More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2605 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 
543 aa  1076    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  39.47 
 
 
520 aa  392  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  43.57 
 
 
604 aa  375  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.81 
 
 
528 aa  372  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.54 
 
 
698 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.28 
 
 
600 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.62 
 
 
596 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  36.88 
 
 
517 aa  312  7.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  41.18 
 
 
631 aa  306  6e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.56 
 
 
558 aa  300  6e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  36.16 
 
 
618 aa  295  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  32.01 
 
 
845 aa  295  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.82 
 
 
543 aa  292  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  38.26 
 
 
552 aa  289  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.5 
 
 
580 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01416  beta-N-acetylglucosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04060)  31 
 
 
923 aa  269  8.999999999999999e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.249687 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  39.04 
 
 
444 aa  267  4e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  40.19 
 
 
966 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  45.25 
 
 
427 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  45.31 
 
 
656 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  28.05 
 
 
528 aa  251  3e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.8 
 
 
573 aa  249  7e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  31.44 
 
 
624 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.09 
 
 
582 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.36 
 
 
365 aa  243  7e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.36 
 
 
365 aa  243  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  46.05 
 
 
365 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  46.06 
 
 
365 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  31.98 
 
 
585 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  48.99 
 
 
498 aa  237  4e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  40.62 
 
 
511 aa  236  8e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  47.43 
 
 
542 aa  236  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.48 
 
 
583 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  44.95 
 
 
420 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.94 
 
 
426 aa  234  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  29.44 
 
 
557 aa  233  8.000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  29.38 
 
 
1007 aa  232  2e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  32.04 
 
 
541 aa  230  4e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77156  glycosyl hyrolase family 3-like protein  28.94 
 
 
1010 aa  230  6e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.354705  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  44.07 
 
 
499 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.71 
 
 
511 aa  228  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  33.06 
 
 
699 aa  226  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  44.01 
 
 
503 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  29.07 
 
 
971 aa  224  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  28.93 
 
 
589 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.71 
 
 
591 aa  224  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  32.72 
 
 
699 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.11 
 
 
568 aa  222  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  32.56 
 
 
699 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  32.39 
 
 
699 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.98 
 
 
490 aa  219  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  42.64 
 
 
520 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  32.4 
 
 
592 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  34.19 
 
 
637 aa  216  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  41.52 
 
 
386 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  45.52 
 
 
538 aa  212  1e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  27.05 
 
 
992 aa  211  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.5 
 
 
534 aa  210  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.5 
 
 
534 aa  210  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.96 
 
 
552 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.34 
 
 
594 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.31 
 
 
598 aa  209  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  41.72 
 
 
492 aa  208  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.16 
 
 
537 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  43.64 
 
 
490 aa  208  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  36.63 
 
 
575 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  32 
 
 
1012 aa  208  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  31.9 
 
 
1003 aa  207  4e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  38.37 
 
 
538 aa  207  4e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  29.28 
 
 
688 aa  206  9e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.57 
 
 
484 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  35.96 
 
 
575 aa  206  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.31 
 
 
976 aa  205  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  28.68 
 
 
997 aa  205  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.98 
 
 
387 aa  204  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  28.84 
 
 
633 aa  204  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.27 
 
 
504 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  27.59 
 
 
990 aa  202  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  31 
 
 
734 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  39.93 
 
 
673 aa  199  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.17 
 
 
482 aa  199  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07520  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  33.78 
 
 
499 aa  199  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.139948 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  36.54 
 
 
374 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.62 
 
 
1018 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  37.01 
 
 
378 aa  194  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.21 
 
 
1002 aa  194  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.61 
 
 
398 aa  193  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.13 
 
 
373 aa  193  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  38.73 
 
 
543 aa  193  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.04 
 
 
953 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0638  putative beta-glucosidase  23.48 
 
 
531 aa  188  2e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00229499  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.24 
 
 
375 aa  188  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.68 
 
 
478 aa  187  6e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  34.84 
 
 
375 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.36 
 
 
375 aa  184  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  38.11 
 
 
481 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26161  beta-N-acetylglucosaminidase  43.94 
 
 
549 aa  183  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4486  glycoside hydrolase family 3 protein  43.6 
 
 
468 aa  181  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102459  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.16 
 
 
382 aa  180  8e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.2 
 
 
395 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>