More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5607 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  51.93 
 
 		 796 aa  727    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  54.22 
 
 		 790 aa  743    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  55.3 
 
 		 785 aa  753    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  100 
 
 		 784 aa  1560    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  51.93 
 
 		 796 aa  727    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  53.16 
 
 		 792 aa  755    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  43.9 
 
 		 793 aa  564  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  48.11 
 
 		 452 aa  356  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  48.11 
 
 		 428 aa  355  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1366  hypothetical protein  46.77 
 
 		 391 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.092066  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2096  hypothetical protein  40.05 
 
 		 403 aa  256  1.0000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.846287  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1452  hypothetical protein  42.64 
 
 		 413 aa  250  8e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.535979  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2411  hypothetical protein  42.78 
 
 		 413 aa  246  9e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3234  hypothetical protein  39.85 
 
 		 488 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1547  hypothetical protein  42.2 
 
 		 413 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0404742  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1462  hypothetical protein  41.88 
 
 		 417 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3179  hypothetical protein  39.24 
 
 		 444 aa  241  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0164032  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1396  hypothetical protein  39.66 
 
 		 397 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.32411  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1081  hypothetical protein  39.14 
 
 		 417 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7058500000000006e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  39.04 
 
 		 391 aa  231  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  40.36 
 
 		 390 aa  231  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2217  hypothetical protein  41.41 
 
 		 430 aa  231  5e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.310797  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  38.98 
 
 		 395 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  42.62 
 
 		 416 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  45.6 
 
 		 966 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  36.86 
 
 		 392 aa  218  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3717  hypothetical protein  37.95 
 
 		 390 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0194  hypothetical protein  35.22 
 
 		 386 aa  212  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0535  hypothetical protein  40.79 
 
 		 390 aa  212  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1365  hypothetical protein  36.34 
 
 		 418 aa  211  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  39.72 
 
 		 381 aa  209  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1984  hypothetical protein  42.33 
 
 		 390 aa  209  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000750429  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  38.55 
 
 		 430 aa  208  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1198  hypothetical protein  36.03 
 
 		 417 aa  207  7e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  37.37 
 
 		 381 aa  207  9e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1364  hypothetical protein  38.22 
 
 		 420 aa  207  9e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000043565  normal  0.463886 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1897  hypothetical protein  38.21 
 
 		 385 aa  206  2e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.167595  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1114  hypothetical protein  36.81 
 
 		 413 aa  204  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0955  hypothetical protein  36.42 
 
 		 407 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1185  hypothetical protein  37.47 
 
 		 476 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  38.89 
 
 		 408 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  35.68 
 
 		 483 aa  201  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  37.96 
 
 		 471 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1124  hypothetical protein  37.3 
 
 		 381 aa  201  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0628  hypothetical protein  36.05 
 
 		 442 aa  200  7.999999999999999e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2762  hypothetical protein  32.91 
 
 		 388 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  37.68 
 
 		 574 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2357  hypothetical protein  35.46 
 
 		 387 aa  198  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1513  hypothetical protein  37.65 
 
 		 388 aa  198  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0233  hypothetical protein  33.51 
 
 		 386 aa  198  4.0000000000000005e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  43.27 
 
 		 582 aa  197  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2008  hypothetical protein  38.92 
 
 		 388 aa  197  6e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  34.53 
 
 		 528 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  40 
 
 		 566 aa  196  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  34.53 
 
 		 528 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  39.6 
 
 		 459 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  34.09 
 
 		 531 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  37.15 
 
 		 395 aa  189  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0459  hypothetical protein  36.78 
 
 		 390 aa  186  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  34.73 
 
 		 529 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  37.34 
 
 		 717 aa  186  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0262  hypothetical protein  35.45 
 
 		 387 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.96944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  36.56 
 
 		 379 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  33.89 
 
 		 496 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5695  hypothetical protein  45.17 
 
 		 381 aa  183  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1074  hypothetical protein  35.28 
 
 		 405 aa  183  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.408971  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  36.45 
 
 		 379 aa  181  4e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4816  hypothetical protein  30.73 
 
 		 399 aa  178  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.786963  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1662  hypothetical protein  40.17 
 
 		 370 aa  177  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.739394  normal  0.154555 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2124  hypothetical protein  31.4 
 
 		 405 aa  177  6e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000646964  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0205  hypothetical protein  35.35 
 
 		 387 aa  177  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0483  hypothetical protein  35.23 
 
 		 384 aa  174  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.33087  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  35.26 
 
 		 379 aa  175  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  38.34 
 
 		 354 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4819  hypothetical protein  29.98 
 
 		 420 aa  174  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.389749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00140  hypothetical protein  38.93 
 
 		 421 aa  172  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2755  hypothetical protein  38.95 
 
 		 399 aa  171  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1571  hypothetical protein  31.36 
 
 		 424 aa  170  8e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0240807  normal  0.246584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  42.61 
 
 		 591 aa  170  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4513  hypothetical protein  42.75 
 
 		 393 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.710596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0271  hypothetical protein  38.66 
 
 		 443 aa  167  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2596  hypothetical protein  40.86 
 
 		 367 aa  167  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  36.36 
 
 		 381 aa  167  8e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  34.89 
 
 		 385 aa  167  9e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3713  hypothetical protein  33.93 
 
 		 404 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.120862 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00594  putative lipoprotein  41.13 
 
 		 449 aa  166  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  35 
 
 		 360 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2880  putative lipoprotein  39.29 
 
 		 398 aa  165  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  37.61 
 
 		 357 aa  165  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0616  hypothetical protein  38.1 
 
 		 407 aa  165  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4806  hypothetical protein  30.08 
 
 		 379 aa  164  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1786  hypothetical protein  40.14 
 
 		 469 aa  163  9e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0231  hypothetical protein  33.77 
 
 		 432 aa  163  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  30.94 
 
 		 603 aa  163  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1659  hypothetical protein  41.18 
 
 		 340 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.186474  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4167  hypothetical protein  37.28 
 
 		 391 aa  163  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181504  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2877  hypothetical protein  36.94 
 
 		 401 aa  162  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0229  hypothetical protein  31.03 
 
 		 390 aa  161  5e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.925038 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35960  hypothetical protein  35.64 
 
 		 423 aa  160  7e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal  0.373005 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1224  hypothetical protein  30.13 
 
 		 408 aa  160  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367395  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>