More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2578 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 
375 aa  771    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  66.1 
 
 
375 aa  501  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2414  Beta-N-acetylhexosaminidase  64.4 
 
 
373 aa  481  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  61.35 
 
 
374 aa  465  9.999999999999999e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  60.16 
 
 
373 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  62.29 
 
 
378 aa  447  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  60.35 
 
 
375 aa  434  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.21 
 
 
382 aa  339  5e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  47.93 
 
 
382 aa  330  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.82 
 
 
379 aa  330  3e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.62 
 
 
392 aa  319  5e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.35 
 
 
398 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  44.01 
 
 
393 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.45 
 
 
395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  43.98 
 
 
481 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  43.06 
 
 
395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1193  hypothetical protein  41.02 
 
 
382 aa  282  8.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1199  hypothetical protein  40.86 
 
 
382 aa  279  6e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.16 
 
 
358 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0835  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.12 
 
 
586 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311157 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0916  hypothetical protein  42.29 
 
 
358 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0946  hypothetical protein  42.53 
 
 
358 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0154  glycoside hydrolase family 3 protein  36.73 
 
 
351 aa  204  2e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0601  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.77 
 
 
381 aa  197  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0823164 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0793  glycosy hydrolase family protein  36.76 
 
 
350 aa  196  8.000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0989068  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.03 
 
 
528 aa  195  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.46 
 
 
698 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  33.72 
 
 
517 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  34.78 
 
 
365 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.07 
 
 
365 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.07 
 
 
365 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.34 
 
 
558 aa  185  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.01 
 
 
426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.96 
 
 
543 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  35.28 
 
 
656 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.84 
 
 
543 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  39.44 
 
 
542 aa  183  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  37.11 
 
 
427 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  36.76 
 
 
604 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  34.18 
 
 
444 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  33.44 
 
 
511 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  34.32 
 
 
365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.56 
 
 
580 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  33.79 
 
 
845 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  35.16 
 
 
520 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  33.98 
 
 
618 aa  176  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.67 
 
 
387 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  35.31 
 
 
633 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  35.38 
 
 
503 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0777  glycosy hydrolase family protein  36.65 
 
 
354 aa  172  9e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.696982  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.85 
 
 
598 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.38 
 
 
552 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  34.52 
 
 
492 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  35.29 
 
 
498 aa  164  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.19 
 
 
594 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.06 
 
 
600 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  30.87 
 
 
990 aa  163  6e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  31.21 
 
 
971 aa  162  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  31.17 
 
 
734 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  33.52 
 
 
420 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.05 
 
 
568 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  33.92 
 
 
552 aa  159  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.13 
 
 
484 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  33.24 
 
 
585 aa  157  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  34.71 
 
 
688 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.21 
 
 
534 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  34.35 
 
 
490 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.21 
 
 
534 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  34.19 
 
 
499 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  31.75 
 
 
520 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  32.85 
 
 
589 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  35.14 
 
 
631 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.07 
 
 
490 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.29 
 
 
478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.98 
 
 
596 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  32.25 
 
 
699 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  32.25 
 
 
699 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.97 
 
 
504 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  32.25 
 
 
699 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.93 
 
 
537 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.29 
 
 
345 aa  152  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  31.94 
 
 
673 aa  151  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.18 
 
 
953 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  32.35 
 
 
699 aa  150  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.52 
 
 
573 aa  150  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  31.33 
 
 
992 aa  149  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.7 
 
 
591 aa  149  8e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.79 
 
 
1018 aa  149  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2523  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.76 
 
 
337 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  31.86 
 
 
966 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  31.17 
 
 
1007 aa  147  3e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.18 
 
 
511 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  31.27 
 
 
386 aa  146  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.95 
 
 
976 aa  146  7.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.36 
 
 
582 aa  145  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  34.04 
 
 
538 aa  145  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  30.92 
 
 
528 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.2 
 
 
583 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0128  glycoside hydrolase family 3 protein  34.16 
 
 
475 aa  144  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.174382  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2825  beta-hexosaminidase  32.59 
 
 
354 aa  143  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>