More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1089 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 
426 aa  862    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  44.44 
 
 
520 aa  277  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.23 
 
 
698 aa  259  9e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  38.52 
 
 
845 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  40.61 
 
 
444 aa  253  6e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  37.93 
 
 
427 aa  250  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.33 
 
 
528 aa  248  2e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.28 
 
 
558 aa  244  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.08 
 
 
365 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.08 
 
 
365 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  38.46 
 
 
365 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.46 
 
 
511 aa  237  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.03 
 
 
543 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.94 
 
 
543 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  36.99 
 
 
511 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.07 
 
 
596 aa  232  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  37.72 
 
 
420 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  38.07 
 
 
552 aa  231  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  37.85 
 
 
365 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  37.01 
 
 
370 aa  226  6e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.27 
 
 
387 aa  225  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  37.08 
 
 
618 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  37.04 
 
 
604 aa  219  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  32.66 
 
 
517 aa  218  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  34.12 
 
 
633 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.61 
 
 
976 aa  216  4e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.83 
 
 
600 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.24 
 
 
580 aa  212  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  35.09 
 
 
542 aa  211  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  35.13 
 
 
585 aa  210  3e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  33.15 
 
 
688 aa  206  5e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  36.21 
 
 
520 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  33.15 
 
 
971 aa  206  7e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.58 
 
 
365 aa  206  8e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  37.41 
 
 
503 aa  206  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  32.31 
 
 
656 aa  206  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  34.17 
 
 
395 aa  204  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  33.14 
 
 
589 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.84 
 
 
598 aa  203  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  33.49 
 
 
1003 aa  202  7e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  33.89 
 
 
966 aa  202  8e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.04 
 
 
552 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  32.8 
 
 
631 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  33.62 
 
 
386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.75 
 
 
573 aa  199  6e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  38.51 
 
 
498 aa  199  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  35.28 
 
 
378 aa  199  7.999999999999999e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  34.15 
 
 
1007 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  33.79 
 
 
363 aa  199  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  34.38 
 
 
374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.22 
 
 
1018 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.68 
 
 
953 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.03 
 
 
591 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.11 
 
 
379 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.22 
 
 
582 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0295  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.85 
 
 
343 aa  196  7e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.49 
 
 
537 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  32.96 
 
 
624 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.69 
 
 
478 aa  195  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  31.76 
 
 
557 aa  194  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.56 
 
 
534 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.56 
 
 
534 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32 
 
 
395 aa  195  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  31.28 
 
 
592 aa  194  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  34.29 
 
 
393 aa  194  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  37.38 
 
 
499 aa  193  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  34.6 
 
 
541 aa  192  7e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  30.48 
 
 
361 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  33.25 
 
 
990 aa  191  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  33.83 
 
 
382 aa  190  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01416  beta-N-acetylglucosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04060)  31.93 
 
 
923 aa  189  5.999999999999999e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.249687 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  35.53 
 
 
344 aa  189  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  31.79 
 
 
528 aa  189  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 
568 aa  188  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  31.36 
 
 
997 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  38.81 
 
 
538 aa  188  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.39 
 
 
398 aa  188  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  31.64 
 
 
637 aa  187  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  34.18 
 
 
492 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.57 
 
 
358 aa  186  8e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.17 
 
 
594 aa  186  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  33.33 
 
 
356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  32.38 
 
 
481 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  32.07 
 
 
1012 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.49 
 
 
364 aa  186  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  34.3 
 
 
375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.56 
 
 
339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  33.23 
 
 
543 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.76 
 
 
482 aa  183  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.24 
 
 
373 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  34.27 
 
 
673 aa  183  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.7 
 
 
392 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  33.57 
 
 
332 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.56 
 
 
346 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.01 
 
 
382 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2414  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.95 
 
 
373 aa  180  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  31.62 
 
 
336 aa  180  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0638  putative beta-glucosidase  31.28 
 
 
531 aa  180  4e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00229499  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2109  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.93 
 
 
353 aa  180  4e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.302973 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  31.56 
 
 
992 aa  180  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>