74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1396 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1396  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  812    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.32411  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1198  hypothetical protein  61.44 
 
 
417 aa  503  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0955  hypothetical protein  57.76 
 
 
407 aa  462  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1074  hypothetical protein  56.6 
 
 
405 aa  449  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.408971  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1185  hypothetical protein  55.92 
 
 
476 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1364  hypothetical protein  54.5 
 
 
420 aa  396  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000043565  normal  0.463886 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1114  hypothetical protein  51.75 
 
 
413 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1366  hypothetical protein  42.13 
 
 
391 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.092066  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2217  hypothetical protein  40.16 
 
 
430 aa  256  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.310797  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2008  hypothetical protein  37.8 
 
 
388 aa  242  7e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2096  hypothetical protein  35.41 
 
 
403 aa  240  2.9999999999999997e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.846287  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0535  hypothetical protein  39.94 
 
 
390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1365  hypothetical protein  36.29 
 
 
418 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173694  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2762  hypothetical protein  36.46 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  40.12 
 
 
784 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0194  hypothetical protein  37.17 
 
 
386 aa  233  5e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0233  hypothetical protein  36.41 
 
 
386 aa  231  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1452  hypothetical protein  40.05 
 
 
413 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.535979  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1081  hypothetical protein  37.66 
 
 
417 aa  229  6e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7058500000000006e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3179  hypothetical protein  37.31 
 
 
444 aa  229  8e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0164032  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1897  hypothetical protein  33.87 
 
 
385 aa  224  1e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.167595  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1547  hypothetical protein  39.38 
 
 
413 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0404742  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1462  hypothetical protein  37.66 
 
 
417 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  36.9 
 
 
793 aa  223  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1513  hypothetical protein  35.13 
 
 
388 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2411  hypothetical protein  38.5 
 
 
413 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3717  hypothetical protein  38.32 
 
 
390 aa  216  5.9999999999999996e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1662  hypothetical protein  36.57 
 
 
370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.739394  normal  0.154555 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0262  hypothetical protein  34.62 
 
 
387 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.96944  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2755  hypothetical protein  34.46 
 
 
399 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47118  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2357  hypothetical protein  36.64 
 
 
387 aa  202  7e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1124  hypothetical protein  34.04 
 
 
381 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35960  hypothetical protein  35.53 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal  0.373005 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0628  hypothetical protein  33.82 
 
 
442 aa  200  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3713  hypothetical protein  34.37 
 
 
404 aa  199  9e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.120862 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0616  hypothetical protein  33.77 
 
 
407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1646  hypothetical protein  34.5 
 
 
402 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0205  hypothetical protein  36.39 
 
 
387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1984  hypothetical protein  32.45 
 
 
390 aa  196  6e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000750429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5695  hypothetical protein  35.85 
 
 
381 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  35.5 
 
 
796 aa  193  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  35.5 
 
 
796 aa  193  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0459  hypothetical protein  33.91 
 
 
390 aa  192  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3234  hypothetical protein  31.35 
 
 
488 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1571  hypothetical protein  32.71 
 
 
424 aa  190  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0240807  normal  0.246584 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2877  hypothetical protein  33.66 
 
 
401 aa  189  5e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  36.39 
 
 
785 aa  189  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0271  hypothetical protein  31.75 
 
 
443 aa  189  9e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  35.82 
 
 
792 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2880  putative lipoprotein  31.31 
 
 
398 aa  186  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  32.96 
 
 
529 aa  184  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2124  hypothetical protein  31.12 
 
 
405 aa  181  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000646964  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0483  hypothetical protein  33.97 
 
 
384 aa  182  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.33087  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  35.42 
 
 
790 aa  179  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2596  hypothetical protein  34.63 
 
 
367 aa  179  8e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4167  hypothetical protein  34.06 
 
 
391 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181504  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1393  hypothetical protein  34.44 
 
 
416 aa  176  8e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0125178  normal  0.499824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4513  hypothetical protein  34.29 
 
 
393 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.710596  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00140  hypothetical protein  31.09 
 
 
421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3541  hypothetical protein  30.05 
 
 
409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383323  normal  0.81555 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2098  hypothetical protein  32.29 
 
 
400 aa  172  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0323698  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1224  hypothetical protein  31.56 
 
 
408 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367395  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0923  hypothetical protein  29.61 
 
 
418 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.808008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4819  hypothetical protein  29.87 
 
 
420 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.389749  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0231  hypothetical protein  32.05 
 
 
432 aa  166  9e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00594  putative lipoprotein  31.93 
 
 
449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4816  hypothetical protein  29.22 
 
 
399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.786963  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4806  hypothetical protein  28.15 
 
 
379 aa  166  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2120  hypothetical protein  29.92 
 
 
409 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0894  hypothetical protein  29.02 
 
 
410 aa  154  2e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0229  hypothetical protein  29.47 
 
 
390 aa  154  4e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.925038 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20200  hypothetical protein  32.13 
 
 
380 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1786  hypothetical protein  31.94 
 
 
469 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1659  hypothetical protein  35.63 
 
 
340 aa  149  8e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.186474  normal  0.443651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>