More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1365 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 
698 aa  1430    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  40.78 
 
 
845 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  40.67 
 
 
604 aa  401  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  40.83 
 
 
520 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.07 
 
 
528 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.59 
 
 
600 aa  348  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.2 
 
 
596 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.54 
 
 
543 aa  342  2e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.75 
 
 
543 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  37.44 
 
 
631 aa  335  1e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  40 
 
 
552 aa  332  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.98 
 
 
618 aa  323  6e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  33.95 
 
 
699 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  42.82 
 
 
444 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38 
 
 
558 aa  308  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  33.79 
 
 
699 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  33.64 
 
 
699 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  34.78 
 
 
589 aa  303  9e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.03 
 
 
580 aa  302  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  33.49 
 
 
699 aa  301  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  39.19 
 
 
633 aa  300  5e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  35.13 
 
 
966 aa  298  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  32.97 
 
 
517 aa  297  5e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.27 
 
 
598 aa  292  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.17 
 
 
583 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  32.57 
 
 
734 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.5 
 
 
953 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.88 
 
 
582 aa  284  4.0000000000000003e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  37.78 
 
 
637 aa  284  5.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  31.82 
 
 
585 aa  281  2e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  33.28 
 
 
688 aa  280  6e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.39 
 
 
976 aa  278  2e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  36.96 
 
 
511 aa  278  3e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  40.16 
 
 
427 aa  273  6e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.49 
 
 
1018 aa  273  7e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.57 
 
 
568 aa  273  7e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.02 
 
 
591 aa  272  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.65 
 
 
511 aa  271  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  33.05 
 
 
1012 aa  271  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  31.81 
 
 
624 aa  268  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  41.73 
 
 
656 aa  267  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  31.44 
 
 
992 aa  267  5.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  35.97 
 
 
1003 aa  266  1e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  31.27 
 
 
1007 aa  265  2e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  31.12 
 
 
997 aa  265  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.28 
 
 
573 aa  264  4.999999999999999e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  36.51 
 
 
498 aa  262  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  44.21 
 
 
673 aa  262  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.23 
 
 
426 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  30.17 
 
 
971 aa  257  4e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  32.37 
 
 
592 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  40.97 
 
 
542 aa  253  9.000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  32.29 
 
 
990 aa  253  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  39.2 
 
 
420 aa  246  9e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  33.57 
 
 
541 aa  244  3e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  43.79 
 
 
520 aa  244  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.37 
 
 
594 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  44.12 
 
 
492 aa  242  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  45.45 
 
 
499 aa  241  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.49 
 
 
534 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  41.21 
 
 
365 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.49 
 
 
534 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  37.81 
 
 
503 aa  239  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.92 
 
 
365 aa  237  6e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.92 
 
 
365 aa  236  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.89 
 
 
537 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  42.91 
 
 
538 aa  233  7.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01416  beta-N-acetylglucosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04060)  28.74 
 
 
923 aa  228  4e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.249687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.68 
 
 
552 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  43.87 
 
 
365 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  29.7 
 
 
557 aa  224  6e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.61 
 
 
484 aa  223  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.21 
 
 
504 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  38.36 
 
 
538 aa  218  2e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.72 
 
 
387 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.18 
 
 
490 aa  218  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  39.33 
 
 
543 aa  213  9e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  43.18 
 
 
490 aa  211  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.93 
 
 
1002 aa  210  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  28.55 
 
 
528 aa  208  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  35.89 
 
 
370 aa  207  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1600  beta-hexosamidase A  27.81 
 
 
586 aa  206  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.592664  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.23 
 
 
530 aa  204  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  35.73 
 
 
575 aa  204  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  34.41 
 
 
575 aa  205  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2414  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.02 
 
 
373 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.27 
 
 
478 aa  202  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.19 
 
 
375 aa  201  5e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26161  beta-N-acetylglucosaminidase  41.7 
 
 
549 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.69 
 
 
379 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2118  glycoside hydrolase family 3 protein  37.33 
 
 
537 aa  199  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.51 
 
 
482 aa  198  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4486  glycoside hydrolase family 3 protein  38.28 
 
 
468 aa  197  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102459  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.26 
 
 
398 aa  197  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  34.82 
 
 
378 aa  196  9e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  35.56 
 
 
395 aa  196  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0128  glycoside hydrolase family 3 protein  39.43 
 
 
475 aa  196  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.174382  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  35.46 
 
 
375 aa  195  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.45 
 
 
373 aa  196  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  35.06 
 
 
361 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>