More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0717 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 
395 aa  811    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  71.75 
 
 
393 aa  546  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.3 
 
 
392 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  53.12 
 
 
382 aa  350  3e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.12 
 
 
373 aa  339  4e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.73 
 
 
375 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  48.67 
 
 
374 aa  334  2e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.27 
 
 
398 aa  330  4e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.18 
 
 
375 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  48.84 
 
 
378 aa  322  6e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.76 
 
 
379 aa  317  3e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  46.45 
 
 
375 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.18 
 
 
382 aa  301  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  45.85 
 
 
481 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2414  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.21 
 
 
373 aa  296  6e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.65 
 
 
358 aa  292  6e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  44.41 
 
 
395 aa  290  4e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1193  hypothetical protein  44.32 
 
 
382 aa  287  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1199  hypothetical protein  44.6 
 
 
382 aa  287  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0946  hypothetical protein  41.36 
 
 
358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0835  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.55 
 
 
586 aa  249  5e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311157 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0916  hypothetical protein  40.06 
 
 
358 aa  246  4.9999999999999997e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  39.53 
 
 
365 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0154  glycoside hydrolase family 3 protein  36.96 
 
 
351 aa  208  1e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.23 
 
 
365 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.23 
 
 
365 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  38.35 
 
 
365 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  36.71 
 
 
656 aa  202  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0601  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.28 
 
 
381 aa  202  8e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0823164 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.52 
 
 
528 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  35.25 
 
 
444 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.29 
 
 
426 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0793  glycosy hydrolase family protein  35.92 
 
 
350 aa  192  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0989068  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0777  glycosy hydrolase family protein  36.63 
 
 
354 aa  192  1e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.696982  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.34 
 
 
534 aa  189  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.34 
 
 
534 aa  189  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.01 
 
 
580 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.96 
 
 
543 aa  187  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  37.31 
 
 
503 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.88 
 
 
698 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  37.54 
 
 
631 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  36.24 
 
 
492 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.66 
 
 
618 aa  180  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.2 
 
 
543 aa  179  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  32 
 
 
845 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.17 
 
 
537 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  36.21 
 
 
552 aa  177  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.01 
 
 
484 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.74 
 
 
594 aa  176  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  35.65 
 
 
427 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  33.52 
 
 
520 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  34.5 
 
 
604 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.8 
 
 
558 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  35.84 
 
 
420 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  33.14 
 
 
517 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.7 
 
 
600 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  36.03 
 
 
542 aa  172  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.91 
 
 
511 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.66 
 
 
598 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  32.46 
 
 
511 aa  169  9e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  34.57 
 
 
520 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  36.8 
 
 
498 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.91 
 
 
552 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.6 
 
 
490 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.28 
 
 
478 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  35.57 
 
 
499 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  34.56 
 
 
688 aa  162  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.72 
 
 
482 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  34.58 
 
 
490 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  32.48 
 
 
624 aa  159  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  33.88 
 
 
633 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.71 
 
 
596 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  31.22 
 
 
992 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  40.71 
 
 
370 aa  155  9e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.85 
 
 
504 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.24 
 
 
387 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.85 
 
 
568 aa  153  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0117  glycoside hydrolase family 3 protein  30.33 
 
 
465 aa  153  5e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.72 
 
 
530 aa  152  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  30.3 
 
 
699 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1990  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.52 
 
 
372 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.639682  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0119  glycoside hydrolase family 3 protein  29.73 
 
 
467 aa  151  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  31.64 
 
 
699 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  31.64 
 
 
699 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0523  Beta-glucosidase-related glycosidase  31.9 
 
 
403 aa  149  9e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.328579  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.68 
 
 
1018 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  33.11 
 
 
528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  31.37 
 
 
699 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  32.23 
 
 
575 aa  147  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  33.52 
 
 
361 aa  146  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  36.17 
 
 
538 aa  146  6e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  31.91 
 
 
575 aa  146  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  31.27 
 
 
585 aa  145  9e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  27.67 
 
 
971 aa  145  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2332  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.39 
 
 
409 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.25 
 
 
365 aa  145  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  32.78 
 
 
363 aa  145  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  32.16 
 
 
386 aa  143  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  28.53 
 
 
990 aa  143  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2600  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.94 
 
 
575 aa  143  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>