74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1547 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1462  hypothetical protein  84.99 
 
 
417 aa  659    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1547  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  813    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0404742  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1452  hypothetical protein  98.23 
 
 
413 aa  763    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.535979  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2411  hypothetical protein  97.22 
 
 
413 aa  746    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3717  hypothetical protein  56.3 
 
 
390 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1366  hypothetical protein  49.44 
 
 
391 aa  359  5e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.092066  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1365  hypothetical protein  47.78 
 
 
418 aa  331  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173694  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2762  hypothetical protein  44.87 
 
 
388 aa  325  1e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0628  hypothetical protein  46.59 
 
 
442 aa  319  6e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2008  hypothetical protein  46.02 
 
 
388 aa  317  2e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0233  hypothetical protein  43.7 
 
 
386 aa  317  3e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0535  hypothetical protein  45.66 
 
 
390 aa  317  3e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0262  hypothetical protein  42.82 
 
 
387 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.96944  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0194  hypothetical protein  43.7 
 
 
386 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1984  hypothetical protein  43.37 
 
 
390 aa  300  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000750429  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1662  hypothetical protein  51.92 
 
 
370 aa  300  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.739394  normal  0.154555 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35960  hypothetical protein  47.06 
 
 
423 aa  300  4e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal  0.373005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5695  hypothetical protein  49.19 
 
 
381 aa  295  9e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2217  hypothetical protein  44.86 
 
 
430 aa  294  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.310797  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2357  hypothetical protein  42.56 
 
 
387 aa  292  6e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2096  hypothetical protein  39.34 
 
 
403 aa  292  9e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.846287  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0271  hypothetical protein  46.75 
 
 
443 aa  289  6e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2755  hypothetical protein  46.88 
 
 
399 aa  288  9e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47118  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  39.07 
 
 
793 aa  278  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0205  hypothetical protein  41.28 
 
 
387 aa  277  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1513  hypothetical protein  39.95 
 
 
388 aa  277  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1124  hypothetical protein  36.32 
 
 
381 aa  264  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1081  hypothetical protein  41.65 
 
 
417 aa  263  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7058500000000006e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3179  hypothetical protein  41.73 
 
 
444 aa  263  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0164032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3234  hypothetical protein  39.6 
 
 
488 aa  257  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  42.49 
 
 
784 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0616  hypothetical protein  42.34 
 
 
407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1393  hypothetical protein  44.42 
 
 
416 aa  251  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0125178  normal  0.499824 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2877  hypothetical protein  41.79 
 
 
401 aa  248  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1897  hypothetical protein  39.57 
 
 
385 aa  248  2e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.167595  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  41.73 
 
 
796 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  41.73 
 
 
796 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2098  hypothetical protein  39.33 
 
 
400 aa  238  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0323698  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1198  hypothetical protein  39.84 
 
 
417 aa  238  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0955  hypothetical protein  40 
 
 
407 aa  238  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4513  hypothetical protein  41.43 
 
 
393 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.710596  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  41.33 
 
 
792 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3713  hypothetical protein  38.07 
 
 
404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.120862 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1396  hypothetical protein  39.33 
 
 
397 aa  234  3e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.32411  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2596  hypothetical protein  48.67 
 
 
367 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1646  hypothetical protein  39.29 
 
 
402 aa  233  5e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1074  hypothetical protein  40 
 
 
405 aa  230  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.408971  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1364  hypothetical protein  41.44 
 
 
420 aa  228  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000043565  normal  0.463886 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1114  hypothetical protein  37.56 
 
 
413 aa  227  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  41.18 
 
 
785 aa  226  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0483  hypothetical protein  36.31 
 
 
384 aa  226  7e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.33087  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1185  hypothetical protein  40 
 
 
476 aa  225  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  39.69 
 
 
790 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4816  hypothetical protein  31.49 
 
 
399 aa  219  7e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.786963  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  34.53 
 
 
529 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4806  hypothetical protein  33.42 
 
 
379 aa  218  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4167  hypothetical protein  38.1 
 
 
391 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181504  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0459  hypothetical protein  39.82 
 
 
390 aa  215  9e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20200  hypothetical protein  43.53 
 
 
380 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1224  hypothetical protein  35.17 
 
 
408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367395  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00140  hypothetical protein  32.93 
 
 
421 aa  213  5.999999999999999e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0231  hypothetical protein  36.29 
 
 
432 aa  213  5.999999999999999e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3541  hypothetical protein  32.27 
 
 
409 aa  212  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383323  normal  0.81555 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1659  hypothetical protein  45.85 
 
 
340 aa  212  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.186474  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1571  hypothetical protein  33.41 
 
 
424 aa  207  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0240807  normal  0.246584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0923  hypothetical protein  31.63 
 
 
418 aa  206  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.808008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4819  hypothetical protein  33.07 
 
 
420 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.389749  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00594  putative lipoprotein  34.1 
 
 
449 aa  202  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2120  hypothetical protein  33.57 
 
 
409 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2124  hypothetical protein  31.43 
 
 
405 aa  196  7e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000646964  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2880  putative lipoprotein  33.58 
 
 
398 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0229  hypothetical protein  31.48 
 
 
390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.925038 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1786  hypothetical protein  34.63 
 
 
469 aa  173  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0894  hypothetical protein  32.68 
 
 
410 aa  169  1e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>