More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1755 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 
499 aa  956    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  85.77 
 
 
498 aa  780    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  57.66 
 
 
503 aa  514  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  60.04 
 
 
504 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  53.7 
 
 
520 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.2 
 
 
482 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.45 
 
 
490 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  49.39 
 
 
492 aa  364  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.96 
 
 
484 aa  361  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  56.43 
 
 
594 aa  358  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  44.38 
 
 
490 aa  352  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4486  glycoside hydrolase family 3 protein  47.7 
 
 
468 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102459  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1199  glycoside hydrolase family 3 protein  45.77 
 
 
483 aa  279  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0128  glycoside hydrolase family 3 protein  48.09 
 
 
475 aa  276  8e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.174382  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.5 
 
 
530 aa  268  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.45 
 
 
698 aa  259  6e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.22 
 
 
511 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  45.97 
 
 
511 aa  242  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.07 
 
 
543 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  47.19 
 
 
656 aa  240  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  47.87 
 
 
365 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.01 
 
 
528 aa  237  4e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.26 
 
 
365 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.65 
 
 
365 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  38.12 
 
 
520 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  40.27 
 
 
444 aa  223  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  43.21 
 
 
365 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.96 
 
 
596 aa  220  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25420  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  45.05 
 
 
519 aa  216  7e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.128783  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  34.55 
 
 
517 aa  216  9e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  44.48 
 
 
631 aa  216  9e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  43.24 
 
 
427 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  47.97 
 
 
966 aa  211  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.04 
 
 
543 aa  210  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.29 
 
 
558 aa  209  7e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.24 
 
 
600 aa  209  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  46.08 
 
 
420 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.38 
 
 
426 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.36 
 
 
478 aa  207  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  36.33 
 
 
845 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.04 
 
 
552 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.51 
 
 
580 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  44.33 
 
 
604 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.64 
 
 
398 aa  204  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  44.37 
 
 
542 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  40.07 
 
 
633 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  46.34 
 
 
575 aa  196  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  41.28 
 
 
552 aa  196  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  34.17 
 
 
543 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  38.42 
 
 
734 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.72 
 
 
976 aa  194  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  38.8 
 
 
589 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  47.75 
 
 
538 aa  194  3e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.54 
 
 
375 aa  194  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  46.34 
 
 
575 aa  193  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.65 
 
 
568 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  42.53 
 
 
592 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  34.79 
 
 
699 aa  190  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.26 
 
 
387 aa  190  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  35.11 
 
 
971 aa  189  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  35.95 
 
 
997 aa  188  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  34.18 
 
 
992 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  33.43 
 
 
673 aa  187  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.48 
 
 
582 aa  187  4e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  42.59 
 
 
637 aa  186  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  35.43 
 
 
699 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  35.12 
 
 
990 aa  186  8e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.82 
 
 
953 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.02 
 
 
392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.85 
 
 
591 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  35.18 
 
 
699 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.87 
 
 
382 aa  184  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  37.65 
 
 
624 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  38.75 
 
 
370 aa  183  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  42.32 
 
 
1012 aa  183  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.62 
 
 
583 aa  183  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  43.23 
 
 
618 aa  183  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  34.92 
 
 
699 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  34.21 
 
 
363 aa  182  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.96 
 
 
1018 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.76 
 
 
573 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  36.59 
 
 
361 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  36.51 
 
 
585 aa  181  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  43.89 
 
 
538 aa  179  7e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  37.16 
 
 
1007 aa  179  8e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  34.55 
 
 
374 aa  178  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  35.38 
 
 
541 aa  178  2e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.7 
 
 
534 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.7 
 
 
534 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  39.16 
 
 
557 aa  176  6e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.7 
 
 
365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.57 
 
 
395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.84 
 
 
537 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  33.22 
 
 
395 aa  172  7.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  39.27 
 
 
1003 aa  170  7e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  36.83 
 
 
481 aa  169  7e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.96 
 
 
379 aa  169  8e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.97 
 
 
375 aa  168  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.82 
 
 
373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  34.73 
 
 
393 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>