.55 
 
 		 337 aa  127  5e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  31.11 
 
 		 430 aa  126  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  30.05 
 
 		 357 aa  126  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  31.58 
 
 		 415 aa  126  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  32.48 
 
 		 366 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  30.99 
 
 		 483 aa  123  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  28.42 
 
 		 471 aa  120  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  27.93 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  28.19 
 
 		 528 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  28.19 
 
 		 528 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.14 
 
 		 976 aa  118  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  28.85 
 
 		 997 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  28.43 
 
 		 531 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  29.34 
 
 		 348 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2194  beta-lactamase  31.43 
 
 		 334 aa  117  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.724545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3512  beta-lactamase  28.57 
 
 		 547 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265184  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  26.28 
 
 		 1003 aa  115  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  28.16 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  28.74 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0439  beta-lactamase  27.95 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0784108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  25.36 
 
 		 424 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  26.67 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  26.27 
 
 		 496 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0547  beta-lactamase  26.82 
 
 		 375 aa  106  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.727644  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  26.29 
 
 		 505 aa  106  9e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  31.15 
 
 		 369 aa  106  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  26.65 
 
 		 424 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  27.76 
 
 		 427 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  25.97 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3459  beta-lactamase  26.79 
 
 		 394 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213623 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1251  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  27.09 
 
 		 377 aa  104  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000135632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4807  beta-lactamase  26.02 
 
 		 434 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  25.99 
 
 		 613 aa  103  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  25.18 
 
 		 424 aa  103  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  24.59 
 
 		 431 aa  103  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  24.19 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  26.03 
 
 		 420 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  25.19 
 
 		 438 aa  100  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2506  beta-lactamase  29.7 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>