More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1129 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 		 345 aa  713    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.01 
 
 		 382 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0154  glycoside hydrolase family 3 protein  29.75 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0777  glycosy hydrolase family protein  27.71 
 
 		 354 aa  162  6e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.696982  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  30.43 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2414  Beta-N-acetylhexosaminidase  30 
 
 		 373 aa  161  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  29.89 
 
 		 378 aa  161  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0793  glycosy hydrolase family protein  27.71 
 
 		 350 aa  159  9e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0989068  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.12 
 
 		 373 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  30.29 
 
 		 375 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.77 
 
 		 379 aa  149  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.03 
 
 		 392 aa  149  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.32 
 
 		 398 aa  149  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  26.79 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  31.76 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.75 
 
 		 395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1199  hypothetical protein  29.11 
 
 		 382 aa  139  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.63 
 
 		 375 aa  138  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1193  hypothetical protein  28.84 
 
 		 382 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  25.69 
 
 		 481 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.92 
 
 		 358 aa  130  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  27.46 
 
 		 393 aa  129  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.67 
 
 		 375 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0946  hypothetical protein  25.71 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0835  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.76 
 
 		 586 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311157 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0916  hypothetical protein  25.42 
 
 		 358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  26.52 
 
 		 656 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0601  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.18 
 
 		 381 aa  109  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0823164 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.44 
 
 		 426 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.88 
 
 		 558 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  26.93 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  26.03 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.78 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  24.68 
 
 		 541 aa  100  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  23.95 
 
 		 503 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.44 
 
 		 365 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  25.29 
 
 		 511 aa  99.4  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  24.18 
 
 		 520 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  27.86 
 
 		 356 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3621  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.19 
 
 		 367 aa  95.9  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  25.85 
 
 		 427 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  27.9 
 
 		 349 aa  95.5  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4021  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.47 
 
 		 403 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0221723  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.46 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.93 
 
 		 698 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1805  beta-hexosaminidase  28.15 
 
 		 342 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.64 
 
 		 504 aa  93.2  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2293  beta-hexosaminidase  27.37 
 
 		 342 aa  92.8  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.610564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  24.42 
 
 		 520 aa  91.3  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  25.44 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  26.71 
 
 		 349 aa  90.9  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2216  beta-hexosaminidase  27.52 
 
 		 341 aa  90.1  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.350801  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  22.69 
 
 		 490 aa  90.5  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  27.34 
 
 		 356 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  26.62 
 
 		 336 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  27.52 
 
 		 341 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  27.47 
 
 		 336 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  27.27 
 
 		 327 aa  89.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  27.13 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  26.13 
 
 		 347 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  22.65 
 
 		 528 aa  89  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.57 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  27.13 
 
 		 341 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  27.13 
 
 		 341 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  27.13 
 
 		 341 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  27.13 
 
 		 341 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  24.12 
 
 		 444 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  26.74 
 
 		 341 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  20.65 
 
 		 543 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  25.36 
 
 		 604 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2401  beta-hexosaminidase  25.94 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000799068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  26.64 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  27.13 
 
 		 341 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.74 
 
 		 341 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  26.01 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  26.37 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2332  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.72 
 
 		 409 aa  87.4  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1132  beta-hexosaminidase  26.59 
 
 		 351 aa  87.8  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00323913  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.42 
 
 		 580 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  26.72 
 
 		 336 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  25.86 
 
 		 336 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  23.08 
 
 		 845 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1726  beta-hexosaminidase  26.28 
 
 		 342 aa  87  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  26.44 
 
 		 337 aa  87.4  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.57 
 
 		 543 aa  87.4  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  26.01 
 
 		 336 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  25.78 
 
 		 618 aa  86.7  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  26.32 
 
 		 344 aa  86.7  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  26.74 
 
 		 341 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  26.74 
 
 		 341 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  26.74 
 
 		 341 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  26.74 
 
 		 341 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  25.48 
 
 		 336 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.83 
 
 		 343 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  26.62 
 
 		 313 aa  85.9  9e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  24.91 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.81 
 
 		 334 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0308  beta-hexosaminidase  24.91 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.446956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.1 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.69 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>