More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0295 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0295  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
343 aa  702    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  35.89 
 
 
520 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  35.38 
 
 
517 aa  207  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.85 
 
 
426 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.62 
 
 
528 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2523  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.46 
 
 
337 aa  192  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  38.21 
 
 
633 aa  189  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  35.92 
 
 
361 aa  179  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  32.62 
 
 
511 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.18 
 
 
348 aa  177  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  36.19 
 
 
365 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  37.2 
 
 
604 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.81 
 
 
365 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  34.38 
 
 
365 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.08 
 
 
343 aa  170  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.13 
 
 
364 aa  170  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.47 
 
 
365 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.4 
 
 
343 aa  169  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.46 
 
 
358 aa  169  8e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  34.4 
 
 
363 aa  168  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  38.43 
 
 
347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.69 
 
 
387 aa  166  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.19 
 
 
341 aa  166  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  34.49 
 
 
378 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  34.12 
 
 
673 aa  166  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.48 
 
 
600 aa  165  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.71 
 
 
351 aa  165  9e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  33.43 
 
 
386 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  37.68 
 
 
332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  37.37 
 
 
637 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  33.99 
 
 
656 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  37.68 
 
 
356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.65 
 
 
341 aa  164  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  36.52 
 
 
336 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.64 
 
 
339 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  36.52 
 
 
336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.21 
 
 
308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  36.88 
 
 
336 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  34.65 
 
 
370 aa  162  8.000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  36.52 
 
 
336 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  36.17 
 
 
336 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  32.22 
 
 
845 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  38.35 
 
 
359 aa  160  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.24 
 
 
379 aa  160  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  33.63 
 
 
427 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.05 
 
 
596 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0853  beta-hexosaminidase  34.38 
 
 
313 aa  160  4e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457661  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  34.69 
 
 
313 aa  160  4e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2109  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.23 
 
 
353 aa  159  5e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.302973 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.05 
 
 
698 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  36.07 
 
 
420 aa  159  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 
365 aa  159  8e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  36.17 
 
 
336 aa  159  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  36.17 
 
 
336 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  35.02 
 
 
336 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  30.91 
 
 
528 aa  158  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0638  putative beta-glucosidase  28.4 
 
 
531 aa  157  2e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00229499  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.62 
 
 
543 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.24 
 
 
598 aa  156  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  37.37 
 
 
349 aa  155  8e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  31.75 
 
 
382 aa  155  9e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.99 
 
 
558 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.25 
 
 
346 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  35.4 
 
 
327 aa  153  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.58 
 
 
334 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1807  beta-hexosaminidase  35.34 
 
 
337 aa  152  8e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  0.0404034 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.59 
 
 
534 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.59 
 
 
534 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  30.99 
 
 
374 aa  150  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  35.64 
 
 
341 aa  150  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1990  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.26 
 
 
372 aa  149  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.639682  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1626  beta-hexosaminidase  33.77 
 
 
333 aa  149  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974733  normal  0.195617 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  35.44 
 
 
349 aa  149  8e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.82 
 
 
511 aa  149  9e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.61 
 
 
373 aa  149  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.63 
 
 
398 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.01 
 
 
392 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.11 
 
 
362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.2 
 
 
543 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.4 
 
 
504 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  32.46 
 
 
481 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.38 
 
 
580 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.84 
 
 
375 aa  146  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2401  beta-hexosaminidase  35.71 
 
 
341 aa  146  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000799068  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3621  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.15 
 
 
367 aa  145  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  32.49 
 
 
444 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.43 
 
 
382 aa  144  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  34.23 
 
 
734 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2510  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.67 
 
 
342 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4420  putative sugar hydrolase/Beta-N-acetylhexosaminidase  31.58 
 
 
342 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.821767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  34.38 
 
 
520 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.73 
 
 
375 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1160  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.12 
 
 
344 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0839942  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3167  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.99 
 
 
438 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252076 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  31.7 
 
 
344 aa  143  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1140  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.62 
 
 
335 aa  143  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07520  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  38.11 
 
 
499 aa  143  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.139948 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1777  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.31 
 
 
339 aa  143  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120997  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  36.23 
 
 
499 aa  143  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  30.05 
 
 
393 aa  143  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>