More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3870 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  100 
 
 		 336 aa  679    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  89.58 
 
 		 336 aa  599  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  87.8 
 
 		 336 aa  584  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  87.8 
 
 		 336 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  90.99 
 
 		 336 aa  586  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  87.2 
 
 		 336 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  87.2 
 
 		 336 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  85.24 
 
 		 332 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  85.85 
 
 		 356 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  81.85 
 
 		 336 aa  550  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  77.68 
 
 		 327 aa  481  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  55.16 
 
 		 356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  50.61 
 
 		 344 aa  325  9e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  51.21 
 
 		 349 aa  316  3e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0308  beta-hexosaminidase  54.84 
 
 		 360 aa  316  4e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.446956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2889  beta-hexosaminidase  52.25 
 
 		 342 aa  315  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2835  beta-hexosaminidase  52.25 
 
 		 342 aa  315  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2774  beta-hexosaminidase  52.25 
 
 		 342 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  54.84 
 
 		 360 aa  312  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0548  beta-hexosaminidase  51.95 
 
 		 342 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2820  beta-hexosaminidase  51.95 
 
 		 342 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.24602  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1784  beta-hexosaminidase  51.95 
 
 		 342 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.131771  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2461  beta-hexosaminidase  51.95 
 
 		 342 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  48.48 
 
 		 349 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2401  beta-hexosaminidase  49.85 
 
 		 341 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000799068  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1539  beta-hexosaminidase  55.82 
 
 		 355 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107932  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  52.1 
 
 		 359 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2894  beta-hexosaminidase  50.15 
 
 		 342 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.0758601 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0411  glycoside hydrolase family 3 protein  47.28 
 
 		 357 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0418  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.99 
 
 		 357 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2488  beta-hexosaminidase  50.91 
 
 		 342 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  50.45 
 
 		 341 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1945  beta-hexosaminidase  53.98 
 
 		 337 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2067  glycoside hydrolase family protein  54.4 
 
 		 340 aa  302  6.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.268597  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2247  beta-hexosaminidase  49.7 
 
 		 349 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1243  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.98 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1592  beta-hexosaminidase  49.26 
 
 		 343 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.541862  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1700  beta-hexosaminidase  49.26 
 
 		 343 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1735  beta-hexosaminidase  51.83 
 
 		 342 aa  300  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0532306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1097  beta-hexosaminidase  50.75 
 
 		 342 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1090  beta-hexosaminidase  48.66 
 
 		 342 aa  298  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0655  glycosy hydrolase family protein  54.8 
 
 		 347 aa  298  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448002  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2165  beta-hexosaminidase  51.34 
 
 		 342 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424583 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2818  beta-hexosaminidase  49.25 
 
 		 340 aa  297  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.743458  normal  0.716469 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0659  beta-hexosaminidase  50.45 
 
 		 342 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1139  beta-hexosaminidase  50.45 
 
 		 342 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2794  beta-hexosaminidase  50.61 
 
 		 342 aa  296  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1626  beta-hexosaminidase  56.63 
 
 		 333 aa  297  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974733  normal  0.195617 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2216  beta-hexosaminidase  50.46 
 
 		 341 aa  297  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.350801  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  50.15 
 
 		 341 aa  297  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  50.46 
 
 		 341 aa  295  5e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  50.15 
 
 		 341 aa  295  6e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  50.15 
 
 		 341 aa  295  7e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  50.15 
 
 		 341 aa  295  7e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50.15 
 
 		 341 aa  295  8e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  50.15 
 
 		 341 aa  295  9e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  50.15 
 
 		 341 aa  295  9e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4251  beta-hexosaminidase  50.15 
 
 		 342 aa  295  9e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1924  beta-hexosaminidase  51.07 
 
 		 339 aa  294  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807084  hitchhiker  0.0000306127 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  47.08 
 
 		 357 aa  294  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2413  beta-hexosaminidase  48.52 
 
 		 349 aa  294  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.096401 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1019  beta-hexosaminidase  49.55 
 
 		 342 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1015  beta-hexosaminidase  49.55 
 
 		 342 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.791894  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3261  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.7 
 
 		 369 aa  292  7e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0432032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1807  beta-hexosaminidase  49.85 
 
 		 337 aa  292  7e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  0.0404034 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2614  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.7 
 
 		 369 aa  292  7e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1068  beta-hexosaminidase  48.22 
 
 		 350 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0051556  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  49.7 
 
 		 348 aa  290  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  48.34 
 
 		 341 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  48.34 
 
 		 341 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  48.34 
 
 		 341 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  48.34 
 
 		 341 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  48.34 
 
 		 341 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.52 
 
 		 346 aa  288  8e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0933  beta-hexosaminidase  47.34 
 
 		 349 aa  288  9e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0408142  normal  0.050021 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1716  beta-hexosaminidase  53.44 
 
 		 332 aa  288  9e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0998  beta-hexosaminidase  47.34 
 
 		 349 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  49.69 
 
 		 337 aa  286  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1637  beta-hexosaminidase  51.37 
 
 		 365 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0105017  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2293  beta-hexosaminidase  53.38 
 
 		 342 aa  285  9e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.610564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3630  glycoside hydrolase family protein  51.77 
 
 		 352 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2250  beta-hexosaminidase  53.02 
 
 		 342 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1754  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.66 
 
 		 364 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1726  beta-hexosaminidase  53.02 
 
 		 342 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1805  beta-hexosaminidase  53.02 
 
 		 342 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  47.54 
 
 		 347 aa  282  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1984  beta-hexosaminidase  49.22 
 
 		 334 aa  280  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.132331  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0593  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.7 
 
 		 367 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144455 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.84 
 
 		 362 aa  280  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2170  beta-hexosaminidase  52.67 
 
 		 342 aa  279  4e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  52.96 
 
 		 381 aa  279  6e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1407  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.61 
 
 		 368 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.87 
 
 		 348 aa  277  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1326  beta-hexosaminidase  53.42 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3056  glycoside hydrolase family 3 protein  50 
 
 		 352 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0846  beta-hexosaminidase  50 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0495446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5256  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.36 
 
 		 363 aa  276  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.973302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2837  beta-hexosaminidase  51.04 
 
 		 333 aa  273  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0312091  hitchhiker  0.000147131 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1987  glycoside hydrolase family 3 protein  48.66 
 
 		 337 aa  272  7e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.428635 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0223  beta-hexosaminidase  48.61 
 
 		 330 aa  272  7e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>