More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5392 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  40.77 
 
 		 997 aa  717    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  39.61 
 
 		 1012 aa  699    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.81 
 
 		 1002 aa  677    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  41.98 
 
 		 1007 aa  782    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  39.61 
 
 		 992 aa  717    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  57.82 
 
 		 1018 aa  1154    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  46.56 
 
 		 990 aa  875    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.33 
 
 		 976 aa  691    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  39.02 
 
 		 971 aa  715    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 953 aa  1976    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  35.25 
 
 		 1003 aa  605  1.0000000000000001e-171  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  36.17 
 
 		 966 aa  560  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.78 
 
 		 568 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  34.63 
 
 		 597 aa  325  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.21 
 
 		 583 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  32.9 
 
 		 603 aa  302  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  33.88 
 
 		 585 aa  301  4e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  32.71 
 
 		 589 aa  294  5e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.71 
 
 		 591 aa  290  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.08 
 
 		 582 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.5 
 
 		 698 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.71 
 
 		 573 aa  280  6e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2118  glycoside hydrolase family 3 protein  34.69 
 
 		 537 aa  276  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  30.28 
 
 		 624 aa  275  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  32.47 
 
 		 604 aa  269  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  32.45 
 
 		 592 aa  265  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.74 
 
 		 543 aa  259  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  34.21 
 
 		 520 aa  254  6e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.19 
 
 		 596 aa  251  5e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.98 
 
 		 558 aa  247  6e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  31.13 
 
 		 618 aa  246  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  31.98 
 
 		 552 aa  244  6e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.66 
 
 		 600 aa  240  9e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.8 
 
 		 580 aa  238  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  37.3 
 
 		 656 aa  233  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.2 
 
 		 537 aa  225  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  32.05 
 
 		 631 aa  221  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.5 
 
 		 528 aa  221  6e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  35.13 
 
 		 379 aa  214  5.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  34.37 
 
 		 444 aa  211  7e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  33.59 
 
 		 379 aa  207  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.57 
 
 		 534 aa  207  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.57 
 
 		 534 aa  207  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  32.91 
 
 		 381 aa  207  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  37.28 
 
 		 542 aa  206  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  30.94 
 
 		 517 aa  204  8e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  34.25 
 
 		 427 aa  203  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  31.73 
 
 		 793 aa  200  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  35.03 
 
 		 845 aa  200  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.68 
 
 		 426 aa  197  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  29.27 
 
 		 688 aa  196  1e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  33.25 
 
 		 385 aa  196  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.51 
 
 		 552 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  32.23 
 
 		 395 aa  194  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  37.58 
 
 		 520 aa  193  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  29.42 
 
 		 541 aa  192  2.9999999999999997e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  30.6 
 
 		 574 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  36.15 
 
 		 503 aa  191  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  31.22 
 
 		 699 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  28.95 
 
 		 633 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4807  beta-lactamase  30.98 
 
 		 434 aa  189  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  30.52 
 
 		 699 aa  189  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  30.52 
 
 		 699 aa  187  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  32.82 
 
 		 379 aa  187  6e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  31.89 
 
 		 366 aa  187  8e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.92 
 
 		 543 aa  187  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  35.87 
 
 		 538 aa  186  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  33.14 
 
 		 420 aa  186  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  30.28 
 
 		 699 aa  185  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  39.92 
 
 		 511 aa  185  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1600  beta-hexosamidase A  30.48 
 
 		 586 aa  182  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.592664  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  29.62 
 
 		 673 aa  182  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  32.43 
 
 		 392 aa  180  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.44 
 
 		 598 aa  178  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  28.65 
 
 		 637 aa  176  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.08 
 
 		 594 aa  176  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  35.86 
 
 		 492 aa  176  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  43.2 
 
 		 498 aa  175  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  35.67 
 
 		 538 aa  175  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  30 
 
 		 391 aa  174  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  42.72 
 
 		 499 aa  174  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.5 
 
 		 511 aa  174  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  32.74 
 
 		 452 aa  173  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  32.74 
 
 		 428 aa  173  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  31.33 
 
 		 390 aa  173  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  31.41 
 
 		 543 aa  171  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  29.29 
 
 		 566 aa  171  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  30.53 
 
 		 483 aa  171  9e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  28.14 
 
 		 779 aa  169  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  34.59 
 
 		 357 aa  167  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26161  beta-N-acetylglucosaminidase  36.1 
 
 		 549 aa  167  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  34.83 
 
 		 382 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  29.34 
 
 		 759 aa  167  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  37.93 
 
 		 575 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  30.85 
 
 		 459 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2716  hypothetical protein  31.68 
 
 		 434 aa  165  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  31 
 
 		 395 aa  165  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2585  hypothetical protein  31.68 
 
 		 433 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1249  hypothetical protein  31.68 
 
 		 434 aa  164  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.303061 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  30.1 
 
 		 381 aa  164  7e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>