More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_25195 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  100 
 
 
332 aa  664    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  95.78 
 
 
356 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  85.24 
 
 
336 aa  580  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  85.24 
 
 
336 aa  566  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  85.24 
 
 
336 aa  560  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  84.34 
 
 
336 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  84.94 
 
 
336 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  84.04 
 
 
336 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  83.13 
 
 
336 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  84.34 
 
 
336 aa  535  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  79.2 
 
 
327 aa  481  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  50.6 
 
 
344 aa  333  3e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  53.92 
 
 
356 aa  332  6e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0308  beta-hexosaminidase  55.81 
 
 
360 aa  323  2e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.446956  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  56.13 
 
 
360 aa  321  9.000000000000001e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2488  beta-hexosaminidase  52.11 
 
 
342 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  53.55 
 
 
349 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2216  beta-hexosaminidase  51.94 
 
 
341 aa  309  4e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.350801  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  52.58 
 
 
341 aa  309  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  52.28 
 
 
341 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  52.28 
 
 
341 aa  308  8e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2794  beta-hexosaminidase  51.81 
 
 
342 aa  308  8e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  52.28 
 
 
341 aa  308  8e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  52.32 
 
 
341 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.32 
 
 
341 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  52.99 
 
 
359 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  52.32 
 
 
341 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  49.25 
 
 
349 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1924  beta-hexosaminidase  51.67 
 
 
339 aa  306  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807084  hitchhiker  0.0000306127 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2067  glycoside hydrolase family protein  54.17 
 
 
340 aa  306  3e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.268597  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  52.01 
 
 
341 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1700  beta-hexosaminidase  51.96 
 
 
343 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1592  beta-hexosaminidase  51.96 
 
 
343 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.541862  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1243  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.8 
 
 
347 aa  305  8.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0548  beta-hexosaminidase  51.19 
 
 
342 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1784  beta-hexosaminidase  51.19 
 
 
342 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.131771  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2461  beta-hexosaminidase  51.19 
 
 
342 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2820  beta-hexosaminidase  51.19 
 
 
342 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.24602  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2401  beta-hexosaminidase  48.37 
 
 
341 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000799068  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2894  beta-hexosaminidase  50.3 
 
 
342 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.0758601 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2889  beta-hexosaminidase  50.89 
 
 
342 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2835  beta-hexosaminidase  50.89 
 
 
342 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261076  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2818  beta-hexosaminidase  51.98 
 
 
340 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.743458  normal  0.716469 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2774  beta-hexosaminidase  50.89 
 
 
342 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1945  beta-hexosaminidase  54.17 
 
 
337 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  50.61 
 
 
348 aa  300  3e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  51.2 
 
 
341 aa  299  4e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1097  beta-hexosaminidase  51.04 
 
 
342 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1090  beta-hexosaminidase  48.82 
 
 
342 aa  299  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1068  beta-hexosaminidase  49.11 
 
 
350 aa  298  6e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0051556  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  51.36 
 
 
337 aa  298  7e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0659  beta-hexosaminidase  50.75 
 
 
342 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1139  beta-hexosaminidase  50.75 
 
 
342 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1539  beta-hexosaminidase  55.56 
 
 
355 aa  297  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107932  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  50.3 
 
 
341 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  50.3 
 
 
341 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  50.3 
 
 
341 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  50.3 
 
 
341 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  50.3 
 
 
341 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4251  beta-hexosaminidase  50.15 
 
 
342 aa  295  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1637  beta-hexosaminidase  51.81 
 
 
365 aa  295  7e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0105017  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1015  beta-hexosaminidase  50.45 
 
 
342 aa  295  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.791894  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2247  beta-hexosaminidase  49.7 
 
 
349 aa  295  8e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1019  beta-hexosaminidase  50.15 
 
 
342 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1626  beta-hexosaminidase  54.64 
 
 
333 aa  295  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974733  normal  0.195617 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1807  beta-hexosaminidase  50.92 
 
 
337 aa  294  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  0.0404034 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0933  beta-hexosaminidase  48.38 
 
 
349 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0408142  normal  0.050021 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0655  glycosy hydrolase family protein  54.48 
 
 
347 aa  294  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448002  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1735  beta-hexosaminidase  50.6 
 
 
342 aa  291  8e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0532306  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0998  beta-hexosaminidase  48.08 
 
 
349 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0411  glycoside hydrolase family 3 protein  49.84 
 
 
357 aa  291  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0418  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.85 
 
 
357 aa  291  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2165  beta-hexosaminidase  52.08 
 
 
342 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.424583 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2413  beta-hexosaminidase  53.68 
 
 
349 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.096401 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  47.55 
 
 
357 aa  289  4e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1716  beta-hexosaminidase  53.44 
 
 
332 aa  288  8e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1326  beta-hexosaminidase  55.56 
 
 
341 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2293  beta-hexosaminidase  54.09 
 
 
342 aa  287  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.610564  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  50.15 
 
 
347 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2250  beta-hexosaminidase  53.74 
 
 
342 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1726  beta-hexosaminidase  53.74 
 
 
342 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1805  beta-hexosaminidase  54.09 
 
 
342 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.23 
 
 
346 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2614  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.35 
 
 
369 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3261  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.35 
 
 
369 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0432032 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.76 
 
 
348 aa  281  8.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1984  beta-hexosaminidase  51.13 
 
 
334 aa  281  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.132331  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2837  beta-hexosaminidase  50.81 
 
 
333 aa  281  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0312091  hitchhiker  0.000147131 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2170  beta-hexosaminidase  53.02 
 
 
342 aa  278  8e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3630  glycoside hydrolase family protein  51.77 
 
 
352 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1754  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.17 
 
 
364 aa  277  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004407  beta N-acetyl-glucosaminidase  48.02 
 
 
327 aa  277  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1987  glycoside hydrolase family 3 protein  46.01 
 
 
337 aa  276  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.428635 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00991  beta-hexosaminidase  48.33 
 
 
327 aa  276  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0593  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.38 
 
 
367 aa  276  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144455 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.84 
 
 
362 aa  275  6e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3056  glycoside hydrolase family 3 protein  50.35 
 
 
352 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0223  beta-hexosaminidase  48.01 
 
 
330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5256  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.85 
 
 
363 aa  272  7e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.973302  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  49.68 
 
 
381 aa  271  8.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>