More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11048 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  40.25 
 
 		 1007 aa  732    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  40.85 
 
 		 992 aa  788    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  41 
 
 		 1012 aa  733    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.24 
 
 		 1002 aa  746    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  52.59 
 
 		 997 aa  1033    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  100 
 
 		 971 aa  2008    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.73 
 
 		 1018 aa  746    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  43.53 
 
 		 990 aa  784    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.02 
 
 		 953 aa  715    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.07 
 
 		 976 aa  1047    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  34.5 
 
 		 1003 aa  590  1e-167  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  34.34 
 
 		 966 aa  557  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.67 
 
 		 568 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  35.17 
 
 		 603 aa  334  6e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  33.73 
 
 		 597 aa  323  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.51 
 
 		 583 aa  308  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  33.89 
 
 		 585 aa  280  6e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.62 
 
 		 573 aa  277  8e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.46 
 
 		 591 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  32.77 
 
 		 589 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.62 
 
 		 582 aa  262  3e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  33.89 
 
 		 592 aa  260  9e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  31.62 
 
 		 604 aa  260  9e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  31.13 
 
 		 624 aa  259  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.11 
 
 		 543 aa  258  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.17 
 
 		 698 aa  257  6e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2118  glycoside hydrolase family 3 protein  32.34 
 
 		 537 aa  249  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.24 
 
 		 596 aa  239  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.19 
 
 		 528 aa  237  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  30.05 
 
 		 552 aa  232  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.48 
 
 		 600 aa  228  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  39.88 
 
 		 542 aa  228  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  32.6 
 
 		 520 aa  226  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.7 
 
 		 558 aa  226  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.07 
 
 		 543 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.17 
 
 		 618 aa  221  5e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4807  beta-lactamase  31.84 
 
 		 434 aa  221  6e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  35.73 
 
 		 427 aa  219  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  28.55 
 
 		 845 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.15 
 
 		 534 aa  217  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.15 
 
 		 534 aa  217  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  34.78 
 
 		 656 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  35.39 
 
 		 444 aa  214  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.83 
 
 		 552 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.97 
 
 		 537 aa  212  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.23 
 
 		 580 aa  210  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.15 
 
 		 426 aa  206  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1600  beta-hexosamidase A  31.31 
 
 		 586 aa  205  3e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.592664  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  34 
 
 		 631 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  29.32 
 
 		 633 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.44 
 
 		 511 aa  198  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  31.09 
 
 		 385 aa  198  5.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  36.1 
 
 		 511 aa  197  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  29.89 
 
 		 541 aa  197  8.000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  33.23 
 
 		 538 aa  197  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  37.32 
 
 		 538 aa  196  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  27.66 
 
 		 517 aa  192  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  38.68 
 
 		 543 aa  192  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  34.59 
 
 		 520 aa  192  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  34.87 
 
 		 420 aa  191  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26161  beta-N-acetylglucosaminidase  38.35 
 
 		 549 aa  187  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  30.41 
 
 		 381 aa  187  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  30.15 
 
 		 395 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  29.7 
 
 		 379 aa  184  7e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  30.65 
 
 		 379 aa  184  8.000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  30.48 
 
 		 379 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.09 
 
 		 594 aa  182  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  40.59 
 
 		 499 aa  181  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  41.58 
 
 		 498 aa  180  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  37.14 
 
 		 490 aa  178  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  28.96 
 
 		 779 aa  177  9e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  30.03 
 
 		 793 aa  175  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  32.66 
 
 		 637 aa  172  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.59 
 
 		 504 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  29.08 
 
 		 381 aa  172  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.91 
 
 		 365 aa  172  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  33.56 
 
 		 503 aa  172  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.91 
 
 		 365 aa  172  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0705  glycosy hydrolase family protein  28.25 
 
 		 596 aa  172  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  31.68 
 
 		 365 aa  172  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.35 
 
 		 387 aa  169  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  28.46 
 
 		 759 aa  169  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  30.77 
 
 		 452 aa  169  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  33.23 
 
 		 365 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  30.77 
 
 		 428 aa  169  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.78 
 
 		 573 aa  169  2.9999999999999998e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.88 
 
 		 379 aa  168  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.96 
 
 		 484 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  28.22 
 
 		 734 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01861  beta-N-acetylglucosaminidase  30.38 
 
 		 544 aa  167  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.09 
 
 		 490 aa  165  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1481  beta-N-acetylhexosaminidase  30.59 
 
 		 544 aa  165  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.152176  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  27.4 
 
 		 699 aa  164  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.34 
 
 		 598 aa  162  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  27.23 
 
 		 673 aa  162  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  31.21 
 
 		 375 aa  162  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4486  glycoside hydrolase family 3 protein  35.17 
 
 		 468 aa  161  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  28.47 
 
 		 699 aa  161  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  28.47 
 
 		 699 aa  161  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.36 
 
 		 373 aa  160  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>