More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1692 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  92.66 
 
 
528 aa  937    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  92.66 
 
 
528 aa  937    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  100 
 
 
531 aa  1067    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  63.86 
 
 
496 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  56.17 
 
 
471 aa  530  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  43.69 
 
 
390 aa  322  8e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  43.08 
 
 
793 aa  305  9.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  36.5 
 
 
452 aa  243  7.999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  36.5 
 
 
428 aa  243  7.999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  34.92 
 
 
391 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  35.12 
 
 
966 aa  203  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  34 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  32.91 
 
 
574 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  34.22 
 
 
381 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  32.4 
 
 
483 aa  200  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  30.53 
 
 
392 aa  195  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  33.68 
 
 
459 aa  192  9e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  34.09 
 
 
784 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  31.99 
 
 
395 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  33.63 
 
 
416 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  34.86 
 
 
582 aa  182  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  33.41 
 
 
790 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  32.16 
 
 
796 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  33.71 
 
 
717 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  32.16 
 
 
796 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  31.12 
 
 
430 aa  173  5.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  29.81 
 
 
408 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  28.57 
 
 
381 aa  172  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  30.77 
 
 
379 aa  171  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  28.95 
 
 
1012 aa  170  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  30.35 
 
 
379 aa  168  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  29.87 
 
 
385 aa  163  6e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  28.82 
 
 
395 aa  163  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  32.7 
 
 
785 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  31.04 
 
 
360 aa  159  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  28.73 
 
 
379 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  32.6 
 
 
792 aa  158  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  33.57 
 
 
591 aa  155  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  33.71 
 
 
566 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  27.71 
 
 
603 aa  154  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  26.51 
 
 
597 aa  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  31.74 
 
 
361 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  28.54 
 
 
381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  29.88 
 
 
369 aa  148  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  29.12 
 
 
366 aa  146  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4160  hypothetical protein  29.61 
 
 
818 aa  146  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000766166  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  30.77 
 
 
354 aa  144  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  29.55 
 
 
361 aa  140  7e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.7 
 
 
1018 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  30.26 
 
 
351 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  30.3 
 
 
357 aa  136  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2585  hypothetical protein  29.09 
 
 
433 aa  134  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1249  hypothetical protein  29.09 
 
 
434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.303061 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.47 
 
 
953 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2716  hypothetical protein  29.09 
 
 
434 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1130  beta-lactamase  30.34 
 
 
355 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2566  hypothetical protein  29.09 
 
 
434 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3660  hypothetical protein  28.95 
 
 
434 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3459  beta-lactamase  31.53 
 
 
394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0213623 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1231  beta-lactamase  28.85 
 
 
434 aa  130  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1251  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  26.46 
 
 
377 aa  127  7e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000135632  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2095  hypothetical protein  26.23 
 
 
484 aa  124  4e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.187143  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2622  hypothetical protein  28.82 
 
 
432 aa  123  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1543  beta-lactamase  26.27 
 
 
651 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  26.44 
 
 
447 aa  121  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  32.12 
 
 
415 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.32 
 
 
1002 aa  120  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0471  beta-lactamase  26.35 
 
 
336 aa  120  7.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20140  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  32.56 
 
 
371 aa  119  9e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.44906  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2671  hypothetical protein  28.57 
 
 
432 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2844  hypothetical protein  28.57 
 
 
432 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2737  hypothetical protein  28.57 
 
 
432 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  23.39 
 
 
1007 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2711  hypothetical protein  28.33 
 
 
432 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27035  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2506  beta-lactamase  31.25 
 
 
344 aa  117  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  26.71 
 
 
433 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1201  beta-lactamase  24.79 
 
 
665 aa  117  6.9999999999999995e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2194  beta-lactamase  27.7 
 
 
334 aa  116  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.724545  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  35.38 
 
 
483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  36.36 
 
 
481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  36.36 
 
 
481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  34.52 
 
 
490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  36.36 
 
 
463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0439  beta-lactamase  29.95 
 
 
397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0784108 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  35.68 
 
 
481 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  30.06 
 
 
406 aa  114  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3477  beta-lactamase  33.1 
 
 
394 aa  113  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3541  beta-lactamase  32.86 
 
 
394 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  36.76 
 
 
481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  22.58 
 
 
971 aa  112  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  27.69 
 
 
395 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  23.86 
 
 
992 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  25.2 
 
 
997 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  30.67 
 
 
407 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3394  Beta-lactamase  31.79 
 
 
394 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  37.68 
 
 
507 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  34.91 
 
 
430 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  24.02 
 
 
990 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  33.17 
 
 
483 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  35.11 
 
 
426 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>