More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1690 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  100 
 
 		 426 aa  871    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  44.01 
 
 		 424 aa  329  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  42.89 
 
 		 447 aa  321  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  42.65 
 
 		 433 aa  311  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  44.74 
 
 		 414 aa  310  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  43 
 
 		 445 aa  303  4.0000000000000003e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  42.61 
 
 		 406 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  43 
 
 		 405 aa  282  9e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  43 
 
 		 405 aa  282  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  39.95 
 
 		 420 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  39.46 
 
 		 420 aa  279  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  38.5 
 
 		 408 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  37.73 
 
 		 419 aa  273  3e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  38.98 
 
 		 427 aa  273  5.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  37.71 
 
 		 422 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  37.79 
 
 		 424 aa  268  8.999999999999999e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  41.18 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  42.49 
 
 		 613 aa  268  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  41.53 
 
 		 370 aa  268  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  38.75 
 
 		 454 aa  265  8e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  36.77 
 
 		 424 aa  265  8.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  42.23 
 
 		 417 aa  265  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  41.5 
 
 		 405 aa  264  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  39.61 
 
 		 418 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  38.65 
 
 		 417 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  37.86 
 
 		 424 aa  258  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  40.14 
 
 		 420 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  40.14 
 
 		 420 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  38.95 
 
 		 411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  39.05 
 
 		 414 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  38.81 
 
 		 411 aa  252  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  38.68 
 
 		 402 aa  249  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  39.13 
 
 		 420 aa  249  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  41.19 
 
 		 407 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  38.82 
 
 		 438 aa  246  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  38.34 
 
 		 415 aa  245  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  38.73 
 
 		 410 aa  245  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  38.67 
 
 		 440 aa  243  5e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  38.69 
 
 		 414 aa  242  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  38.97 
 
 		 423 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  38.2 
 
 		 453 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  38.68 
 
 		 438 aa  236  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  37.9 
 
 		 430 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  37.84 
 
 		 408 aa  230  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  36.34 
 
 		 435 aa  230  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  36.73 
 
 		 407 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  37.27 
 
 		 418 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  35.79 
 
 		 407 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  36.79 
 
 		 407 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  39.69 
 
 		 427 aa  226  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  38.85 
 
 		 430 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  37.62 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  37.15 
 
 		 422 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  34.85 
 
 		 431 aa  223  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  36.12 
 
 		 431 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  36.63 
 
 		 399 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  36.98 
 
 		 438 aa  220  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  38.66 
 
 		 425 aa  219  6e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  35.93 
 
 		 452 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  36.94 
 
 		 444 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  38.05 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  37.34 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  38.1 
 
 		 401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  38.56 
 
 		 440 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  36.5 
 
 		 426 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  35.71 
 
 		 411 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2338  beta-lactamase  35.85 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461598  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  36.25 
 
 		 412 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  36 
 
 		 409 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  37.59 
 
 		 437 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  36.72 
 
 		 401 aa  207  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  37.27 
 
 		 401 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  37.27 
 
 		 401 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  37.27 
 
 		 401 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  36.36 
 
 		 401 aa  204  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0019  beta-lactamase  34.86 
 
 		 416 aa  199  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  37.99 
 
 		 422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  33.17 
 
 		 468 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2251  beta-lactamase  32.11 
 
 		 432 aa  186  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  32.15 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  32.2 
 
 		 409 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  33.09 
 
 		 395 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  32.2 
 
 		 395 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  37.03 
 
 		 431 aa  172  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  31.95 
 
 		 395 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  32.63 
 
 		 397 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2265  twin-arginine translocation pathway signal  33.77 
 
 		 428 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  34.13 
 
 		 409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  33.99 
 
 		 398 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  33.99 
 
 		 398 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  31.09 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  32.38 
 
 		 391 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2676  Beta-lactamase  32.9 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  32.21 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4045  beta-lactamase  30.75 
 
 		 393 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2613  beta-lactamase  33.5 
 
 		 398 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0035  putative beta-lactamase  31.68 
 
 		 397 aa  152  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3476  beta-lactamase  30.5 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  32.26 
 
 		 394 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  32.18 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>