More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0925 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  100 
 
 		 966 aa  1932    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  37.89 
 
 		 1012 aa  610  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.54 
 
 		 1018 aa  592  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  35.05 
 
 		 992 aa  581  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.17 
 
 		 953 aa  582  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  33.77 
 
 		 971 aa  582  1e-164  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  34.47 
 
 		 990 aa  560  1e-158  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  32.76 
 
 		 997 aa  546  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  34.37 
 
 		 1007 aa  547  1e-154  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.04 
 
 		 1002 aa  516  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.44 
 
 		 976 aa  504  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  41.26 
 
 		 589 aa  416  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.37 
 
 		 583 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.52 
 
 		 582 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.53 
 
 		 573 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.51 
 
 		 591 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  38.98 
 
 		 624 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.06 
 
 		 568 aa  362  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  41.45 
 
 		 592 aa  357  6.999999999999999e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  38.89 
 
 		 585 aa  355  2.9999999999999997e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  38.96 
 
 		 604 aa  335  3e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.13 
 
 		 698 aa  328  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  31.86 
 
 		 1003 aa  317  7e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.74 
 
 		 596 aa  314  3.9999999999999997e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  48.61 
 
 		 395 aa  314  3.9999999999999997e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.36 
 
 		 543 aa  305  4.0000000000000003e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.88 
 
 		 600 aa  301  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  46.98 
 
 		 379 aa  300  8e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  33.27 
 
 		 520 aa  299  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  46.46 
 
 		 385 aa  294  5e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  38.74 
 
 		 631 aa  293  7e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  44.73 
 
 		 379 aa  290  1e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.49 
 
 		 543 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  45.85 
 
 		 381 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.97 
 
 		 618 aa  284  5.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.5 
 
 		 534 aa  281  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.5 
 
 		 534 aa  281  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  39.22 
 
 		 574 aa  278  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.6 
 
 		 558 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  43.56 
 
 		 381 aa  273  8.000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.47 
 
 		 537 aa  272  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  43.18 
 
 		 379 aa  272  2.9999999999999997e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  46.33 
 
 		 542 aa  269  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  35.94 
 
 		 552 aa  266  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.48 
 
 		 528 aa  264  4.999999999999999e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  42.75 
 
 		 427 aa  262  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  43.41 
 
 		 656 aa  261  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  41.62 
 
 		 793 aa  255  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  42.25 
 
 		 366 aa  250  9e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  32.13 
 
 		 597 aa  249  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.91 
 
 		 552 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  39.43 
 
 		 444 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  43.91 
 
 		 390 aa  246  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  42.9 
 
 		 796 aa  245  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  42.9 
 
 		 796 aa  245  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.52 
 
 		 580 aa  244  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  36.22 
 
 		 511 aa  244  7e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  33.54 
 
 		 603 aa  242  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  42.03 
 
 		 428 aa  242  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  42.03 
 
 		 452 aa  242  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.73 
 
 		 511 aa  239  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  44.6 
 
 		 420 aa  239  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  41.67 
 
 		 566 aa  239  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  28.64 
 
 		 845 aa  239  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  39.42 
 
 		 538 aa  236  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  38.89 
 
 		 543 aa  233  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  42.57 
 
 		 538 aa  231  7e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  29.88 
 
 		 517 aa  229  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  32.78 
 
 		 541 aa  227  8e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  39.67 
 
 		 391 aa  227  9e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  41.92 
 
 		 790 aa  226  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  41.4 
 
 		 361 aa  223  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  40.17 
 
 		 395 aa  220  8.999999999999998e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  45.6 
 
 		 784 aa  218  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  39.2 
 
 		 699 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  38.93 
 
 		 699 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.89 
 
 		 426 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  38.67 
 
 		 699 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  38.93 
 
 		 699 aa  213  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  30.62 
 
 		 637 aa  213  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  39.94 
 
 		 582 aa  213  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  37.33 
 
 		 360 aa  213  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  47.97 
 
 		 499 aa  213  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  43.49 
 
 		 785 aa  211  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1600  beta-hexosamidase A  27.34 
 
 		 586 aa  211  8e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.592664  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1481  beta-N-acetylhexosaminidase  38.79 
 
 		 544 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.152176  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  38.95 
 
 		 408 aa  209  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26161  beta-N-acetylglucosaminidase  40.95 
 
 		 549 aa  210  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  47.08 
 
 		 498 aa  210  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  34.41 
 
 		 734 aa  209  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2118  glycoside hydrolase family 3 protein  29.09 
 
 		 537 aa  209  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01861  beta-N-acetylglucosaminidase  38.79 
 
 		 544 aa  208  4e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  39.2 
 
 		 416 aa  207  9e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  42.31 
 
 		 520 aa  207  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  39.18 
 
 		 357 aa  207  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  36.16 
 
 		 392 aa  206  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1850  Beta-lactamase class C or other penicillin binding protein  38.64 
 
 		 338 aa  206  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000532294  hitchhiker  0.000116253 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  38.53 
 
 		 483 aa  206  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  36.08 
 
 		 492 aa  204  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  43.1 
 
 		 792 aa  204  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>