More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1201 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1201  beta-lactamase  100 
 
 		 665 aa  1368    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1543  beta-lactamase  43.74 
 
 		 651 aa  462  1e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2737  hypothetical protein  48.15 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2622  hypothetical protein  48.15 
 
 		 432 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2711  hypothetical protein  47.69 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2844  hypothetical protein  47.92 
 
 		 432 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2671  hypothetical protein  47.92 
 
 		 432 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2716  hypothetical protein  45.91 
 
 		 434 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1231  beta-lactamase  45.91 
 
 		 434 aa  375  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2585  hypothetical protein  45.54 
 
 		 433 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1249  hypothetical protein  45.43 
 
 		 434 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.303061 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2566  hypothetical protein  45.43 
 
 		 434 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3660  hypothetical protein  45.54 
 
 		 434 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4160  hypothetical protein  38.14 
 
 		 818 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000766166  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2095  hypothetical protein  39.78 
 
 		 484 aa  353  7e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.187143  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  31.22 
 
 		 966 aa  172  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  30.85 
 
 		 574 aa  171  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.74 
 
 		 582 aa  169  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  30.73 
 
 		 566 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.22 
 
 		 1018 aa  164  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  32.91 
 
 		 603 aa  164  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  28.95 
 
 		 717 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  32.62 
 
 		 591 aa  157  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  32.06 
 
 		 1012 aa  156  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  31.02 
 
 		 452 aa  154  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  30.53 
 
 		 361 aa  154  5e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  31.02 
 
 		 428 aa  154  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  27.3 
 
 		 390 aa  145  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  29.11 
 
 		 790 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  28.46 
 
 		 395 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.4 
 
 		 953 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  31.12 
 
 		 990 aa  139  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  27.6 
 
 		 793 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29 
 
 		 1002 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  31.5 
 
 		 354 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  29.97 
 
 		 379 aa  134  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  30.36 
 
 		 597 aa  134  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  27.59 
 
 		 385 aa  134  6e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  27.73 
 
 		 379 aa  133  7.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  27.63 
 
 		 1003 aa  133  9e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  28.5 
 
 		 971 aa  133  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  28.91 
 
 		 391 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  29.26 
 
 		 1007 aa  132  3e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  27.34 
 
 		 381 aa  130  6e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  26.32 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0383  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  29.43 
 
 		 337 aa  128  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  30.47 
 
 		 366 aa  127  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0547  beta-lactamase  26.18 
 
 		 375 aa  127  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.727644  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  30.39 
 
 		 381 aa  127  8.000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  28.78 
 
 		 784 aa  126  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  28.95 
 
 		 361 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  31.79 
 
 		 360 aa  124  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1850  Beta-lactamase class C or other penicillin binding protein  29.45 
 
 		 338 aa  125  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000532294  hitchhiker  0.000116253 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  28.42 
 
 		 379 aa  124  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  27.25 
 
 		 785 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  30.1 
 
 		 992 aa  122  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  27.85 
 
 		 796 aa  122  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  27.85 
 
 		 796 aa  122  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  27.16 
 
 		 351 aa  122  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  30.28 
 
 		 369 aa  121  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  29.54 
 
 		 430 aa  121  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  24.17 
 
 		 528 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  24.17 
 
 		 528 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  27.8 
 
 		 408 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  27.84 
 
 		 348 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  26.72 
 
 		 792 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  25.38 
 
 		 392 aa  120  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  28.76 
 
 		 997 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  27.81 
 
 		 357 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  27.81 
 
 		 415 aa  118  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  28.35 
 
 		 459 aa  117  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  25.06 
 
 		 531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0439  beta-lactamase  28.28 
 
 		 397 aa  114  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0784108 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1251  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  27.05 
 
 		 377 aa  114  6e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000135632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  26.48 
 
 		 483 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  27.14 
 
 		 416 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3512  beta-lactamase  29.63 
 
 		 547 aa  110  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265184  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0471  beta-lactamase  26.76 
 
 		 336 aa  109  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3459  beta-lactamase  24.8 
 
 		 394 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213623 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.9 
 
 		 976 aa  108  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4807  beta-lactamase  25.95 
 
 		 434 aa  107  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2194  beta-lactamase  25.37 
 
 		 334 aa  103  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.724545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  23.33 
 
 		 471 aa  103  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20140  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  28.01 
 
 		 371 aa  102  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.44906  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  25.88 
 
 		 381 aa  101  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  26.34 
 
 		 381 aa  101  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0444  beta-lactamase  28.57 
 
 		 339 aa  99.4  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  24.85 
 
 		 496 aa  97.4  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2506  beta-lactamase  26.93 
 
 		 344 aa  96.3  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  29.41 
 
 		 498 aa  94.7  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  29.41 
 
 		 498 aa  94.7  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  26.82 
 
 		 409 aa  91.3  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  23.96 
 
 		 395 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  27.95 
 
 		 447 aa  88.6  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  26.34 
 
 		 424 aa  87.4  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  23.87 
 
 		 601 aa  87  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  23.24 
 
 		 422 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  27.66 
 
 		 487 aa  87  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  25.86 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3394  Beta-lactamase  25 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>