More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4457 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4457  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 		 388 aa  770    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0149935  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10240  lipoprotein lpqI  54.99 
 
 		 388 aa  362  6e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000940475  normal  0.839336 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0423  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50.65 
 
 		 387 aa  351  1e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.14537  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0256  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.35 
 
 		 400 aa  325  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0415  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.76 
 
 		 328 aa  323  4e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0694223 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0219  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.37 
 
 		 397 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0229  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.07 
 
 		 401 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0813841  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0239  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.07 
 
 		 401 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.716439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4021  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.85 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0221723  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01720  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  47.84 
 
 		 383 aa  280  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.651137  normal  0.324393 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.52 
 
 		 426 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  35.53 
 
 		 481 aa  162  7e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0835  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.97 
 
 		 586 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311157 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1193  hypothetical protein  31.84 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.52 
 
 		 398 aa  156  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.59 
 
 		 392 aa  156  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0916  hypothetical protein  31.87 
 
 		 358 aa  155  8e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0946  hypothetical protein  32.42 
 
 		 358 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1199  hypothetical protein  31.28 
 
 		 382 aa  155  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  29.21 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.54 
 
 		 618 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  31.7 
 
 		 395 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  33.43 
 
 		 365 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  37.58 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.76 
 
 		 543 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.56 
 
 		 976 aa  150  5e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  31.75 
 
 		 517 aa  150  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0154  glycoside hydrolase family 3 protein  30.97 
 
 		 351 aa  149  6e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.83 
 
 		 373 aa  149  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 		 365 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.43 
 
 		 382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  33.96 
 
 		 604 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  38.41 
 
 		 656 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  30.7 
 
 		 374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0793  glycosy hydrolase family protein  29.91 
 
 		 350 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0989068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.03 
 
 		 365 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  29.16 
 
 		 990 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  33.03 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  31.5 
 
 		 378 aa  145  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.18 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.14 
 
 		 528 aa  143  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.75 
 
 		 1018 aa  142  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  37.41 
 
 		 427 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2890  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.15 
 
 		 553 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.09 
 
 		 953 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.02 
 
 		 596 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  29.97 
 
 		 520 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  31.79 
 
 		 386 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  35.36 
 
 		 511 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.74 
 
 		 568 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.92 
 
 		 379 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  30.92 
 
 		 1003 aa  136  7.000000000000001e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.37 
 
 		 698 aa  136  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.03 
 
 		 358 aa  135  9e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2414  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.66 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.04 
 
 		 395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  35.74 
 
 		 520 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  28.65 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  32.43 
 
 		 631 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.58 
 
 		 511 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.59 
 
 		 375 aa  134  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  29.86 
 
 		 971 aa  134  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  35.42 
 
 		 490 aa  132  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0777  glycosy hydrolase family protein  30.12 
 
 		 354 aa  132  9e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.696982  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  37.09 
 
 		 499 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  29.28 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.75 
 
 		 558 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  31.87 
 
 		 552 aa  131  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  35.64 
 
 		 498 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  36.11 
 
 		 349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0601  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.89 
 
 		 381 aa  130  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0823164 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  31.25 
 
 		 992 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  32.45 
 
 		 370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.27 
 
 		 594 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  31.03 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.56 
 
 		 484 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  31.23 
 
 		 633 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0638  putative beta-glucosidase  29.14 
 
 		 531 aa  126  5e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00229499  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  34.35 
 
 		 575 aa  126  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  31.9 
 
 		 966 aa  126  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  35.53 
 
 		 503 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.82 
 
 		 543 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  37.93 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  30.52 
 
 		 361 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4486  glycoside hydrolase family 3 protein  37.38 
 
 		 468 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2600  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.4 
 
 		 575 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.13 
 
 		 600 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  27.21 
 
 		 845 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  34.62 
 
 		 359 aa  124  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  28.89 
 
 		 637 aa  123  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.35 
 
 		 490 aa  123  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0295  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.42 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.81 
 
 		 504 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.85 
 
 		 1002 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  31.55 
 
 		 673 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  37.5 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  35.08 
 
 		 575 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  37.07 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  29.65 
 
 		 589 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.25 
 
 		 387 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>