More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2708 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.01 
 
 
976 aa  717    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.71 
 
 
1018 aa  741    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  100 
 
 
992 aa  2053    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.61 
 
 
953 aa  717    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  40.85 
 
 
971 aa  788    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  42.67 
 
 
990 aa  759    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  40.89 
 
 
997 aa  728    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  42.02 
 
 
1012 aa  729    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  60.74 
 
 
1002 aa  1217    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  39.15 
 
 
1007 aa  734    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  35.14 
 
 
966 aa  559  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  33.13 
 
 
1003 aa  522  1e-146  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.64 
 
 
568 aa  507  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  36.64 
 
 
597 aa  349  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  37.46 
 
 
603 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.6 
 
 
583 aa  299  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  33.21 
 
 
589 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.93 
 
 
573 aa  285  4.0000000000000003e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  32.97 
 
 
585 aa  284  6.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.34 
 
 
591 aa  282  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2118  glycoside hydrolase family 3 protein  33.33 
 
 
537 aa  268  4e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.44 
 
 
698 aa  267  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.56 
 
 
582 aa  264  6e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  31.19 
 
 
592 aa  257  7e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  29.98 
 
 
604 aa  251  4e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  32.66 
 
 
520 aa  251  6e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  29.62 
 
 
624 aa  241  5e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.23 
 
 
596 aa  241  5.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.76 
 
 
600 aa  237  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.1 
 
 
528 aa  234  6e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.86 
 
 
534 aa  230  8e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.86 
 
 
534 aa  230  8e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.64 
 
 
537 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.8 
 
 
552 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  38.89 
 
 
542 aa  228  4e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.76 
 
 
543 aa  228  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  27.87 
 
 
845 aa  221  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  35.41 
 
 
656 aa  221  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  36.39 
 
 
444 aa  218  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.03 
 
 
618 aa  217  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.32 
 
 
558 aa  215  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  36.06 
 
 
427 aa  214  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.05 
 
 
543 aa  211  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  29.82 
 
 
538 aa  207  1e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  29.34 
 
 
517 aa  207  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  30.57 
 
 
538 aa  206  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  28.52 
 
 
552 aa  206  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  35.71 
 
 
633 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4807  beta-lactamase  32.82 
 
 
434 aa  201  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.98 
 
 
580 aa  201  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  31.51 
 
 
631 aa  199  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  35.96 
 
 
511 aa  196  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  29.01 
 
 
541 aa  192  2e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  32.86 
 
 
543 aa  187  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.36 
 
 
484 aa  186  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  29.55 
 
 
699 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  29.38 
 
 
699 aa  185  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  29.22 
 
 
699 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  33.16 
 
 
365 aa  184  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.55 
 
 
365 aa  184  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.55 
 
 
365 aa  184  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1600  beta-hexosamidase A  31.11 
 
 
586 aa  183  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.592664  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  38.34 
 
 
498 aa  183  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  29.31 
 
 
699 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  36.1 
 
 
365 aa  182  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  36.23 
 
 
503 aa  182  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  38.34 
 
 
499 aa  181  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.92 
 
 
511 aa  182  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  32.99 
 
 
637 aa  180  9e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.56 
 
 
426 aa  180  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  30.31 
 
 
385 aa  179  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26161  beta-N-acetylglucosaminidase  38.25 
 
 
549 aa  179  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  30.46 
 
 
395 aa  177  9e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  31.06 
 
 
379 aa  177  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  31.22 
 
 
688 aa  177  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  35.16 
 
 
492 aa  175  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.85 
 
 
594 aa  174  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  29.43 
 
 
379 aa  174  5.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.26 
 
 
598 aa  174  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  34.93 
 
 
673 aa  173  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  29.06 
 
 
381 aa  172  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1481  beta-N-acetylhexosaminidase  34.08 
 
 
544 aa  171  5e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.152176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  32.21 
 
 
793 aa  171  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  31.25 
 
 
379 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.21 
 
 
387 aa  169  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01861  beta-N-acetylglucosaminidase  34.14 
 
 
544 aa  169  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  30.99 
 
 
520 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  30.34 
 
 
557 aa  166  3e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  29.97 
 
 
420 aa  164  9e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  33.73 
 
 
374 aa  163  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  33.1 
 
 
363 aa  162  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  35.42 
 
 
361 aa  162  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.98 
 
 
373 aa  161  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.66 
 
 
375 aa  160  8e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  30.08 
 
 
734 aa  160  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  35.71 
 
 
370 aa  160  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  35.97 
 
 
490 aa  160  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.67 
 
 
490 aa  159  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  30.97 
 
 
395 aa  158  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.57 
 
 
478 aa  158  5.0000000000000005e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>