More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0013 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  42.78 
 
 		 1012 aa  789    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.46 
 
 		 976 aa  739    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  44.64 
 
 		 1007 aa  833    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  44.9 
 
 		 997 aa  756    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  43.53 
 
 		 971 aa  809    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  100 
 
 		 990 aa  2050    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.96 
 
 		 1018 aa  923    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.56 
 
 		 953 aa  890    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  42.67 
 
 		 992 aa  778    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.46 
 
 		 1002 aa  767    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  35.5 
 
 		 1003 aa  617  1e-175  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  34.19 
 
 		 966 aa  555  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.23 
 
 		 568 aa  443  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  36.33 
 
 		 603 aa  342  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  39.82 
 
 		 597 aa  317  6e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.02 
 
 		 591 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  31.32 
 
 		 589 aa  305  4.0000000000000003e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.14 
 
 		 583 aa  293  8e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  31.24 
 
 		 585 aa  291  4e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.19 
 
 		 582 aa  283  9e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  32.25 
 
 		 592 aa  277  7e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  32.55 
 
 		 604 aa  277  7e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.02 
 
 		 573 aa  275  3e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.73 
 
 		 596 aa  266  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2118  glycoside hydrolase family 3 protein  34.39 
 
 		 537 aa  255  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.29 
 
 		 698 aa  253  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  28.38 
 
 		 624 aa  252  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.43 
 
 		 543 aa  251  5e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  31.01 
 
 		 552 aa  240  8e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  31.1 
 
 		 520 aa  239  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.63 
 
 		 600 aa  238  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.96 
 
 		 528 aa  236  2.0000000000000002e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.01 
 
 		 558 aa  231  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.83 
 
 		 580 aa  227  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.53 
 
 		 534 aa  227  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.53 
 
 		 534 aa  227  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.67 
 
 		 618 aa  224  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  35.39 
 
 		 656 aa  224  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  31.26 
 
 		 699 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  40.62 
 
 		 511 aa  215  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  36.53 
 
 		 520 aa  214  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  34.62 
 
 		 444 aa  213  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  41.03 
 
 		 542 aa  213  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  32.71 
 
 		 379 aa  212  3e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.1 
 
 		 537 aa  211  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  27.54 
 
 		 845 aa  210  9e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  28.32 
 
 		 517 aa  210  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.49 
 
 		 552 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  30.88 
 
 		 699 aa  208  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  31.34 
 
 		 699 aa  208  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  30.84 
 
 		 631 aa  208  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  30.88 
 
 		 699 aa  207  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  34.77 
 
 		 381 aa  207  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  31.22 
 
 		 385 aa  203  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.4 
 
 		 484 aa  201  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.59 
 
 		 543 aa  201  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  37.2 
 
 		 633 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  34.39 
 
 		 427 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  31.19 
 
 		 379 aa  198  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  31.12 
 
 		 395 aa  195  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26161  beta-N-acetylglucosaminidase  35.67 
 
 		 549 aa  192  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  30.09 
 
 		 541 aa  192  4e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  30.81 
 
 		 793 aa  191  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.25 
 
 		 426 aa  191  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4807  beta-lactamase  32.01 
 
 		 434 aa  191  5.999999999999999e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  34.1 
 
 		 420 aa  191  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  34.71 
 
 		 538 aa  190  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.07 
 
 		 511 aa  189  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  35.39 
 
 		 503 aa  187  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.23 
 
 		 594 aa  185  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.07 
 
 		 490 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  39.13 
 
 		 490 aa  183  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  30.08 
 
 		 381 aa  182  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  39.56 
 
 		 543 aa  181  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  29.09 
 
 		 557 aa  180  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  30.15 
 
 		 379 aa  179  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1600  beta-hexosamidase A  29.95 
 
 		 586 aa  177  9e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.592664  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  38.98 
 
 		 498 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  29.58 
 
 		 734 aa  176  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  36.82 
 
 		 637 aa  176  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  33.87 
 
 		 538 aa  176  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  38.56 
 
 		 499 aa  175  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  30.61 
 
 		 574 aa  174  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  36.14 
 
 		 365 aa  171  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  30.2 
 
 		 390 aa  171  7e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  38.33 
 
 		 673 aa  170  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  33.6 
 
 		 361 aa  170  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.97 
 
 		 365 aa  170  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  30.97 
 
 		 452 aa  170  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  36.18 
 
 		 365 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  30.97 
 
 		 428 aa  169  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  28.61 
 
 		 366 aa  168  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.64 
 
 		 365 aa  168  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.98 
 
 		 504 aa  167  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.44 
 
 		 387 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  32.8 
 
 		 492 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.76 
 
 		 398 aa  165  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.74 
 
 		 482 aa  165  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32 
 
 		 598 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  32.11 
 
 		 688 aa  164  6e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>