More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4406 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  61.61 
 
 		 790 aa  904    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  60.48 
 
 		 792 aa  874    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  100 
 
 		 796 aa  1583    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  62.01 
 
 		 785 aa  852    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  100 
 
 		 796 aa  1583    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  50.56 
 
 		 784 aa  720    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  42.04 
 
 		 793 aa  523  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  50.42 
 
 		 428 aa  322  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  50.42 
 
 		 452 aa  321  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3234  hypothetical protein  42.08 
 
 		 488 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1366  hypothetical protein  41.72 
 
 		 391 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.092066  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2217  hypothetical protein  41.43 
 
 		 430 aa  252  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.310797  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  42.9 
 
 		 966 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2096  hypothetical protein  36.22 
 
 		 403 aa  238  4e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.846287  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1452  hypothetical protein  41.98 
 
 		 413 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.535979  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1462  hypothetical protein  40.82 
 
 		 417 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1547  hypothetical protein  41.43 
 
 		 413 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0404742  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1897  hypothetical protein  39.7 
 
 		 385 aa  229  2e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.167595  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2411  hypothetical protein  41.07 
 
 		 413 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  40.91 
 
 		 391 aa  225  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3179  hypothetical protein  37.82 
 
 		 444 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0164032  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1513  hypothetical protein  36.09 
 
 		 388 aa  219  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3717  hypothetical protein  36.34 
 
 		 390 aa  219  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1081  hypothetical protein  37.47 
 
 		 417 aa  219  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7058500000000006e-24 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  41.99 
 
 		 395 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  44.78 
 
 		 566 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  38.67 
 
 		 392 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  40.61 
 
 		 582 aa  213  7.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2762  hypothetical protein  36.01 
 
 		 388 aa  211  3e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1365  hypothetical protein  35.55 
 
 		 418 aa  211  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  38.37 
 
 		 390 aa  209  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0233  hypothetical protein  32.3 
 
 		 386 aa  208  3e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2008  hypothetical protein  34.1 
 
 		 388 aa  206  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  38.31 
 
 		 381 aa  206  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1364  hypothetical protein  35.86 
 
 		 420 aa  202  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000043565  normal  0.463886 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  36.64 
 
 		 574 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  37.82 
 
 		 381 aa  201  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1984  hypothetical protein  39.75 
 
 		 390 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000750429  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  35.39 
 
 		 395 aa  200  7e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0955  hypothetical protein  36.69 
 
 		 407 aa  200  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  37.16 
 
 		 379 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0194  hypothetical protein  37 
 
 		 386 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1114  hypothetical protein  34.38 
 
 		 413 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4806  hypothetical protein  32.8 
 
 		 379 aa  197  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0535  hypothetical protein  37.95 
 
 		 390 aa  197  8.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1198  hypothetical protein  34.03 
 
 		 417 aa  197  9e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  36.8 
 
 		 408 aa  196  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  41.64 
 
 		 416 aa  196  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0628  hypothetical protein  34.35 
 
 		 442 aa  196  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  36.83 
 
 		 483 aa  196  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0262  hypothetical protein  32.82 
 
 		 387 aa  194  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.96944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  37.46 
 
 		 379 aa  194  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1124  hypothetical protein  31.52 
 
 		 381 aa  194  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  34.75 
 
 		 430 aa  194  5e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2596  hypothetical protein  40.13 
 
 		 367 aa  193  8e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1396  hypothetical protein  35.5 
 
 		 397 aa  193  9e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.32411  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  38.85 
 
 		 459 aa  193  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1074  hypothetical protein  35.79 
 
 		 405 aa  192  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.408971  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  33.79 
 
 		 381 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2357  hypothetical protein  34.11 
 
 		 387 aa  192  2.9999999999999997e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  39.81 
 
 		 717 aa  192  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4816  hypothetical protein  32.2 
 
 		 399 aa  191  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.786963  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0483  hypothetical protein  31.35 
 
 		 384 aa  189  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.33087  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1662  hypothetical protein  39.26 
 
 		 370 aa  188  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.739394  normal  0.154555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2755  hypothetical protein  40.77 
 
 		 399 aa  188  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  38.95 
 
 		 354 aa  187  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  33.33 
 
 		 529 aa  187  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  35.28 
 
 		 379 aa  187  8e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1185  hypothetical protein  36.23 
 
 		 476 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1571  hypothetical protein  36.27 
 
 		 424 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0240807  normal  0.246584 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35960  hypothetical protein  36.5 
 
 		 423 aa  186  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal  0.373005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  33.77 
 
 		 528 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  33.77 
 
 		 528 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  35.09 
 
 		 471 aa  182  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  40.7 
 
 		 591 aa  182  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0205  hypothetical protein  31.83 
 
 		 387 aa  180  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0271  hypothetical protein  36.68 
 
 		 443 aa  179  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  36 
 
 		 366 aa  178  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1659  hypothetical protein  40.46 
 
 		 340 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.186474  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  32.16 
 
 		 531 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  39.58 
 
 		 361 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1786  hypothetical protein  44.58 
 
 		 469 aa  175  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2124  hypothetical protein  31.34 
 
 		 405 aa  175  2.9999999999999996e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000646964  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3541  hypothetical protein  29.44 
 
 		 409 aa  174  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383323  normal  0.81555 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  35.15 
 
 		 385 aa  173  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  33.74 
 
 		 496 aa  173  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  29.62 
 
 		 1012 aa  172  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4819  hypothetical protein  29.13 
 
 		 420 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.389749  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0231  hypothetical protein  33.33 
 
 		 432 aa  171  7e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00594  putative lipoprotein  29.56 
 
 		 449 aa  169  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  34.29 
 
 		 360 aa  169  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4167  hypothetical protein  32.61 
 
 		 391 aa  169  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181504  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  34.77 
 
 		 381 aa  169  2.9999999999999998e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0383  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  37.23 
 
 		 337 aa  168  4e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00140  hypothetical protein  28.78 
 
 		 421 aa  167  5e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0894  hypothetical protein  34.95 
 
 		 410 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4513  hypothetical protein  35.12 
 
 		 393 aa  167  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.710596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1850  Beta-lactamase class C or other penicillin binding protein  33.03 
 
 		 338 aa  166  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000532294  hitchhiker  0.000116253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5695  hypothetical protein  38.44 
 
 		 381 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2120  hypothetical protein  30.67 
 
 		 409 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>