More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2248 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 		 365 aa  729    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  67.87 
 
 		 370 aa  497  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  41.79 
 
 		 361 aa  280  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  39 
 
 		 363 aa  270  4e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.26 
 
 		 426 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  43.12 
 
 		 511 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  40 
 
 		 511 aa  209  5e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.44 
 
 		 698 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.51 
 
 		 528 aa  202  8e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  41.78 
 
 		 365 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  40.13 
 
 		 365 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  41.64 
 
 		 503 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  36.58 
 
 		 517 aa  192  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  34.76 
 
 		 633 aa  192  9e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.12 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  34.12 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.12 
 
 		 365 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.7 
 
 		 387 aa  189  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  38.83 
 
 		 520 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  34.59 
 
 		 845 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  36.55 
 
 		 520 aa  187  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  38.83 
 
 		 637 aa  180  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  36.48 
 
 		 427 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  36.01 
 
 		 673 aa  177  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.54 
 
 		 594 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  40.96 
 
 		 498 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.64 
 
 		 364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.05 
 
 		 478 aa  173  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.11 
 
 		 490 aa  173  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  40.25 
 
 		 490 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  41.14 
 
 		 492 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  45.05 
 
 		 604 aa  170  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  42.92 
 
 		 538 aa  169  5e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  39.85 
 
 		 499 aa  169  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.91 
 
 		 596 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.17 
 
 		 580 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  35.44 
 
 		 699 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  35.44 
 
 		 699 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  37.5 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1726  beta-hexosaminidase  39.34 
 
 		 342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2401  beta-hexosaminidase  37.01 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000799068  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2250  beta-hexosaminidase  39.34 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  37.23 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1945  beta-hexosaminidase  36.14 
 
 		 337 aa  164  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.08 
 
 		 600 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  35.14 
 
 		 699 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  38.27 
 
 		 336 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1626  beta-hexosaminidase  37.54 
 
 		 333 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974733  normal  0.195617 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  35.87 
 
 		 699 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1805  beta-hexosaminidase  38.97 
 
 		 342 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2293  beta-hexosaminidase  38.6 
 
 		 342 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.610564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.68 
 
 		 484 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  33.33 
 
 		 734 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  38.32 
 
 		 356 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  37.76 
 
 		 631 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  36.13 
 
 		 618 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.5 
 
 		 339 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  37.91 
 
 		 336 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  37.96 
 
 		 332 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  38.1 
 
 		 336 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  38.1 
 
 		 336 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.75 
 
 		 379 aa  159  7e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  34.96 
 
 		 992 aa  159  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.52 
 
 		 382 aa  159  9e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1199  glycoside hydrolase family 3 protein  40.23 
 
 		 483 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.21 
 
 		 482 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.15 
 
 		 543 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  38.41 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1984  beta-hexosaminidase  38.85 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.132331  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.54 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.85 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  39.55 
 
 		 542 aa  157  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.54 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1807  beta-hexosaminidase  37.04 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  0.0404034 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2170  beta-hexosaminidase  38.6 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2488  beta-hexosaminidase  38.79 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  39.36 
 
 		 359 aa  156  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.68 
 
 		 552 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2837  beta-hexosaminidase  36.04 
 
 		 333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0312091  hitchhiker  0.000147131 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  40.83 
 
 		 656 aa  156  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.26 
 
 		 543 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.03 
 
 		 392 aa  156  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.71 
 
 		 348 aa  156  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  38.72 
 
 		 543 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.99 
 
 		 358 aa  155  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.96 
 
 		 537 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2794  beta-hexosaminidase  38.43 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.15 
 
 		 504 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4486  glycoside hydrolase family 3 protein  44.14 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102459  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32 
 
 		 976 aa  154  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  34.38 
 
 		 552 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  38.52 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1140  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.06 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  35.87 
 
 		 336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  36.23 
 
 		 336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  33.23 
 
 		 341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  33.82 
 
 		 378 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0295  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.51 
 
 		 343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1326  beta-hexosaminidase  37.89 
 
 		 341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.86 
 
 		 598 aa  153  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>