More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0154 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0154  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 
351 aa  707    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0793  glycosy hydrolase family protein  73.28 
 
 
350 aa  525  1e-148  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0989068  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0777  glycosy hydrolase family protein  45.56 
 
 
354 aa  298  1e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.696982  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.57 
 
 
373 aa  226  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.24 
 
 
392 aa  216  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.9 
 
 
398 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.86 
 
 
375 aa  210  3e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.96 
 
 
395 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  35.06 
 
 
481 aa  206  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.14 
 
 
382 aa  206  6e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  38.08 
 
 
375 aa  204  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  38.48 
 
 
393 aa  202  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  35.96 
 
 
374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2414  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.67 
 
 
373 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0601  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.54 
 
 
381 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0823164 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  37.9 
 
 
378 aa  193  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  38.78 
 
 
395 aa  192  8e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.78 
 
 
379 aa  188  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  35.06 
 
 
382 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.21 
 
 
375 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.92 
 
 
358 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0916  hypothetical protein  33.33 
 
 
358 aa  177  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1193  hypothetical protein  32.61 
 
 
382 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0946  hypothetical protein  33.61 
 
 
358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0835  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.51 
 
 
586 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311157 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1199  hypothetical protein  31.61 
 
 
382 aa  169  9e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  33.71 
 
 
520 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.75 
 
 
345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.93 
 
 
484 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  31.21 
 
 
492 aa  159  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.7 
 
 
528 aa  155  9e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  32.55 
 
 
444 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.85 
 
 
504 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  29.23 
 
 
503 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  28.7 
 
 
520 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4021  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.23 
 
 
403 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0221723  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.55 
 
 
490 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  34.38 
 
 
511 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.53 
 
 
426 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4457  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.97 
 
 
388 aa  149  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0149935  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.6 
 
 
598 aa  149  8e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.14 
 
 
698 aa  149  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  30.99 
 
 
386 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  34.02 
 
 
557 aa  147  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  33.89 
 
 
990 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  32.98 
 
 
699 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  32.84 
 
 
499 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2293  beta-hexosaminidase  35.74 
 
 
342 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.610564  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  30.49 
 
 
656 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  32.87 
 
 
420 aa  146  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  32.26 
 
 
589 aa  146  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2250  beta-hexosaminidase  36.12 
 
 
342 aa  146  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2170  beta-hexosaminidase  36.6 
 
 
342 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1726  beta-hexosaminidase  36.55 
 
 
342 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  32.35 
 
 
498 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.1 
 
 
594 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  31.96 
 
 
688 aa  143  5e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  31.25 
 
 
490 aa  143  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1805  beta-hexosaminidase  34.6 
 
 
342 aa  142  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  30.72 
 
 
517 aa  142  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1626  beta-hexosaminidase  32.97 
 
 
333 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974733  normal  0.195617 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  32.98 
 
 
699 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  32.98 
 
 
699 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.12 
 
 
364 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  31.45 
 
 
552 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  30.96 
 
 
845 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  32.71 
 
 
699 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2837  beta-hexosaminidase  35.77 
 
 
333 aa  139  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0312091  hitchhiker  0.000147131 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.26 
 
 
365 aa  139  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  31.78 
 
 
370 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  31.75 
 
 
585 aa  139  7e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  31.45 
 
 
361 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.47 
 
 
573 aa  138  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3621  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.89 
 
 
367 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.3 
 
 
346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.69 
 
 
591 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.23 
 
 
537 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  29.71 
 
 
966 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  29.48 
 
 
365 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01720  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  30.45 
 
 
383 aa  137  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.651137  normal  0.324393 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  32.38 
 
 
344 aa  136  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0638  putative beta-glucosidase  31.07 
 
 
531 aa  136  6.0000000000000005e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00229499  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.98 
 
 
618 aa  136  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  30.18 
 
 
365 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0385  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.3 
 
 
390 aa  135  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0128  glycoside hydrolase family 3 protein  32.83 
 
 
475 aa  135  8e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.174382  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1807  beta-hexosaminidase  34.84 
 
 
337 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  0.0404034 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  31.61 
 
 
356 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.45 
 
 
511 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1539  beta-hexosaminidase  34.49 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107932  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.39 
 
 
558 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  30.79 
 
 
734 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.91 
 
 
543 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2405  beta-hexosaminidase  35.83 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.842865  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  34.67 
 
 
604 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  35.28 
 
 
427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.81 
 
 
534 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1945  beta-hexosaminidase  34.22 
 
 
337 aa  134  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10240  lipoprotein lpqI  30.72 
 
 
388 aa  134  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000940475  normal  0.839336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.81 
 
 
534 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>