More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0998 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1068  beta-hexosaminidase  89.86 
 
 		 350 aa  641    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0051556  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0998  beta-hexosaminidase  100 
 
 		 349 aa  713    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0933  beta-hexosaminidase  97.99 
 
 		 349 aa  694    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0408142  normal  0.050021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2413  beta-hexosaminidase  77.01 
 
 		 349 aa  551  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.096401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2247  beta-hexosaminidase  76.44 
 
 		 349 aa  535  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1090  beta-hexosaminidase  65.88 
 
 		 342 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2820  beta-hexosaminidase  64.37 
 
 		 342 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.24602  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0548  beta-hexosaminidase  64.37 
 
 		 342 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2835  beta-hexosaminidase  64.37 
 
 		 342 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2889  beta-hexosaminidase  64.37 
 
 		 342 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2461  beta-hexosaminidase  64.37 
 
 		 342 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2894  beta-hexosaminidase  65.28 
 
 		 342 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.0758601 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1784  beta-hexosaminidase  64.37 
 
 		 342 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.131771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2774  beta-hexosaminidase  64.37 
 
 		 342 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2165  beta-hexosaminidase  65.28 
 
 		 342 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424583 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1019  beta-hexosaminidase  64.39 
 
 		 342 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1097  beta-hexosaminidase  64.69 
 
 		 342 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1015  beta-hexosaminidase  64.39 
 
 		 342 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.791894  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1735  beta-hexosaminidase  64.58 
 
 		 342 aa  430  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0532306  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0659  beta-hexosaminidase  64.39 
 
 		 342 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1139  beta-hexosaminidase  64.39 
 
 		 342 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4251  beta-hexosaminidase  64.55 
 
 		 342 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0411  glycoside hydrolase family 3 protein  61.52 
 
 		 357 aa  426  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0846  beta-hexosaminidase  63.28 
 
 		 343 aa  424  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0495446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0418  Beta-N-acetylhexosaminidase  60.39 
 
 		 357 aa  424  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3056  glycoside hydrolase family 3 protein  57.73 
 
 		 352 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0655  glycosy hydrolase family protein  59.65 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448002  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2614  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.94 
 
 		 369 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3261  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.94 
 
 		 369 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0432032 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1754  Beta-N-acetylhexosaminidase  63.23 
 
 		 364 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3630  glycoside hydrolase family protein  56.56 
 
 		 352 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2346  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.82 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5256  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.59 
 
 		 363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.973302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  55.89 
 
 		 349 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1407  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.92 
 
 		 368 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0593  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.46 
 
 		 367 aa  349  4e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  61.26 
 
 		 543 aa  345  5e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  54.22 
 
 		 359 aa  337  9.999999999999999e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  51.8 
 
 		 349 aa  335  5.999999999999999e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  57.63 
 
 		 381 aa  321  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1243  Beta-N-acetylhexosaminidase  58.48 
 
 		 347 aa  311  7.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2034  beta-hexosaminidase  51.03 
 
 		 339 aa  308  9e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.362016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2401  beta-hexosaminidase  48.02 
 
 		 341 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000799068  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1807  beta-hexosaminidase  52.01 
 
 		 337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  0.0404034 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  50 
 
 		 347 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1945  beta-hexosaminidase  49.84 
 
 		 337 aa  299  5e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1539  beta-hexosaminidase  48.52 
 
 		 355 aa  298  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107932  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  44.35 
 
 		 344 aa  295  8e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50.16 
 
 		 362 aa  294  1e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2293  beta-hexosaminidase  53.57 
 
 		 342 aa  294  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.610564  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2250  beta-hexosaminidase  53.21 
 
 		 342 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1726  beta-hexosaminidase  52.86 
 
 		 342 aa  290  3e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1805  beta-hexosaminidase  53.57 
 
 		 342 aa  290  3e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1626  beta-hexosaminidase  48.35 
 
 		 333 aa  289  4e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974733  normal  0.195617 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1326  beta-hexosaminidase  51.55 
 
 		 341 aa  288  9e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  47.34 
 
 		 336 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  48.73 
 
 		 357 aa  288  1e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2837  beta-hexosaminidase  50.34 
 
 		 333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0312091  hitchhiker  0.000147131 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  48.22 
 
 		 336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1716  beta-hexosaminidase  50 
 
 		 332 aa  286  4e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  47.01 
 
 		 341 aa  286  5e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  47.63 
 
 		 336 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  47.49 
 
 		 332 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2170  beta-hexosaminidase  52.86 
 
 		 342 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  47.04 
 
 		 336 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  51.79 
 
 		 336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  49.37 
 
 		 356 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  47.63 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  47.79 
 
 		 336 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.27 
 
 		 348 aa  281  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.63 
 
 		 346 aa  280  3e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0308  beta-hexosaminidase  45.61 
 
 		 360 aa  280  3e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.446956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  46.75 
 
 		 336 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  51.07 
 
 		 360 aa  278  9e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  48.82 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  48.21 
 
 		 356 aa  275  6e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  47.08 
 
 		 348 aa  271  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1984  beta-hexosaminidase  46.48 
 
 		 334 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.132331  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2794  beta-hexosaminidase  48.03 
 
 		 342 aa  266  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1637  beta-hexosaminidase  48.68 
 
 		 365 aa  266  5e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0105017  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02440  beta-hexosaminidase  49.06 
 
 		 340 aa  265  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2488  beta-hexosaminidase  48.47 
 
 		 342 aa  263  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2416  beta-hexosaminidase  52.5 
 
 		 342 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2523  beta-hexosaminidase  52.5 
 
 		 342 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.352424  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2405  beta-hexosaminidase  52.5 
 
 		 342 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.842865  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1943  beta-hexosaminidase  52.14 
 
 		 342 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.531769  normal  0.491355 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1987  glycoside hydrolase family 3 protein  46.96 
 
 		 337 aa  259  7e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.428635 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.34 
 
 		 341 aa  258  9e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  45.34 
 
 		 341 aa  258  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2216  beta-hexosaminidase  45.34 
 
 		 341 aa  258  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.350801  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  45.02 
 
 		 341 aa  257  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  45.34 
 
 		 341 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  45.34 
 
 		 341 aa  257  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  45.34 
 
 		 341 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  45.07 
 
 		 313 aa  257  2e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  45.34 
 
 		 341 aa  257  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1924  beta-hexosaminidase  44.18 
 
 		 339 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807084  hitchhiker  0.0000306127 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  45.02 
 
 		 341 aa  256  5e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0853  beta-hexosaminidase  44.74 
 
 		 313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457661  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1132  beta-hexosaminidase  41 
 
 		 351 aa  252  7e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00323913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>