More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_77156 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_77156  glycosyl hyrolase family 3-like protein  100 
 
 
1010 aa  2088    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.354705  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01416  beta-N-acetylglucosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04060)  32.42 
 
 
923 aa  481  1e-134  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.249687 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.94 
 
 
543 aa  227  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  28.94 
 
 
520 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.26 
 
 
528 aa  202  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  35.29 
 
 
517 aa  187  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.94 
 
 
698 aa  184  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.17 
 
 
426 aa  179  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.21 
 
 
573 aa  163  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  25.98 
 
 
528 aa  159  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  26.4 
 
 
592 aa  159  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  31.29 
 
 
365 aa  158  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.67 
 
 
365 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.67 
 
 
365 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.06 
 
 
596 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.62 
 
 
591 aa  153  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  25.37 
 
 
845 aa  153  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  31.69 
 
 
365 aa  152  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  29.19 
 
 
363 aa  147  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  25.47 
 
 
589 aa  146  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.46 
 
 
543 aa  145  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  25.09 
 
 
618 aa  144  9e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  27.39 
 
 
511 aa  144  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  26.48 
 
 
552 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  29.88 
 
 
444 aa  143  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.11 
 
 
582 aa  140  8.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.13 
 
 
583 aa  138  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  26.52 
 
 
604 aa  137  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  29.64 
 
 
427 aa  137  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  32.48 
 
 
492 aa  137  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  30.72 
 
 
420 aa  137  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  30.48 
 
 
490 aa  137  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.34 
 
 
558 aa  134  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1990  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.2 
 
 
372 aa  134  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.639682  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.09 
 
 
511 aa  134  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28 
 
 
1018 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  27.46 
 
 
1007 aa  133  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  22.94 
 
 
585 aa  132  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  27.19 
 
 
966 aa  131  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  31.27 
 
 
361 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  28.34 
 
 
992 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  29.02 
 
 
1003 aa  128  4.0000000000000003e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.53 
 
 
387 aa  129  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0295  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.09 
 
 
343 aa  128  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.81 
 
 
600 aa  128  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  30.4 
 
 
542 aa  127  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.45 
 
 
953 aa  126  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.67 
 
 
552 aa  125  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  29.11 
 
 
344 aa  124  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  27.54 
 
 
990 aa  123  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  26.94 
 
 
971 aa  124  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  28.79 
 
 
386 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  29 
 
 
484 aa  122  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  26.42 
 
 
1012 aa  121  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  28.62 
 
 
656 aa  121  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.45 
 
 
478 aa  121  7e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.16 
 
 
379 aa  121  7.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  28.66 
 
 
997 aa  120  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07520  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  27.07 
 
 
499 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.139948 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  28.99 
 
 
633 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.24 
 
 
976 aa  119  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  28.33 
 
 
624 aa  117  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.59 
 
 
482 aa  117  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.86 
 
 
490 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  28.4 
 
 
498 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2118  glycoside hydrolase family 3 protein  33.46 
 
 
537 aa  117  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.48 
 
 
568 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22490  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  30.33 
 
 
412 aa  116  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.796827 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1539  beta-hexosaminidase  27.22 
 
 
355 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107932  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  26.84 
 
 
374 aa  115  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.87 
 
 
580 aa  115  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1945  beta-hexosaminidase  28.82 
 
 
337 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.09 
 
 
373 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.42 
 
 
364 aa  115  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  30.54 
 
 
336 aa  115  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2348  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.16 
 
 
339 aa  115  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3621  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.2 
 
 
367 aa  115  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1626  beta-hexosaminidase  28.14 
 
 
333 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974733  normal  0.195617 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1481  beta-N-acetylhexosaminidase  30.91 
 
 
544 aa  114  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.152176  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  27.54 
 
 
538 aa  114  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01861  beta-N-acetylglucosaminidase  32.35 
 
 
544 aa  114  9e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  26.57 
 
 
557 aa  114  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.06 
 
 
346 aa  114  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  26.99 
 
 
520 aa  114  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2109  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.36 
 
 
353 aa  114  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.302973 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1726  beta-hexosaminidase  32.22 
 
 
342 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2401  beta-hexosaminidase  30.18 
 
 
341 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000799068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  28.12 
 
 
393 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.63 
 
 
341 aa  112  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.9 
 
 
537 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  29.19 
 
 
356 aa  112  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0870  glycosy hydrolase family protein  31.14 
 
 
339 aa  112  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.25 
 
 
348 aa  112  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  31.14 
 
 
337 aa  112  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  26.4 
 
 
503 aa  112  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  27.96 
 
 
499 aa  112  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1805  beta-hexosaminidase  32.12 
 
 
342 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1637  beta-hexosaminidase  30.11 
 
 
365 aa  112  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0105017  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  28.47 
 
 
357 aa  111  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2293  beta-hexosaminidase  31.62 
 
 
342 aa  111  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.610564  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>