More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2172 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
375 aa  771    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  61.99 
 
 
373 aa  468  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  58.97 
 
 
374 aa  444  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  60.93 
 
 
375 aa  442  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  60.35 
 
 
375 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2414  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.99 
 
 
373 aa  420  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  58.6 
 
 
378 aa  414  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  48.81 
 
 
382 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.43 
 
 
392 aa  349  5e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.03 
 
 
398 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.53 
 
 
379 aa  340  2e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50.73 
 
 
395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  48.39 
 
 
393 aa  332  8e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  46.41 
 
 
481 aa  330  2e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.81 
 
 
382 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1193  hypothetical protein  41.58 
 
 
382 aa  292  7e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1199  hypothetical protein  41.58 
 
 
382 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.82 
 
 
358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  43.7 
 
 
395 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0835  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.9 
 
 
586 aa  276  6e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311157 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0946  hypothetical protein  40.67 
 
 
358 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0916  hypothetical protein  40.28 
 
 
358 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0154  glycoside hydrolase family 3 protein  37.86 
 
 
351 aa  210  3e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  42.31 
 
 
427 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  36.58 
 
 
365 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.87 
 
 
365 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.87 
 
 
365 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0601  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.12 
 
 
381 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0823164 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0777  glycosy hydrolase family protein  36.64 
 
 
354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.696982  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  35.55 
 
 
365 aa  195  9e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.98 
 
 
543 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  39.17 
 
 
492 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.16 
 
 
484 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  34.88 
 
 
444 aa  194  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0793  glycosy hydrolase family protein  35.92 
 
 
350 aa  192  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0989068  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  38.17 
 
 
498 aa  186  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.76 
 
 
528 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  37.54 
 
 
499 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  37.5 
 
 
552 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.43 
 
 
698 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  33.24 
 
 
517 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.36 
 
 
543 aa  184  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.91 
 
 
594 aa  183  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.71 
 
 
580 aa  183  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.8 
 
 
558 aa  182  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  37.19 
 
 
656 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.09 
 
 
482 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  37.38 
 
 
511 aa  180  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  33.58 
 
 
633 aa  180  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  33.89 
 
 
845 aa  180  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  37.46 
 
 
490 aa  179  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.71 
 
 
600 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.85 
 
 
504 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  34.93 
 
 
503 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.81 
 
 
490 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  34.94 
 
 
520 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  38.89 
 
 
631 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.79 
 
 
618 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  35.36 
 
 
604 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.22 
 
 
511 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  37.34 
 
 
420 aa  173  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  34.8 
 
 
520 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  38.25 
 
 
542 aa  170  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.72 
 
 
596 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.96 
 
 
387 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.15 
 
 
426 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.24 
 
 
530 aa  166  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.77 
 
 
534 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.77 
 
 
534 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.21 
 
 
552 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.83 
 
 
568 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  34.13 
 
 
734 aa  159  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.62 
 
 
953 aa  159  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1468  beta-hexosaminidase  37.42 
 
 
335 aa  158  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0176842  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  34.53 
 
 
575 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  29.77 
 
 
528 aa  156  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  32.59 
 
 
1003 aa  155  1e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.76 
 
 
478 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  33.33 
 
 
370 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  34.6 
 
 
361 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  34.77 
 
 
575 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1525  beta-hexosaminidase  37.11 
 
 
335 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.276065  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  33.33 
 
 
992 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01728  beta-hexosaminidase  36 
 
 
361 aa  155  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.85 
 
 
598 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  31.96 
 
 
971 aa  153  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.21 
 
 
976 aa  153  5e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.78 
 
 
537 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.14 
 
 
341 aa  152  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.02 
 
 
1018 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  34.42 
 
 
688 aa  152  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  33.84 
 
 
341 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  33.84 
 
 
341 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  34.77 
 
 
966 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  31.71 
 
 
1007 aa  151  2e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  34.14 
 
 
341 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  34.15 
 
 
337 aa  150  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0128  glycoside hydrolase family 3 protein  40.52 
 
 
475 aa  150  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.174382  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  34.14 
 
 
341 aa  149  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  36.65 
 
 
341 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>