74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0271 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0271  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  875    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35960  hypothetical protein  68.67 
 
 		 423 aa  514  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal  0.373005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1365  hypothetical protein  55.24 
 
 		 418 aa  415  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0628  hypothetical protein  54.59 
 
 		 442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2755  hypothetical protein  50 
 
 		 399 aa  338  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5695  hypothetical protein  53.46 
 
 		 381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1662  hypothetical protein  50.95 
 
 		 370 aa  323  4e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.739394  normal  0.154555 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1462  hypothetical protein  45.16 
 
 		 417 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1452  hypothetical protein  47.12 
 
 		 413 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.535979  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1366  hypothetical protein  42.79 
 
 		 391 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.092066  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1547  hypothetical protein  46.97 
 
 		 413 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0404742  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2411  hypothetical protein  46.33 
 
 		 413 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2217  hypothetical protein  44.11 
 
 		 430 aa  278  9e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.310797  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3717  hypothetical protein  43.65 
 
 		 390 aa  276  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1393  hypothetical protein  44.83 
 
 		 416 aa  265  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0125178  normal  0.499824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4513  hypothetical protein  41.84 
 
 		 393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.710596  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2096  hypothetical protein  38.34 
 
 		 403 aa  251  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.846287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1081  hypothetical protein  40.95 
 
 		 417 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7058500000000006e-24 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1513  hypothetical protein  36.22 
 
 		 388 aa  239  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3179  hypothetical protein  39.85 
 
 		 444 aa  237  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0164032  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2120  hypothetical protein  37.24 
 
 		 409 aa  236  7e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1224  hypothetical protein  36.6 
 
 		 408 aa  226  6e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0233  hypothetical protein  35.01 
 
 		 386 aa  225  1e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0194  hypothetical protein  37.72 
 
 		 386 aa  225  1e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1124  hypothetical protein  35.2 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2008  hypothetical protein  37.87 
 
 		 388 aa  224  3e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1114  hypothetical protein  35.84 
 
 		 413 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20200  hypothetical protein  40.96 
 
 		 380 aa  221  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0955  hypothetical protein  36.48 
 
 		 407 aa  219  6e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2762  hypothetical protein  34.92 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0262  hypothetical protein  34.91 
 
 		 387 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.96944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4819  hypothetical protein  32.84 
 
 		 420 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.389749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1198  hypothetical protein  34.93 
 
 		 417 aa  212  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1364  hypothetical protein  36.62 
 
 		 420 aa  212  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000043565  normal  0.463886 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2357  hypothetical protein  35.88 
 
 		 387 aa  212  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1185  hypothetical protein  36.8 
 
 		 476 aa  211  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1074  hypothetical protein  36.07 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.408971  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1984  hypothetical protein  35.37 
 
 		 390 aa  209  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000750429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0535  hypothetical protein  38.18 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1571  hypothetical protein  32.34 
 
 		 424 aa  206  7e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0240807  normal  0.246584 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  35.43 
 
 		 793 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0923  hypothetical protein  30.96 
 
 		 418 aa  203  6e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.808008 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0205  hypothetical protein  35.43 
 
 		 387 aa  200  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1897  hypothetical protein  34.18 
 
 		 385 aa  201  3e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.167595  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4167  hypothetical protein  35.5 
 
 		 391 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181504  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00140  hypothetical protein  32.7 
 
 		 421 aa  200  5e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2596  hypothetical protein  35.17 
 
 		 367 aa  197  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0616  hypothetical protein  36.34 
 
 		 407 aa  196  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4816  hypothetical protein  31.44 
 
 		 399 aa  195  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.786963  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3234  hypothetical protein  34.5 
 
 		 488 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1646  hypothetical protein  37.05 
 
 		 402 aa  194  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3541  hypothetical protein  29.82 
 
 		 409 aa  194  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383323  normal  0.81555 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2880  putative lipoprotein  33.42 
 
 		 398 aa  193  6e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1396  hypothetical protein  31.94 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.32411  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2124  hypothetical protein  31.03 
 
 		 405 aa  188  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000646964  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0229  hypothetical protein  31.33 
 
 		 390 aa  187  4e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.925038 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4806  hypothetical protein  32.79 
 
 		 379 aa  186  6e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2877  hypothetical protein  35.99 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  32.75 
 
 		 529 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1659  hypothetical protein  39.78 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.186474  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  36.5 
 
 		 796 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  36.5 
 
 		 796 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0483  hypothetical protein  30.49 
 
 		 384 aa  182  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.33087  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0231  hypothetical protein  31.64 
 
 		 432 aa  182  1e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3713  hypothetical protein  33.68 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.120862 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00594  putative lipoprotein  31.66 
 
 		 449 aa  173  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2098  hypothetical protein  33.17 
 
 		 400 aa  173  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0323698  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  36.69 
 
 		 784 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0459  hypothetical protein  33.64 
 
 		 390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  35.71 
 
 		 785 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  34.83 
 
 		 792 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  34.03 
 
 		 790 aa  150  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0894  hypothetical protein  31.38 
 
 		 410 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1786  hypothetical protein  32.75 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>