74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2880 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2880  putative lipoprotein  100 
 
 		 398 aa  821    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4167  hypothetical protein  57.93 
 
 		 391 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181504  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0229  hypothetical protein  48.59 
 
 		 390 aa  377  1e-103  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.925038 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00140  hypothetical protein  47.94 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1571  hypothetical protein  49.06 
 
 		 424 aa  368  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0240807  normal  0.246584 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00594  putative lipoprotein  45.06 
 
 		 449 aa  356  3.9999999999999996e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4816  hypothetical protein  48.2 
 
 		 399 aa  354  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.786963  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2124  hypothetical protein  48.14 
 
 		 405 aa  353  2.9999999999999997e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000646964  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4806  hypothetical protein  49.18 
 
 		 379 aa  351  1e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0231  hypothetical protein  47.55 
 
 		 432 aa  350  2e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2120  hypothetical protein  43.95 
 
 		 409 aa  344  1e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1224  hypothetical protein  43.49 
 
 		 408 aa  342  5e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0923  hypothetical protein  47.47 
 
 		 418 aa  342  5e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.808008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4819  hypothetical protein  46.22 
 
 		 420 aa  331  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.389749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3541  hypothetical protein  42.56 
 
 		 409 aa  311  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383323  normal  0.81555 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2217  hypothetical protein  38.44 
 
 		 430 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.310797  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1081  hypothetical protein  37.34 
 
 		 417 aa  236  7e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7058500000000006e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3179  hypothetical protein  38.68 
 
 		 444 aa  233  6e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0164032  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1365  hypothetical protein  37.7 
 
 		 418 aa  223  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1897  hypothetical protein  36.53 
 
 		 385 aa  216  5e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.167595  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2096  hypothetical protein  41.3 
 
 		 403 aa  211  1e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.846287  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1366  hypothetical protein  39.32 
 
 		 391 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.092066  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0628  hypothetical protein  35.49 
 
 		 442 aa  206  8e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1513  hypothetical protein  34.76 
 
 		 388 aa  202  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1198  hypothetical protein  34.38 
 
 		 417 aa  202  7e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1114  hypothetical protein  36.1 
 
 		 413 aa  200  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3717  hypothetical protein  33.42 
 
 		 390 aa  199  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35960  hypothetical protein  34.72 
 
 		 423 aa  196  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal  0.373005 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1364  hypothetical protein  35.92 
 
 		 420 aa  196  6e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000043565  normal  0.463886 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0194  hypothetical protein  34.61 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0955  hypothetical protein  34.42 
 
 		 407 aa  192  7e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1462  hypothetical protein  34.13 
 
 		 417 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1185  hypothetical protein  35.77 
 
 		 476 aa  188  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2008  hypothetical protein  31.89 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0271  hypothetical protein  33.6 
 
 		 443 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3234  hypothetical protein  31.56 
 
 		 488 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1396  hypothetical protein  31.86 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.32411  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0233  hypothetical protein  33 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1547  hypothetical protein  33.78 
 
 		 413 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0404742  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1452  hypothetical protein  33.78 
 
 		 413 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.535979  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2762  hypothetical protein  32.07 
 
 		 388 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2411  hypothetical protein  35.01 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0205  hypothetical protein  33.75 
 
 		 387 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1074  hypothetical protein  32.69 
 
 		 405 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.408971  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2357  hypothetical protein  33.67 
 
 		 387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  32.37 
 
 		 529 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  34.03 
 
 		 793 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0262  hypothetical protein  32.73 
 
 		 387 aa  171  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.96944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1124  hypothetical protein  31.19 
 
 		 381 aa  170  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4513  hypothetical protein  33.42 
 
 		 393 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.710596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0535  hypothetical protein  40.08 
 
 		 390 aa  169  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1662  hypothetical protein  30.41 
 
 		 370 aa  168  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.739394  normal  0.154555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2755  hypothetical protein  38.2 
 
 		 399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5695  hypothetical protein  30.87 
 
 		 381 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  39.29 
 
 		 784 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2877  hypothetical protein  36.8 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1659  hypothetical protein  37.6 
 
 		 340 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.186474  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  38.11 
 
 		 796 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  38.11 
 
 		 796 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0616  hypothetical protein  37.2 
 
 		 407 aa  156  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  38.35 
 
 		 790 aa  155  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1984  hypothetical protein  32.36 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000750429  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  35.93 
 
 		 785 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2596  hypothetical protein  37.1 
 
 		 367 aa  155  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  36.25 
 
 		 792 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0483  hypothetical protein  36.1 
 
 		 384 aa  152  8.999999999999999e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.33087  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3713  hypothetical protein  36.51 
 
 		 404 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.120862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0459  hypothetical protein  34.7 
 
 		 390 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1393  hypothetical protein  32.96 
 
 		 416 aa  146  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0125178  normal  0.499824 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1646  hypothetical protein  33.46 
 
 		 402 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20200  hypothetical protein  37.96 
 
 		 380 aa  144  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2098  hypothetical protein  33.47 
 
 		 400 aa  139  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0323698  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1786  hypothetical protein  30.79 
 
 		 469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0894  hypothetical protein  29.06 
 
 		 410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>