More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6218 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  60.23 
 
 		 796 aa  884    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  100 
 
 		 792 aa  1535    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  53.28 
 
 		 784 aa  757    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  74.3 
 
 		 790 aa  1075    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  60.23 
 
 		 796 aa  884    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  87.83 
 
 		 785 aa  1274    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  40.97 
 
 		 793 aa  523  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  45.9 
 
 		 452 aa  326  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  46.34 
 
 		 428 aa  324  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1366  hypothetical protein  42.9 
 
 		 391 aa  263  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.092066  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3234  hypothetical protein  37.69 
 
 		 488 aa  240  8e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2096  hypothetical protein  35.97 
 
 		 403 aa  240  1e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.846287  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1452  hypothetical protein  41.22 
 
 		 413 aa  227  6e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.535979  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2217  hypothetical protein  40.82 
 
 		 430 aa  227  6e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.310797  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  40.12 
 
 		 390 aa  225  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1547  hypothetical protein  41.03 
 
 		 413 aa  224  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0404742  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  37.06 
 
 		 391 aa  220  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3179  hypothetical protein  37.94 
 
 		 444 aa  220  7e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0164032  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1984  hypothetical protein  41.41 
 
 		 390 aa  220  8.999999999999998e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000750429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  39.58 
 
 		 392 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2411  hypothetical protein  39.9 
 
 		 413 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1513  hypothetical protein  39.64 
 
 		 388 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1081  hypothetical protein  38.01 
 
 		 417 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7058500000000006e-24 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1462  hypothetical protein  38.42 
 
 		 417 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  42.24 
 
 		 566 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  40.4 
 
 		 966 aa  214  7e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1897  hypothetical protein  33.85 
 
 		 385 aa  213  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.167595  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0233  hypothetical protein  33.59 
 
 		 386 aa  208  4e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  33.86 
 
 		 483 aa  206  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2008  hypothetical protein  34.88 
 
 		 388 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  36.24 
 
 		 381 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  36.9 
 
 		 395 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3717  hypothetical protein  36.34 
 
 		 390 aa  202  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1124  hypothetical protein  35.26 
 
 		 381 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0535  hypothetical protein  38.37 
 
 		 390 aa  199  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  36.46 
 
 		 408 aa  198  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  38.08 
 
 		 582 aa  197  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  35.6 
 
 		 381 aa  195  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  35.96 
 
 		 459 aa  195  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0955  hypothetical protein  35.98 
 
 		 407 aa  193  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2762  hypothetical protein  32.71 
 
 		 388 aa  192  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  39.58 
 
 		 416 aa  192  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  36.03 
 
 		 430 aa  191  5e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1185  hypothetical protein  35.88 
 
 		 476 aa  191  5e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0628  hypothetical protein  36.96 
 
 		 442 aa  189  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1365  hypothetical protein  33.77 
 
 		 418 aa  188  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  36.49 
 
 		 574 aa  187  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1396  hypothetical protein  35.82 
 
 		 397 aa  187  9e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.32411  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4806  hypothetical protein  34.62 
 
 		 379 aa  185  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1114  hypothetical protein  35.91 
 
 		 413 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0483  hypothetical protein  30.16 
 
 		 384 aa  183  9.000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.33087  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  34.22 
 
 		 379 aa  182  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0262  hypothetical protein  31.27 
 
 		 387 aa  182  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.96944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0194  hypothetical protein  30.93 
 
 		 386 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  37.27 
 
 		 717 aa  181  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0231  hypothetical protein  34.88 
 
 		 432 aa  181  4.999999999999999e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1198  hypothetical protein  35.82 
 
 		 417 aa  181  4.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1074  hypothetical protein  35.91 
 
 		 405 aa  180  8e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.408971  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4816  hypothetical protein  32.13 
 
 		 399 aa  180  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.786963  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  40.61 
 
 		 381 aa  179  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  34.69 
 
 		 381 aa  177  5e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00140  hypothetical protein  28.67 
 
 		 421 aa  177  6e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  32.08 
 
 		 471 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4513  hypothetical protein  38.04 
 
 		 393 aa  176  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.710596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  38.14 
 
 		 529 aa  175  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0459  hypothetical protein  39.07 
 
 		 390 aa  175  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0229  hypothetical protein  31.82 
 
 		 390 aa  175  3.9999999999999995e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.925038 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2124  hypothetical protein  31.32 
 
 		 405 aa  174  3.9999999999999995e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000646964  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  34.93 
 
 		 385 aa  174  7.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  34.35 
 
 		 379 aa  172  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  40.21 
 
 		 379 aa  171  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00594  putative lipoprotein  42.2 
 
 		 449 aa  171  5e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  33.25 
 
 		 496 aa  171  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1364  hypothetical protein  33.71 
 
 		 420 aa  169  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000043565  normal  0.463886 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  35.33 
 
 		 395 aa  170  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35960  hypothetical protein  35.57 
 
 		 423 aa  169  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal  0.373005 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1786  hypothetical protein  38.93 
 
 		 469 aa  169  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1571  hypothetical protein  39.68 
 
 		 424 aa  169  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0240807  normal  0.246584 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1662  hypothetical protein  38.79 
 
 		 370 aa  168  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.739394  normal  0.154555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2120  hypothetical protein  31.06 
 
 		 409 aa  167  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2877  hypothetical protein  34.7 
 
 		 401 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2357  hypothetical protein  35.03 
 
 		 387 aa  167  6.9999999999999995e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  40.41 
 
 		 361 aa  167  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  37.07 
 
 		 360 aa  167  8e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1224  hypothetical protein  31.75 
 
 		 408 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367395  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0894  hypothetical protein  34.62 
 
 		 410 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4167  hypothetical protein  30.59 
 
 		 391 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181504  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0616  hypothetical protein  35.93 
 
 		 407 aa  164  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  37.99 
 
 		 354 aa  162  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  32.55 
 
 		 528 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  32.55 
 
 		 528 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  32.55 
 
 		 531 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0923  hypothetical protein  29.5 
 
 		 418 aa  161  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.808008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  38.49 
 
 		 366 aa  160  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4819  hypothetical protein  28.61 
 
 		 420 aa  160  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.389749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2755  hypothetical protein  38.87 
 
 		 399 aa  160  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0205  hypothetical protein  30.51 
 
 		 387 aa  160  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3541  hypothetical protein  29.87 
 
 		 409 aa  159  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383323  normal  0.81555 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1659  hypothetical protein  41.25 
 
 		 340 aa  157  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.186474  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2596  hypothetical protein  39.46 
 
 		 367 aa  156  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>