More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0925 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  75.68 
 
 
785 aa  1059    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  100 
 
 
790 aa  1526    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  53.22 
 
 
784 aa  756    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  61.73 
 
 
796 aa  926    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  74.05 
 
 
792 aa  1093    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  61.73 
 
 
796 aa  926    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  41.15 
 
 
793 aa  528  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  45.22 
 
 
452 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  45.28 
 
 
428 aa  337  5.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1366  hypothetical protein  41.91 
 
 
391 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.092066  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2096  hypothetical protein  37.6 
 
 
403 aa  252  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.846287  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3234  hypothetical protein  38.36 
 
 
488 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  43.17 
 
 
390 aa  239  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2217  hypothetical protein  39.54 
 
 
430 aa  237  8e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.310797  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1452  hypothetical protein  40.2 
 
 
413 aa  228  4e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.535979  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1462  hypothetical protein  39.44 
 
 
417 aa  228  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  41.92 
 
 
966 aa  227  7e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3179  hypothetical protein  38.83 
 
 
444 aa  223  8e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0164032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1081  hypothetical protein  39.09 
 
 
417 aa  222  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7058500000000006e-24 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1547  hypothetical protein  39.39 
 
 
413 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0404742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  40.06 
 
 
395 aa  219  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1897  hypothetical protein  35.6 
 
 
385 aa  219  2e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.167595  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2411  hypothetical protein  40.15 
 
 
413 aa  219  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  36.69 
 
 
391 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1984  hypothetical protein  37.27 
 
 
390 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000750429  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1124  hypothetical protein  34.55 
 
 
381 aa  214  7e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2008  hypothetical protein  35.99 
 
 
388 aa  213  7.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  37.98 
 
 
392 aa  213  9e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0233  hypothetical protein  33.33 
 
 
386 aa  207  5e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  36.62 
 
 
430 aa  207  6e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  41.92 
 
 
416 aa  206  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  38.72 
 
 
483 aa  206  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1513  hypothetical protein  37.1 
 
 
388 aa  205  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  39.71 
 
 
582 aa  204  5e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0535  hypothetical protein  39.04 
 
 
390 aa  204  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3717  hypothetical protein  36.34 
 
 
390 aa  203  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0628  hypothetical protein  37.8 
 
 
442 aa  200  9e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2124  hypothetical protein  34.25 
 
 
405 aa  199  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000646964  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1114  hypothetical protein  35.94 
 
 
413 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1198  hypothetical protein  34.81 
 
 
417 aa  198  3e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  37.78 
 
 
408 aa  198  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  39.21 
 
 
459 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4806  hypothetical protein  34.51 
 
 
379 aa  197  7e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  42.05 
 
 
566 aa  196  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2762  hypothetical protein  32.7 
 
 
388 aa  195  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0955  hypothetical protein  33.76 
 
 
407 aa  195  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  36.97 
 
 
574 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4816  hypothetical protein  31.65 
 
 
399 aa  195  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.786963  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1185  hypothetical protein  37.43 
 
 
476 aa  194  5e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  35.64 
 
 
381 aa  193  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1396  hypothetical protein  35.42 
 
 
397 aa  192  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.32411  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1571  hypothetical protein  31.75 
 
 
424 aa  192  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0240807  normal  0.246584 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  41.1 
 
 
381 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00140  hypothetical protein  30.38 
 
 
421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  36.29 
 
 
379 aa  191  5.999999999999999e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0194  hypothetical protein  31.96 
 
 
386 aa  189  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0483  hypothetical protein  31.64 
 
 
384 aa  189  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.33087  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  35.27 
 
 
471 aa  189  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  35.81 
 
 
381 aa  188  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  35.57 
 
 
529 aa  187  8e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  41.92 
 
 
379 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00594  putative lipoprotein  33.68 
 
 
449 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0262  hypothetical protein  34.36 
 
 
387 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.96944  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0231  hypothetical protein  35.58 
 
 
432 aa  186  2.0000000000000003e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1365  hypothetical protein  32.55 
 
 
418 aa  183  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173694  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0923  hypothetical protein  30.52 
 
 
418 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.808008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4819  hypothetical protein  29.88 
 
 
420 aa  182  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.389749  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  33.73 
 
 
381 aa  181  5.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1364  hypothetical protein  33.51 
 
 
420 aa  180  8e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000043565  normal  0.463886 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1786  hypothetical protein  41.94 
 
 
469 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1662  hypothetical protein  41.38 
 
 
370 aa  179  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.739394  normal  0.154555 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4167  hypothetical protein  32.71 
 
 
391 aa  179  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181504  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  33.71 
 
 
531 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2357  hypothetical protein  33.06 
 
 
387 aa  178  4e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  35.44 
 
 
496 aa  177  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  33.86 
 
 
379 aa  177  8e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  35.37 
 
 
395 aa  177  8e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3541  hypothetical protein  31.37 
 
 
409 aa  177  9e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383323  normal  0.81555 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0383  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  35.82 
 
 
337 aa  176  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1074  hypothetical protein  32.38 
 
 
405 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.408971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2120  hypothetical protein  33.07 
 
 
409 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  33.56 
 
 
528 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  33.56 
 
 
528 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  36.88 
 
 
385 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  36.7 
 
 
717 aa  174  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1224  hypothetical protein  32.03 
 
 
408 aa  174  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367395  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0229  hypothetical protein  32.49 
 
 
390 aa  173  1e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.925038 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  38.64 
 
 
360 aa  172  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  38.58 
 
 
354 aa  172  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35960  hypothetical protein  35.23 
 
 
423 aa  172  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal  0.373005 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0459  hypothetical protein  32.82 
 
 
390 aa  170  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0894  hypothetical protein  34.83 
 
 
410 aa  169  2e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4513  hypothetical protein  37.74 
 
 
393 aa  168  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.710596  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  41.09 
 
 
361 aa  167  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2880  putative lipoprotein  38.35 
 
 
398 aa  167  6.9999999999999995e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  37.77 
 
 
591 aa  167  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1850  Beta-lactamase class C or other penicillin binding protein  33.68 
 
 
338 aa  166  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000532294  hitchhiker  0.000116253 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0205  hypothetical protein  33.6 
 
 
387 aa  164  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2596  hypothetical protein  39.8 
 
 
367 aa  164  9e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2877  hypothetical protein  35.18 
 
 
401 aa  161  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>