More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2069 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
358 aa  729    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.11 
 
 
398 aa  315  8e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  42.57 
 
 
481 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.61 
 
 
382 aa  296  5e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.65 
 
 
395 aa  292  5e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.18 
 
 
373 aa  288  8e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  43.31 
 
 
374 aa  287  2e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  42.73 
 
 
378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.86 
 
 
392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.82 
 
 
375 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1193  hypothetical protein  42.09 
 
 
382 aa  282  6.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1199  hypothetical protein  41.64 
 
 
382 aa  279  7e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  42.44 
 
 
393 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.66 
 
 
375 aa  273  3e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  41.81 
 
 
375 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  42.47 
 
 
382 aa  270  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.25 
 
 
379 aa  269  4e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0946  hypothetical protein  42.2 
 
 
358 aa  265  8.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0916  hypothetical protein  41.91 
 
 
358 aa  264  2e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2414  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.79 
 
 
373 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  40.88 
 
 
395 aa  245  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0835  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.14 
 
 
586 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311157 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  35.8 
 
 
365 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.5 
 
 
365 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  35.5 
 
 
365 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.5 
 
 
365 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0601  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.13 
 
 
381 aa  197  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0823164 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0777  glycosy hydrolase family protein  37.9 
 
 
354 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.696982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.57 
 
 
426 aa  186  8e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0154  glycoside hydrolase family 3 protein  33.92 
 
 
351 aa  182  6e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0793  glycosy hydrolase family protein  34.27 
 
 
350 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0989068  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  35.5 
 
 
511 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  32.96 
 
 
673 aa  175  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.92 
 
 
478 aa  175  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.41 
 
 
698 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  34.96 
 
 
520 aa  169  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.58 
 
 
528 aa  169  7e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.28 
 
 
598 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  33.72 
 
 
517 aa  167  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  35.17 
 
 
528 aa  166  5e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  31.86 
 
 
492 aa  166  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  33.33 
 
 
656 aa  166  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0295  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.46 
 
 
343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  34.29 
 
 
427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  34.92 
 
 
420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.08 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.88 
 
 
484 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 
558 aa  162  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.31 
 
 
618 aa  162  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.36 
 
 
543 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2523  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.47 
 
 
337 aa  162  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.64 
 
 
594 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  31.05 
 
 
845 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  31.19 
 
 
520 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.23 
 
 
511 aa  159  9e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  33.61 
 
 
604 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  30.66 
 
 
444 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1990  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.46 
 
 
372 aa  157  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.639682  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.54 
 
 
308 aa  156  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.95 
 
 
543 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.93 
 
 
580 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1912  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.42 
 
 
338 aa  155  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  31.65 
 
 
498 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  32.57 
 
 
503 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  30.9 
 
 
637 aa  153  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.11 
 
 
573 aa  153  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.24 
 
 
600 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  31.45 
 
 
552 aa  152  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  32.34 
 
 
633 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.1 
 
 
534 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.1 
 
 
534 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10240  lipoprotein lpqI  29.91 
 
 
388 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000940475  normal  0.839336 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  31.96 
 
 
631 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.18 
 
 
537 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.49 
 
 
596 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  33.04 
 
 
585 aa  149  8e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3621  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.66 
 
 
367 aa  149  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  30.91 
 
 
575 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  34.67 
 
 
542 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  30.28 
 
 
575 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2332  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.21 
 
 
409 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  27.2 
 
 
386 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 
365 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  29.48 
 
 
688 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  32.14 
 
 
734 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  29.58 
 
 
538 aa  144  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.61 
 
 
490 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  32.42 
 
 
1007 aa  143  5e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  31.6 
 
 
499 aa  142  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.8 
 
 
552 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.55 
 
 
348 aa  142  9e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  27.98 
 
 
363 aa  142  9e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  33.24 
 
 
541 aa  142  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0256  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.6 
 
 
400 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0702378 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  32.4 
 
 
538 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00991  beta-hexosaminidase  34.32 
 
 
327 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004407  beta N-acetyl-glucosaminidase  34.46 
 
 
327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.1 
 
 
504 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  30.59 
 
 
490 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.24 
 
 
583 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>